More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0872 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  100 
 
 		 382 aa  776    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  58.22 
 
 		 392 aa  480  1e-134  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  60.16 
 
 		 392 aa  469  1.0000000000000001e-131  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  60.79 
 
 		 394 aa  462  1e-129  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000384465  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3201  cysteine desulphurase  60.16 
 
 		 396 aa  460  9.999999999999999e-129  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.11568  normal  0.0184494 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2274  cysteine desulfurase NifS  58.59 
 
 		 402 aa  461  9.999999999999999e-129  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.363972  hitchhiker  0.00000604426 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0173  aminotransferase class V  59.21 
 
 		 382 aa  460  9.999999999999999e-129  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0720  aminotransferase, class V  59.16 
 
 		 394 aa  457  1e-127  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00090765  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0719  cysteine desulfurase NifS  59.53 
 
 		 394 aa  455  1e-127  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  57.96 
 
 		 384 aa  457  1e-127  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0764  aminotransferase, class V  58.85 
 
 		 414 aa  453  1.0000000000000001e-126  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561511  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2431  aminotransferase, class V  61.1 
 
 		 390 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  57.18 
 
 		 384 aa  451  1.0000000000000001e-126  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1914  aminotransferase, class V  56.54 
 
 		 399 aa  443  1e-123  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  56.88 
 
 		 400 aa  439  9.999999999999999e-123  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0266  hypothetical protein  56.05 
 
 		 393 aa  434  1e-121  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.423514  normal  0.267621 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2213  aminotransferase, class V  58.38 
 
 		 398 aa  437  1e-121  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0423  cysteine desulfurase NifS  55.26 
 
 		 403 aa  434  1e-120  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0763464  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2125  aminotransferase, class V  55.76 
 
 		 398 aa  434  1e-120  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1837  cysteine desulfurase NifS  55.5 
 
 		 396 aa  428  1e-119  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0935929 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2424  cysteine desulphurase  54.97 
 
 		 404 aa  428  1e-119  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08880  aminotransferase class V  58.03 
 
 		 392 aa  425  1e-118  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.80371e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1932  cysteine desulfurase NifS  55.76 
 
 		 393 aa  426  1e-118  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000108248  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0207  cysteine desulfurase NifS  54.43 
 
 		 388 aa  426  1e-118  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000531678  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3884  aminotransferase class V  53.93 
 
 		 398 aa  422  1e-117  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00981578  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1860  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  52.76 
 
 		 396 aa  412  1e-114  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140569  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2907  cysteine desulfurase NifS  52.62 
 
 		 398 aa  410  1e-113  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000201074  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0484  aminotransferase, class V  54.95 
 
 		 417 aa  404  1e-111  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0750137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2039  cysteine desulfurase  52.34 
 
 		 398 aa  402  1e-111  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1755  cysteine desulfurase  52.34 
 
 		 398 aa  402  1e-111  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00778501  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1343  aminotransferase class V  52.88 
 
 		 389 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1344  aminotransferase class V  50.13 
 
 		 406 aa  396  1e-109  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0168  aminotransferase, class V  53.35 
 
 		 409 aa  397  1e-109  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.925051 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1075  cysteine desulfurase NifS  51.56 
 
 		 384 aa  391  1e-108  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2275  aminotransferase, class V  51.05 
 
 		 386 aa  393  1e-108  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0884  cysteine desulfurase IscS  52.74 
 
 		 405 aa  388  1e-107  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.293282  normal  0.187166 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0949  cysteine desulfurase IscS  52.74 
 
 		 405 aa  388  1e-107  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0399375 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1493  aminotransferase, class V  50.93 
 
 		 379 aa  389  1e-107  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0268467  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3079  cysteine desulfurase  51.7 
 
 		 396 aa  389  1e-107  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4262  aminotransferase class V  54.2 
 
 		 395 aa  389  1e-107  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.907816 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1019  pyridoxal-phosphate-dependent aminotransferase (NIFS protein)  51.96 
 
 		 405 aa  385  1e-106  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.103423  normal  0.217288 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2655  cysteine desulfurase  52.48 
 
 		 407 aa  387  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2599  cysteine desulfurase  52.22 
 
 		 407 aa  385  1e-106  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.129174  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2733  cysteine desulfurase  52.22 
 
 		 407 aa  386  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1563  cysteine desulfurase IscS  51.04 
 
 		 403 aa  385  1e-106  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.353864 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2412  cysteine desulfurase IscS  52.21 
 
 		 403 aa  385  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2579  cysteine desulfurase  52.74 
 
 		 407 aa  387  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.120053  hitchhiker  0.000683499 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1553  cysteine desulfurase  52.74 
 
 		 407 aa  388  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0484493  normal  0.0430953 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0341  cysteine desulfurase  48.28 
 
 		 388 aa  386  1e-106  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2659  cysteine desulfurase NifS  51.17 
 
