19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0875 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_0875  hypothetical protein  100 
 
 
235 aa  474  1e-133  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.141627  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1746  hypothetical protein  43.75 
 
 
243 aa  214  1e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.484856 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1464  hypothetical protein  41.42 
 
 
243 aa  200  1e-50  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0972302  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0402  hypothetical protein  41.91 
 
 
244 aa  186  3e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.156853  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2270  hypothetical protein  41.56 
 
 
250 aa  185  6e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.639645  normal  0.120252 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0610  hypothetical protein  41.18 
 
 
241 aa  182  5e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.494151  normal  0.0213436 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0151  protein of unknown function DUF549  40.76 
 
 
243 aa  164  9e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.478263  normal  0.0288221 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0759  hypothetical protein  44.56 
 
 
240 aa  150  1e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.262014  normal  0.526798 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5797  tRNA(His)-5'-guanylyltransferase  27.95 
 
 
255 aa  97.1  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1513  protein of unknown function DUF549  32.96 
 
 
258 aa  95.1  9e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.221061  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4049  hypothetical protein  28.28 
 
 
252 aa  89.7  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0070  hypothetical protein  31.25 
 
 
225 aa  72.8  4e-12  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.979925 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0105  hypothetical protein  38.61 
 
 
196 aa  64.3  1e-09  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.612279  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02800  tRNA guanylyltransferase, putative  27.98 
 
 
285 aa  64.7  1e-09  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0097  hypothetical protein  38.61 
 
 
212 aa  61.6  9e-09  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0393817  hitchhiker  0.0023307 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1144  hypothetical protein  36.63 
 
 
212 aa  60.5  2e-08  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  3.78102e-12 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2087  hypothetical protein  25.23 
 
 
241 aa  58.5  8e-08  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  5.12011e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60761  predicted protein  27.08 
 
 
268 aa  52.4  6e-06  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0820783  normal  0.624062 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4028  hypothetical protein  28.47 
 
 
238 aa  48.5  9e-05  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00510799 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>