243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0877 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_0877  Pyrrolo-quinoline quinone  100 
 
 		 797 aa  1640    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1550  Pyrrolo-quinoline quinone  44.03 
 
 		 809 aa  588  1e-166  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.183569  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1964  Pyrrolo-quinoline quinone  34.88 
 
 		 834 aa  362  2e-98  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00278286  hitchhiker  0.000521306 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  46.08 
 
 		 1969 aa  316  9.999999999999999e-85  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  46.08 
 
 		 2036 aa  315  1.9999999999999998e-84  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3733  hypothetical protein  39.72 
 
 		 1067 aa  311  2e-83  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.422005  normal  0.383912 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  40.55 
 
 		 2272 aa  303  6.000000000000001e-81  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1798  cell surface protein  45.14 
 
 		 1300 aa  298  3e-79  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1794  cell surface protein  40.66 
 
 		 1328 aa  286  1.0000000000000001e-75  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.193749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1989  cell surface protein  40.46 
 
 		 1241 aa  282  1e-74  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.565549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1962  Ig domain protein group 2 domain protein  38.99 
 
 		 556 aa  266  1e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0577426  normal  0.0531798 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1796  outer membrane protein  40.67 
 
 		 497 aa  254  4.0000000000000004e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000000580169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1991  cell surface protein  39.58 
 
 		 1311 aa  246  9.999999999999999e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.995987 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1549  Pyrrolo-quinoline quinone  31.01 
 
 		 656 aa  194  7e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.259742  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1963  S-layer domain protein  27.85 
 
 		 1009 aa  153  1e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000481253  normal  0.0221131 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  32.71 
 
 		 1842 aa  145  3e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1799  hypothetical protein  30.82 
 
 		 635 aa  139  2e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1992  hypothetical protein  31 
 
 		 612 aa  139  2e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1801  hypothetical protein  28.42 
 
 		 626 aa  130  6e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.204722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3735  cell surface protein  27.87 
 
 		 430 aa  120  7e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.271044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0878  cobaltochelatase  29.97 
 
 		 1812 aa  117  1.0000000000000001e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0677  Pyrrolo-quinoline quinone  30.83 
 
 		 431 aa  109  2e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.350335  normal  0.177219 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1960  Pyrrolo-quinoline quinone  24.71 
 
 		 484 aa  107  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000174419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3730  serine/threonine protein kinase  26.75 
 
 		 687 aa  94.4  7e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00433941 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1990  Pyrrolo-quinoline quinone  26.8 
 
 		 463 aa  93.6  1e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0609  Pyrrolo-quinoline quinone  31.33 
 
 		 352 aa  92.4  3e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.471438  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4167  Pyrrolo-quinoline quinone  27.59 
 
 		 432 aa  89  4e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2941  Pyrrolo-quinoline quinone  24.87 
 
 		 396 aa  88.6  4e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.324041  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4041  serine/threonine protein kinase  26.59 
 
 		 774 aa  87.4  9e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.224391  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2164  serine/threonine protein kinase  25.68 
 
 		 652 aa  83.2  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.563698  hitchhiker  0.00000786383 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3290  serine/threonine protein kinase  28.37 
 
 		 963 aa  82  0.00000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0556916 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1643  Pyrrolo-quinoline quinone  28.68 
 
 		 457 aa  81.6  0.00000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1465  protein kinase  27.59 
 
 		 653 aa  80.9  0.00000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.355835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0262  Pyrrolo-quinoline quinone  23.3 
 
 		 407 aa  80.9  0.00000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2189  Pyrrolo-quinoline quinone  28.52 
 
 		 484 aa  80.5  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.718843 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3300  serine/threonine protein kinase  29.68 
 
 		 795 aa  80.5  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2694  Pyrrolo-quinoline quinone  28.17 
 
 		 450 aa  80.5  0.0000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00958514  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3898  Pyrrolo-quinoline quinone  27.24 
 
 		 423 aa  79.7  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.122997  normal  0.375271 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3526  Pyrrolo-quinoline quinone  26.28 
 
 		 514 aa  79.7  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.103878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6658  metallophosphoesterase  27.57 
 
 		 616 aa  79  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.492609 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1455  Pyrrolo-quinoline quinone  27.19 
 
 		 1454 aa  77.8  0.0000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1041  PQQ repeat-containing protein  28.35 
 
 		 371 aa  76.3  0.000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.331576  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_911  PQQ enzyme repeat domain protein  28.35 
 
 		 371 aa  76.3  0.000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00179441  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3012  Pyrrolo-quinoline quinone  28.14 
 
 		 382 aa  75.9  0.000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.345618  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4514  Pyrrolo-quinoline quinone  26.33 
 
 		 445 aa  75.9  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5123  Pyrrolo-quinoline quinone  28.1 
 
 		 475 aa  74.7  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.513174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0697  Pyrrolo-quinoline quinone  25.38 
 
 		 415 aa  74.7  0.000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1114  Pyrrolo-quinoline quinone  26.24 
 
