More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0836 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_0836  periplasmic binding protein  100 
 
 
397 aa  809  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.00603144  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2098  periplasmic binding protein  33.33 
 
 
402 aa  205  9e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1597  periplasmic binding protein  31.83 
 
 
409 aa  166  5e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.465677  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1042  periplasmic binding protein  30.77 
 
 
354 aa  140  5e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1185  periplasmic binding protein  29.91 
 
 
354 aa  137  2e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.306422  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1216  copper amine oxidase domain-containing protein  29.29 
 
 
478 aa  135  1e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  6.73824e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1644  copper amine oxidase domain protein  29.5 
 
 
483 aa  130  3e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0382967  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0528  periplasmic binding protein  30.59 
 
 
361 aa  127  3e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.147263  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1593  periplasmic binding protein  29.09 
 
 
372 aa  122  1e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0653353  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0444  periplasmic binding protein  30.95 
 
 
356 aa  121  2e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2396  iron(III) ABC transporter, solute-binding protein  26.57 
 
 
375 aa  117  3e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.507465 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1321  periplasmic binding protein  28 
 
 
366 aa  115  1e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.77394  normal  0.0125945 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1218  periplasmic binding protein  30.38 
 
 
358 aa  113  5e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0017043  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1591  periplasmic binding protein  27.06 
 
 
377 aa  112  1e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0970823  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2617  periplasmic binding protein  25.29 
 
 
380 aa  111  2e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0286  periplasmic binding protein  25.16 
 
 
338 aa  110  5e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.234357  normal  0.193996 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1314  periplasmic binding protein  27.89 
 
 
380 aa  109  9e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0394754 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1596  periplasmic binding protein  29.51 
 
 
339 aa  108  1e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.691704  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0972  periplasmic binding protein  25.57 
 
 
429 aa  108  2e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1645  periplasmic binding protein  21.43 
 
 
354 aa  107  3e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.399451  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0024  periplasmic binding protein  28.74 
 
 
360 aa  105  2e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0029  periplasmic binding protein  26.74 
 
 
361 aa  103  6e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0547  periplasmic binding protein  26.28 
 
 
359 aa  97.8  3e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1151  hypothetical protein  25.53 
 
 
333 aa  97.1  5e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2363  periplasmic binding protein  29.07 
 
 
289 aa  96.3  8e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2734  periplasmic binding protein  28.61 
 
 
363 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.148787  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0435  periplasmic binding protein  27 
 
 
362 aa  95.1  2e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  2.78634e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5522  periplasmic binding protein  30.83 
 
 
361 aa  95.5  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.979273  normal  0.0605852 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0025  periplasmic binding protein  27.27 
 
 
289 aa  94  4e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1598  periplasmic binding protein  28.32 
 
 
369 aa  94  5e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.796704  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0185  periplasmic binding protein  23.78 
 
 
426 aa  92.8  8e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0952847  normal  0.560438 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1316  periplasmic binding protein  24.23 
 
 
390 aa  90.9  4e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.867732  normal  0.0135564 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2140  periplasmic binding protein  25.85 
 
 
394 aa  87  5e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.07383  normal  0.925288 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2735  putative iron complex transport system substrate-binding protein  25.18 
 
 
427 aa  87  5e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0180927  decreased coverage  6.09348e-05 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0417  periplasmic binding protein  29.17 
 
 
346 aa  85.5  1e-15  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0407983 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1220  ABC transporter substrate binding protein (iron)  26.24 
 
 
383 aa  85.5  1e-15  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0484482  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2225  periplasmic binding protein  23.68 
 
 
348 aa  85.5  2e-15  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.31713e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2249  periplasmic binding protein  24.72 
 
 
378 aa  85.1  2e-15  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.254495 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0025  FMN-binding domain protein  25.68 
 
 
517 aa  83.6  6e-15  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0500  ABC Fe3+-siderophore transporter, substrate binding subunit  25.07 
 
 
362 aa  82.8  1e-14  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0448  periplasmic binding protein  26.48 
 
 
345 aa  82.4  1e-14  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0352349  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3033  periplasmic binding protein  27.47 
 
 
345 aa  82  2e-14  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2027  periplasmic binding protein  24.65 
 
 
378 aa  81.3  3e-14  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.683361  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1934  periplasmic binding protein  25.93 
 
 
315 aa  80.5  4e-14  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1419  periplasmic binding protein  25.07 
 
 
375 aa  79  1e-13  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.364808  normal  0.918075 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0428  periplasmic binding protein  23.3 
 
 
375 aa  78.6  2e-13  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1995  periplasmic binding protein  25.66 
 
 
360 aa  78.2  2e-13  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.203895 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2468  periplasmic binding protein  27.36 
 
 
328 aa  78.6  2e-13  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.208513  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0219  periplasmic binding protein  24.55 
 
 
370 aa  77.8  3e-13  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.293771  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2264  iron(III) ABC transporter, solute-binding protein  24.56 
 
 
362 aa  77.8  3e-13  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0217447  normal  0.506008 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1673  ferrichrome-binding periplasmic protein  23.53 
 
 
353 aa  77.4  4e-13  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.723004  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3089  periplasmic binding protein  23.48 
 
