49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0764 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_0764  phosphotransferase domain-containing protein  100 
 
 
401 aa  825    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.311457  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1399  PHP-like protein  53.4 
 
 
409 aa  428  1e-119  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1564  hypothetical protein  53.98 
 
 
457 aa  422  1e-117  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1094  phosphotransferase domain-containing protein  44.62 
 
 
394 aa  330  3e-89  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0508566  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0852  phosphotransferase domain-containing protein  44.62 
 
 
394 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.017726  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1581  phosphotransferase domain-containing protein  44.62 
 
 
394 aa  325  8.000000000000001e-88  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.647284  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1107  phosphotransferase domain-containing protein  42.89 
 
 
393 aa  323  2e-87  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1319  phosphotransferase domain-containing protein  40.77 
 
 
424 aa  311  9e-84  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0960  PHP domain protein  44.68 
 
 
372 aa  291  1e-77  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.131519  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1296  TPR repeat-containing protein  43.52 
 
 
373 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.51711 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1948  phosphotransferase domain-containing protein  42.38 
 
 
396 aa  283  4.0000000000000003e-75  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1125  PHP-like  42.24 
 
 
380 aa  281  1e-74  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.964414  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0317  UvrD/REP helicase  36.53 
 
 
1032 aa  211  2e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.907606  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1268  PHP domain protein  35.1 
 
 
414 aa  205  1e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.128961  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3223  UvrD/REP helicase  34.71 
 
 
1075 aa  204  3e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.124845 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0167  UvrD/REP helicase  35.25 
 
 
1161 aa  201  1.9999999999999998e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1422  UvrD/REP helicase  35.06 
 
 
1089 aa  197  4.0000000000000005e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3266  DNA helicase II, putative  34.86 
 
 
1078 aa  196  5.000000000000001e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7469  ATP-dependent DNA helicase  34.42 
 
 
428 aa  194  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.747593 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0254  UvrD/REP helicase  32.25 
 
 
1232 aa  194  3e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.764036  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3499  ATP-dependent DNA helicase UvrD  33.64 
 
 
1089 aa  194  3e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2545  hypothetical protein  33.57 
 
 
408 aa  191  2e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000698733  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1328  hypothetical protein  33.9 
 
 
411 aa  191  2e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000106195  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0634  UvrD/REP helicase  33.18 
 
 
1001 aa  191  2e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1930  UvrD/REP helicase  32.72 
 
 
1082 aa  184  3e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00120508  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2955  hypothetical protein  33.98 
 
 
411 aa  184  3e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06840  conserved hypothetical protein TIGR00375  31.85 
 
 
392 aa  182  8.000000000000001e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5049  UvrD/REP helicase  32.78 
 
 
1062 aa  182  9.000000000000001e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0107382 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1553  hypothetical protein  33.33 
 
 
390 aa  182  9.000000000000001e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3587  UvrD/REP helicase  34.61 
 
 
446 aa  182  1e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000249291  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3744  UvrD/REP helicase  33.65 
 
 
1124 aa  179  8e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.183659  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2878  DNA and RNA helicase  33.1 
 
 
1050 aa  176  7e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.015904  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0632  hypothetical protein  30.02 
 
 
414 aa  174  1.9999999999999998e-42  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1758  UvrD/REP helicase  31.12 
 
 
1244 aa  169  9e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0022  UvrD/REP helicase  32.02 
 
 
1174 aa  168  2e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3121  UvrD/REP helicase  31.34 
 
 
1033 aa  166  8e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4539  UvrD/REP helicase  31.35 
 
 
1067 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1753  hypothetical protein  33.09 
 
 
386 aa  165  2.0000000000000002e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.800597  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2402  UvrD/REP helicase  31.71 
 
 
1027 aa  164  4.0000000000000004e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1171  UvrD/REP helicase  30.9 
 
 
1132 aa  162  1e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0992  UvrD/REP helicase  32.13 
 
 
1156 aa  160  4e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.175331  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0598  hypothetical protein  30.65 
 
 
392 aa  158  2e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2483  UvrD/REP helicase  30.61 
 
 
1127 aa  155  8e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2262  hypothetical protein  32.02 
 
 
387 aa  151  2e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0355  hypothetical protein  29.6 
 
 
392 aa  147  3e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1343  PHP domain protein  26.7 
 
 
381 aa  139  7e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000142692  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0363  hypothetical protein  30.69 
 
 
396 aa  139  1e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1672  hypothetical protein  27.34 
 
 
397 aa  134  1.9999999999999998e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.530783  normal  0.0149602 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3463  hypothetical protein  28.94 
 
 
387 aa  99  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0239396  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>