68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0728 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_0728  CRISPR-associated Cas4 family protein  100 
 
 
172 aa  350  6e-96  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0305  CRISPR-associated protein Cas4  37.65 
 
 
323 aa  127  1e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0536  protein of unknown function DUF83  39.64 
 
 
170 aa  119  3e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0513907  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2603  hypothetical protein  38.32 
 
 
170 aa  105  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.519513  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1816  hypothetical protein  40.82 
 
 
170 aa  104  6e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.115857  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2838  hypothetical protein  37.16 
 
 
171 aa  89  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000529444  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1015  CRISPR-associated Cas4 family protein  33.73 
 
 
186 aa  85.9  3e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1287  CRISPR-associated Cas4 family protein  30.89 
 
 
190 aa  58.9  3e-08  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.826986  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0851  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  33.67 
 
 
224 aa  58.9  3e-08  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1722  CRISPR-associated Cas4 family protein  33.33 
 
 
218 aa  56.6  1e-07  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.523221 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3305  CRISPR-associated Cas4 family protein  32.9 
 
 
198 aa  57  1e-07  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.143494  normal  0.352212 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0565  CRISPR-associated protein Cas4  30.32 
 
 
202 aa  56.6  2e-07  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.234335  normal  0.250424 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5083  CRISPR-associated Cas4 family protein  31.76 
 
 
197 aa  55.8  3e-07  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31590  CRISPR-associated protein Cas4  27.63 
 
 
199 aa  55.1  5e-07  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1872  CRISPR-associated Cas4 family protein  31.17 
 
 
198 aa  54.7  6e-07  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4175  hypothetical protein  29.41 
 
 
196 aa  53.9  9e-07  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  1.76829e-05 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0740  CRISPR-associated Cas4 family protein  32.74 
 
 
217 aa  53.9  9e-07  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.593112  normal 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4560  CRISPR-associated protein Cas4  27.73 
 
 
194 aa  53.5  1e-06  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1859  CRISPR-associated Cas4 family protein  31.93 
 
 
193 aa  52.4  3e-06  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.343722  normal  0.533704 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1661  CRISPR-associated protein Cas4  28.46 
 
 
214 aa  51.6  5e-06  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.975016  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2233  CRISPR-associated Cas4 family protein  23.13 
 
 
205 aa  51.6  5e-06  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.874224  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1975  CRISPR-associated protein Cas4  32.59 
 
 
220 aa  51.6  6e-06  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.360978  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3220  CRISPR-associated Cas4 family protein  24.39 
 
 
204 aa  51.2  7e-06  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.680334  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0793  CRISPR-associated protein Cas4  33.07 
 
 
209 aa  51.2  7e-06  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.813459  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1558  CRISPR-associated Cas4 family protein  31.45 
 
 
190 aa  50.8  8e-06  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.681932  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2433  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  28.69 
 
 
570 aa  50.1  1e-05  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0199418  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2748  hypothetical protein  31.25 
 
 
175 aa  50.8  1e-05  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.170499 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1937  hypothetical protein  31.96 
 
 
216 aa  50.4  1e-05  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.370637  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15190  CRISPR-associated protein Cas4  25.81 
 
 
198 aa  49.7  2e-05  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0605  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  29.75 
 
 
216 aa  49.7  2e-05  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.452129 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0057  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  28.69 
 
 
559 aa  49.3  2e-05  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2343  hypothetical protein  29.27 
 
 
333 aa  49.7  2e-05  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0637  CRISPR-associated Cas4 family protein  27.87 
 
 
191 aa  48.9  3e-05  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.042721  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0235  CRISPR-associated Cas4 family protein  31.34 
 
 
211 aa  48.9  3e-05  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1006  hypothetical protein  28.12 
 
 
215 aa  48.5  4e-05  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0356084  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2652  CRISPR-associated protein Cas4  28.46 
 
 
212 aa  48.1  5e-05  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0303971  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0494  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  31.15 
 
 
214 aa  47.8  8e-05  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1076  CRISPR-associated Cas4 family protein  25.81 
 
 
197 aa  47.8  8e-05  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02697  crispr-associated protein Cas4  26.28 
 
 
210 aa  47.4  9e-05  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.463213  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0163  hypothetical protein  24.17 
 
 
197 aa  47  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1299  hypothetical protein  26.61 
 
 
214 aa  46.6  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.938866  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0179  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  28.67 
 
 
580 aa  46.2  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0755  CRISPR-associated Cas4 family protein  26.92 
 
 
178 aa  46.6  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.714771  normal  0.862744 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1632  CRISPR-associated protein Cas4  27.42 
 
 
218 aa  45.4  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.98908 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0822  CRISPR-associated protein Cas4  28.93 
 
 
206 aa  45.8  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2187  CRISPR-associated protein Cas4  30.3 
 
 
223 aa  45.4  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4331  CRISPR-associated Cas4 family protein  33.75 
 
 
222 aa  45.4  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  8.54832e-05  normal  0.165932 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3577  CRISPR-associated protein Cas4  29.17 
 
 
190 aa  45.1  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0522  CRISPR-associated protein Cas4  28.1 
 
 
196 aa  45.1  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00230563  hitchhiker  1.01589e-06 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1975  CRISPR-associated protein Cas4  29.27 
 
 
255 aa  45.1  0.0005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0505  CRISPR-associated protein Cas4  28.1 
 
 
196 aa  45.1  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0774  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  23.77 
 
 
206 aa  45.1  0.0005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.356687  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2974  CRISPR-associated Cas4 family protein  29.75 
 
 
212 aa  44.7  0.0006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.948346  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1481  CRISPR-associated protein Cas4  27.84 
 
 
222 aa  44.7  0.0006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1717  CRISPR-associated protein Cas4  29.37 
 
 
200 aa  45.1  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    unclonable  2.73181e-25 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1765  CRISPR-associated protein Cas4  26.76 
 
 
189 aa  44.7  0.0007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3647  CRISPR-associated protein Cas4  30.3 
 
 
225 aa  44.3  0.0008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3523  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  30.77 
 
 
218 aa  44.3  0.0008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1142  CRISPR-associated Cas4 family protein  28.7 
 
 
190 aa  43.5  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.142818  hitchhiker  3.42837e-06 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0832  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  29.9 
 
 
228 aa  43.9  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3372  hypothetical protein  29.51 
 
 
218 aa  43.5  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1432  CRISPR-associated Cas4 family protein  26.83 
 
 
214 aa  43.9  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.343364  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0227  CRISPR-associated Cas4 family protein  21.31 
 
 
209 aa  44.3  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.279714  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1006  CRISPR-associated Cas4 family protein  28.47 
 
 
219 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1930  hypothetical protein  22.95 
 
 
272 aa  43.1  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0652  CRISPR-associated Cas4 family protein  30.16 
 
 
210 aa  43.1  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.915701  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0546  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  28.95 
 
 
213 aa  42.7  0.003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2270  CRISPR-associated protein Cas4  29.17 
 
 
201 aa  41.2  0.007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.160192  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>