 
375 aa  76.6  7e-13  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1285  periplasmic binding protein  24.09 
 
 
346 aa  76.3  8e-13  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0296  periplasmic binding protein  24.92 
 
 
315 aa  75.5  1e-12  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.143105  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3249  periplasmic binding protein  26.56 
 
 
322 aa  75.9  1e-12  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  3.6127e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1547  ligand binding protein  24.24 
 
 
363 aa  75.9  1e-12  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3842  periplasmic binding protein  27.78 
 
 
349 aa  74.7  2e-12  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.294669  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0467  Fe(III) dicitrate ABC transporter, permease  23.48 
 
 
384 aa  75.1  2e-12  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0620  periplasmic binding protein  24.09 
 
 
337 aa  74.7  3e-12  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  2.16594e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1015  periplasmic binding protein  25 
 
 
371 aa  74.7  3e-12  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.543354 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3141  periplasmic binding protein  24.29 
 
 
371 aa  74.3  4e-12  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0248  periplasmic binding protein  24.85 
 
 
375 aa  73.9  5e-12  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0774691  normal  0.65467 
 
 
-
 
NC_002936  DET0684  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system, periplasmic binding protein, putative  24.5 
 
 
338 aa  73.6  6e-12  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0151926  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0650  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, periplasmic binding protein, putative  24.5 
 
 
338 aa  73.6  6e-12  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000661971  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2271  iron(III) ABC transporter, solute-binding protein  25.6 
 
 
393 aa  73.2  7e-12  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.79737  normal  0.104601 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4418  periplasmic binding protein  26.3 
 
 
377 aa  73.2  7e-12  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.468441 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_588  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, periplasmic component  24.01 
 
 
338 aa  73.2  8e-12  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  3.78985e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2097  periplasmic binding protein  24.56 
 
 
376 aa  72.4  1e-11  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.328694  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2212  periplasmic binding protein  22.77 
 
 
318 aa  72.4  1e-11  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3079  periplasmic binding protein  25.66 
 
 
291 aa  72.4  1e-11  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.498127  normal  0.441233 
 
 
-
 
NC_002936  DET0250  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein, putative  26.58 
 
 
356 aa  72  2e-11  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0491648  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1754  periplasmic binding protein  22.88 
 
 
318 aa  71.6  2e-11  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  1.28267e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2696  periplasmic binding protein  25.07 
 
 
377 aa  72  2e-11  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.773462  normal  0.636131 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1056  periplasmic binding protein  25.24 
 
 
341 aa  72  2e-11  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1422  periplasmic binding protein  21.62 
 
 
333 aa  70.9  3e-11  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.158314 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26430  Periplasmic binding protein  25.33 
 
 
360 aa  71.2  3e-11  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.0027542  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4151  periplasmic binding protein  27.78 
 
 
349 aa  71.2  3e-11  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00557597  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_68  cobalamin-binding protein  26 
 
 
517 aa  70.9  4e-11  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3531  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component-like protein  25.61 
 
 
382 aa  70.9  4e-11  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.826718  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0535  periplasmic binding protein  24.75 
 
 
314 aa  70.9  4e-11  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0373  periplasmic binding protein  24.05 
 
 
723 aa  70.5  5e-11  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.390993 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1691  periplasmic binding protein  24.12 
 
 
353 aa  70.5  5e-11  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000252356  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1286  ABC transporter, solute-binding protein  22.11 
 
 
370 aa  70.5  5e-11  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2480  periplasmic binding protein  27.13 
 
 
350 aa  70.1  6e-11  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.388226 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0560  periplasmic binding protein  23.03 
 
 
339 aa  70.1  6e-11  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0283  periplasmic binding protein  25.19 
 
 
383 aa  70.1  7e-11  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.996344  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0513  ABC transporter, solute-binding protein  20.9 
 
 
365 aa  70.1  7e-11  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1559  iron chelatin ABC transporter, substrate binding protein  23.17 
 
 
337 aa  69.7  8e-11  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.307142  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2263  iron(III) ABC transporter, solute-binding protein  22.89 
 
 
360 aa  69.3  1e-10  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.128024  normal  0.494414 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0726  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  25.31 
 
 
304 aa  68.9  1e-10  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.19297  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1747  periplasmic binding protein  21.6 
 
 
334 aa  69.3  1e-10  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1690  periplasmic binding protein  23.66 
 
 
366 aa  68.2  2e-10  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00951352  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4299  periplasmic binding protein  26.85 
 
 
345 aa  68.6  2e-10  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1093  V-type ATPase, 116 kDa subunit  24.63 
 
 
376 aa  68.6  2e-10  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1317  periplasmic binding protein  22.8 
 
 
307 aa  68.6  2e-10  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0153  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  28.36 
 
 
357 aa  68.6  2e-10  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.661173  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1534  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.92 
 
 
351 aa  68.6  2e-10  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  3.74232e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1097  periplasmic binding protein  25.56 
 
 
373 aa  67.8  3e-10  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.508447  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0555  periplasmic binding protein  23.43 
 
 
317 aa  67.4  4e-10  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0231  periplasmic binding protein  23.75 
 
 
723 aa  67.4  4e-10  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.999715  normal  0.640564 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>