 		 404 aa  385  1e-106  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.614192 
 
 
-
 
NC_002936  DET0248  cysteine desulfurase  51.21 
 
 		 383 aa  383  1e-105  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0166722  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1458  cysteine desulfurase  51.7 
 
 		 407 aa  381  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1708  cysteine desulfurase  52.22 
 
 		 407 aa  383  1e-105  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_45194  predicted protein  53.44 
 
 		 395 aa  383  1e-105  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0622302  normal  0.609433 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1058  cysteine desulfurase  51.96 
 
 		 405 aa  384  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0834623  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1489  cysteine desulfurase  52.22 
 
 		 407 aa  383  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.71249  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_70  aminotransferase, class V  50.94 
 
 		 383 aa  384  1e-105  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2143  cysteine desulfurase  51.96 
 
 		 407 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.950908 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5432  cysteine desulfurase  51.96 
 
 		 407 aa  383  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.116144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1875  cysteine desulfurase  52.22 
 
 		 407 aa  384  1e-105  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.795233  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0592  cysteine desulfurase  55.09 
 
 		 404 aa  383  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4665  cysteine desulfurase IscS  51.95 
 
 		 436 aa  381  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5951  cysteine desulfurase  51.96 
 
 		 407 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.350283  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3103  cysteine desulfurase  52.22 
 
 		 407 aa  383  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.412431  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0281  cysteine desulfurase  52.47 
 
 		 404 aa  383  1e-105  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.910551  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0627  cysteine desulfurase  54.83 
 
 		 404 aa  382  1e-105  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1144  cysteine desulfurase  52.22 
 
 		 407 aa  384  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.282524  normal  0.237339 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2163  cysteine desulfurase  51.96 
 
 		 407 aa  383  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.675105  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2126  cysteine desulfurase  51.96 
 
 		 407 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3698  cysteine desulfurase IscS  51.95 
 
 		 436 aa  381  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.789582  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2036  cysteine desulfurase  51.96 
 
 		 407 aa  383  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.639443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2217  cysteine desulfurase  52.22 
 
 		 407 aa  383  1e-105  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2905  cysteine desulfurase  51.95 
 
 		 404 aa  378  1e-104  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0404853  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02422  cysteine desulfurase  51.95 
 
 		 404 aa  378  1e-104  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.657115  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1138  cysteine desulfurase IscS  51.95 
 
 		 404 aa  378  1e-104  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02386  hypothetical protein  51.95 
 
 		 404 aa  378  1e-104  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.730969  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6331  cysteine desulfurase IscS  52.99 
 
 		 405 aa  381  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.134755  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2681  cysteine desulfurase  51.95 
 
 		 404 aa  378  1e-104  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.174524  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3762  cysteine desulfurase  51.95 
 
 		 404 aa  378  1e-104  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00149492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2178  cysteine desulfurase IscS  51.17 
 
 		 405 aa  380  1e-104  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000963732  normal  0.389244 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2683  cysteine desulfurase  51.95 
 
 		 404 aa  378  1e-104  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.980146  normal  0.976252 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3823  cysteine desulfurase IscS  51.95 
 
 		 403 aa  381  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.474065 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1147  cysteine desulfurase  51.95 
 
 		 404 aa  378  1e-104  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0105086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1025  cysteine desulfurase  51.96 
 
 		 406 aa  379  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00998384  normal  0.30784 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2815  cysteine desulfurase  51.95 
 
 		 404 aa  378  1e-104  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00976282  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2290  cysteine desulfurase IscS  51.7 
 
 		 405 aa  379  1e-104  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00326388  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3031  cysteine desulfurase  51.17 
 
 		 404 aa  379  1e-104  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.563846  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0618  cysteine desulfurase  54.57 
 
 		 404 aa  379  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2751  cysteine desulfurase  51.43 
 
 		 404 aa  375  1e-103  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.173578  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2805  cysteine desulfurase  51.17 
 
 		 404 aa  376  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1244  cysteine desulfurase  51.43 
 
 		 404 aa  375  1e-103  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.560354  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2783  cysteine desulfurase  51.17 
 
 		 404 aa  376  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0158517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2917  cysteine desulfurase  51.17 
 
 		 404 aa  376  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2742  cysteine desulfurase  51.17 
 
 		 404 aa  376  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.46384  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2177  cysteine desulfurase IscS  51.44 
 
 		 430 aa  375  1e-103  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00159504  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2698  cysteine desulfurase  51.17 
 
 		 404 aa  376  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.016381  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4044  aminotransferase, class V  50.92 
 
 		 389 aa  377  1e-103  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.159236 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1299  cysteine desulfurase  51.43 
 
 		 404 aa  375  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0382772  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14730  cysteine desulfurase  51.43 
 
 		 404 aa  375  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.179473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0229  Cysteine desulfurase  49.48 
 
 		 405 aa  378  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>