46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0734 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_0734  hypothetical protein  100 
 
 
55 aa  116  9.999999999999999e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.55794  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2538  hypothetical protein  63.46 
 
 
67 aa  69.3  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0131849  normal  0.465998 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2365  DNA-directed RNA polymerase I, II, and III, 7.3 kDa polypeptide  65.31 
 
 
60 aa  67  0.00000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.224904  normal  0.052764 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2096  hypothetical protein  60.87 
 
 
64 aa  66.6  0.00000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.730505  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2535  DNA-directed RNA polymerase I, II, and III, 7.3 kDa polypeptide  61.54 
 
 
73 aa  66.6  0.00000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0399003  normal  0.214675 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0190  hypothetical protein  58.49 
 
 
60 aa  66.6  0.0000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.341915  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2536  DNA-directed RNA polymerase I, II, and III, 7.3 kDa polypeptide  68.89 
 
 
68 aa  65.9  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0945683  normal  0.219403 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0345  hypothetical protein  68.29 
 
 
62 aa  66.2  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3064  hypothetical protein  54 
 
 
102 aa  63.9  0.0000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000666653  decreased coverage  0.0000000585819 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2849  hypothetical protein  63.41 
 
 
99 aa  63.2  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000349551  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2367  hypothetical protein  61.22 
 
 
62 aa  63.2  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00270625  normal  0.0564392 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4753  hypothetical protein  51.92 
 
 
97 aa  63.2  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  9.86615e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2161  hypothetical protein  61.22 
 
 
63 aa  62  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0158073  normal  0.750872 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0369  hypothetical protein  54 
 
 
106 aa  61.2  0.000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000011297  normal  0.796638 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0232  hypothetical protein  57.69 
 
 
59 aa  61.6  0.000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.939716 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0593  hypothetical protein  60 
 
 
55 aa  61.6  0.000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.791736 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2351  hypothetical protein  59.18 
 
 
63 aa  61.2  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00738797  normal  0.0104315 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0159  hypothetical protein  54.55 
 
 
106 aa  60.8  0.000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2425  hypothetical protein  60.47 
 
 
64 aa  59.7  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.989254  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0033  hypothetical protein  55.77 
 
 
55 aa  59.3  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3160  hypothetical protein  48.94 
 
 
144 aa  59.3  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000594814  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2013  hypothetical protein  50 
 
 
98 aa  58.9  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000000448055  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0657  hypothetical protein  52.08 
 
 
58 aa  58.9  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.238976  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0656  hypothetical protein  55.32 
 
 
70 aa  59.3  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.229933  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0298  hypothetical protein  62.5 
 
 
102 aa  58.9  0.00000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0150675 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0236  hypothetical protein  56.1 
 
 
96 aa  56.6  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000525985  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1830  hypothetical protein  47.92 
 
 
98 aa  55.8  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000324096  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2261  hypothetical protein  44.44 
 
 
129 aa  55.5  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0193918  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2041  hypothetical protein  48 
 
 
122 aa  55.1  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000112803  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1141  hypothetical protein  55.81 
 
 
101 aa  54.3  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000497055  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0281  hypothetical protein  46.51 
 
 
99 aa  53.9  0.0000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.62891e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3560  hypothetical protein  46.15 
 
 
128 aa  53.5  0.0000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0320162  normal  0.177975 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0442  hypothetical protein  54.55 
 
 
130 aa  53.5  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000000619685  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0416  hypothetical protein  49.02 
 
 
95 aa  52.4  0.000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00356821  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0395  hypothetical protein  51.22 
 
 
116 aa  52.4  0.000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000985967  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1946  hypothetical protein  55.26 
 
 
105 aa  52  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0158676  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_359  nucleoside diphosphate kinase  51.22 
 
 
116 aa  52.4  0.000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000000760928  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2914  hypothetical protein  46.81 
 
 
96 aa  50.4  0.000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000841625  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1757  hypothetical protein  45.24 
 
 
122 aa  49.3  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000128985  normal  0.255672 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1080  hypothetical protein  45.65 
 
 
105 aa  48.5  0.00003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000189247  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1108  hypothetical protein  45.65 
 
 
106 aa  48.5  0.00003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.019539  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1296  hypothetical protein  45.65 
 
 
105 aa  48.5  0.00003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0998728  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1492  hypothetical protein  41.86 
 
 
336 aa  48.1  0.00004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.293244 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1209  hypothetical protein  52.63 
 
 
151 aa  47  0.00009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.99637  normal  0.446055 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2436  hypothetical protein  48.65 
 
 
112 aa  44.7  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000881987  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0369  hypothetical protein  45.45 
 
 
87 aa  43.5  0.0009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000090387  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>