 		 374 aa  73.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0348875  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  27.18 
 
 		 2122 aa  72.8  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3251  serine/threonine protein kinase  22.76 
 
 		 861 aa  72  0.00000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0225262 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0893  Pyrrolo-quinoline quinone  26.27 
 
 		 645 aa  67.8  0.0000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  26.79 
 
 		 1682 aa  67.4  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1091  Pyrrolo-quinoline quinone  26.73 
 
 		 402 aa  66.2  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1593  metallophosphoesterase  24 
 
 		 611 aa  65.1  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.245606 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2473  Pyrrolo-quinoline quinone  24.43 
 
 		 455 aa  64.3  0.000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0210  Pyrrolo-quinoline quinone  25 
 
 		 397 aa  63.9  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3085  Pyrrolo-quinoline quinone  26.6 
 
 		 455 aa  63.5  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00761305  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0030  Pyrrolo-quinoline quinone  22.32 
 
 		 499 aa  63.2  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.951716  normal  0.123126 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0029  tetrathionate hydrolase  22.32 
 
 		 499 aa  63.2  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0923  Pyrrolo-quinoline quinone  26.19 
 
 		 371 aa  63.5  0.00000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00190176  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0513  Pyrrolo-quinoline quinone  24.33 
 
 		 422 aa  62.4  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1202  Pyrrolo-quinoline quinone  27.73 
 
 		 458 aa  62.4  0.00000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.549176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1270  Pyrrolo-quinoline quinone  24.93 
 
 		 426 aa  62.4  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.48567  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1384  Pyrrolo-quinoline quinone  22.51 
 
 		 612 aa  62  0.00000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.868816  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1119  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  21.24 
 
 		 411 aa  62.4  0.00000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0851  Pyrrolo-quinoline quinone  26.06 
 
 		 558 aa  61.6  0.00000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1499  hypothetical protein  22.07 
 
 		 384 aa  61.2  0.00000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1484  hypothetical protein  21.74 
 
 		 384 aa  61.2  0.00000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0659  Pyrrolo-quinoline quinone  27.94 
 
 		 322 aa  61.2  0.00000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3412  Pyrrolo-quinoline quinone  24.74 
 
 		 402 aa  61.2  0.00000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1121  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.53 
 
 		 393 aa  60.8  0.00000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2251  PQQ enzyme repeat domain protein  23.41 
 
 		 395 aa  60.5  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1899  Pyrrolo-quinoline quinone  23.41 
 
 		 395 aa  60.5  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.70821 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0401  Pyrrolo-quinoline quinone  26.33 
 
 		 469 aa  60.8  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.448913  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1305  Pyrrolo-quinoline quinone  32.67 
 
 		 324 aa  60.5  0.0000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.551369  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3736  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  22.92 
 
 		 392 aa  59.7  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.550553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0499  Pyrrolo-quinoline quinone  30.56 
 
 		 439 aa  59.3  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3011  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.48 
 
 		 393 aa  58.9  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2056  Pyrrolo-quinoline quinone  23.61 
 
 		 705 aa  58.9  0.0000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.9756  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05630  FOG: WD40-like repeat  24.68 
 
 		 475 aa  58.5  0.0000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.687981  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3006  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  22.8 
 
 		 392 aa  58.2  0.0000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.901484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1661  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  23.99 
 
 		 402 aa  58.5  0.0000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.274941 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3622  Pyrrolo-quinoline quinone  20.13 
 
 		 422 aa  58.2  0.0000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02404  protein assembly complex, lipoprotein component  22.64 
 
 		 392 aa  57.8  0.0000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.005806  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2663  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  22.64 
 
 		 392 aa  57.8  0.0000008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000327746  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02366  hypothetical protein  22.64 
 
 		 392 aa  57.8  0.0000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0111233  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2796  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  22.64 
 
 		 392 aa  57.8  0.0000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000117492  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1165  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  22.64 
 
 		 392 aa  57.8  0.0000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.035422  normal  0.0264667 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2664  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  23.36 
 
 		 392 aa  57.8  0.0000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.280231 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1156  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  22.32 
 
 		 392 aa  57.4  0.0000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00537914  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2714  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  22.36 
 
 		 392 aa  57  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.359129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2777  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  22.36 
 
 		 392 aa  57  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.985011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004346  YfgL protein  28.12 
 
 		 386 aa  57  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1595  putative alcohol dehydrogenase  29.71 
 
 		 561 aa  57  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2671  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  22.36 
 
 		 392 aa  57  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2758  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  22.36 
 
 		 392 aa  57  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.267883 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3214  Pyrrolo-quinoline quinone  27.47 
 
 		 349 aa  55.5  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000613548  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0804  Pyrrolo-quinoline quinone  22.95 
 
 		 536 aa  55.8  0.000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1261  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  23.28 
 
 		 393 aa  56.2  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.21096  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02978  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  31.37 
 
 		 402 aa  55.8  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.373211  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>