158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0715 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_0715  Na+/solute symporter  100 
 
 		 1039 aa  2102    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.723376  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1502  Histidine kinase  46.69 
 
 		 919 aa  541  9.999999999999999e-153  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1429  hypothetical protein  46.02 
 
 		 910 aa  513  1e-143  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2030  histidine kinase  44.98 
 
 		 927 aa  513  1e-143  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.182465 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2045  putative GAF sensor protein  43.64 
 
 		 1079 aa  505  1e-141  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0456906  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1897  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  41.19 
 
 		 1088 aa  501  1e-140  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4149  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  43.35 
 
 		 919 aa  498  1e-139  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.315835 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1631  sensor histidine kinase  44.27 
 
 		 903 aa  491  1e-137  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.857286 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0236  histidine kinase  43.44 
 
 		 935 aa  490  1e-137  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00442274 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3779  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.19 
 
 		 920 aa  492  1e-137  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2061  Na+/solute symporter  42.16 
 
 		 671 aa  486  1e-136  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.274324 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1230  serine phosphatase  44.62 
 
 		 1100 aa  483  1e-135  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.081901 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2648  putative phytochrome sensor protein  43.29 
 
 		 1087 aa  478  1e-133  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2650  ATP-binding region ATPase domain protein  42.79 
 
 		 913 aa  479  1e-133  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.574534  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0666  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  42 
 
 		 917 aa  476  1e-132  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.220304  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1586  putative phytochrome sensor protein  43.77 
 
 		 1087 aa  474  1e-132  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0975529 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2100  putative phytochrome sensor protein  44.5 
 
 		 1082 aa  470  1.0000000000000001e-131  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.758651  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2659  serine phosphatase  40.56 
 
 		 1083 aa  464  1e-129  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.623664  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2045  histidine kinase  40.7 
 
 		 906 aa  459  9.999999999999999e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.189516  normal  0.433786 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0294  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.69 
 
 		 1071 aa  448  1.0000000000000001e-124  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.565561 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5112  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.81 
 
 		 901 aa  449  1.0000000000000001e-124  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1904  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.97 
 
 		 932 aa  447  1.0000000000000001e-124  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.636099  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2428  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.99 
 
 		 945 aa  446  1.0000000000000001e-124  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.396366 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3243  PAS sensor protein  40.22 
 
 		 1323 aa  444  1e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1017  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.69 
 
 		 1323 aa  441  9.999999999999999e-123  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0385374  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0869  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.1 
 
 		 1316 aa  428  1e-118  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0225926  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0316  sensor histidine kinase/response regulator  40.52 
 
 		 1174 aa  410  1e-113  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0090  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  39.25 
 
 		 1163 aa  408  1.0000000000000001e-112  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0898  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.76 
 
 		 1172 aa  408  1.0000000000000001e-112  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.149338  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0274  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  37.48 
 
 		 1169 aa  404  1e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.41273  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0409  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  40.89 
 
 		 1171 aa  404  1e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0058  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.06 
 
 		 1170 aa  404  1e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.950876  normal  0.562732 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1507  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.46 
 
 		 896 aa  402  9.999999999999999e-111  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.808684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0860  putative two-component hybrid sensor histidine kinase and response regulator  36.57 
 
 		 1169 aa  401  9.999999999999999e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0827695 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0169  Na+/solute symporter  39.1 
 
 		 894 aa  395  1e-108  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0827667  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0921  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.5 
 
 		 1169 aa  393  1e-108  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.306622  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1408  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.3 
 
 		 897 aa  396  1e-108  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.263667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1803  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.1 
 
 		 894 aa  394  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.27583 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2991  GAF sensor signal transduction histidine kinase  40.67 
 
 		 1069 aa  392  1e-107  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4823  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  40.07 
 
 		 1169 aa  392  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1474  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.84 
 
 		 894 aa  392  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2900  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.48 
 
 		 1069 aa  390  1e-107  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.095908  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3738  Na+/proline symporter-like protein  36.05 
 
 		 950 aa  391  1e-107  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4564  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  38.82 
 
 		 1169 aa  388  1e-106  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.519353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2693  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.28 
 
 		 893 aa  387  1e-106  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.194917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1498  GAF sensor signal transduction histidine kinase  39.38 
 
 		 1070 aa  389  1e-106  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.308131  normal  0.537019 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2805  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.03 
 
 		 1070 aa  385  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0165  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.35 
 
 		 1168 aa  386  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.53132  normal  0.851256 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0252  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.4 
 
 		 1174 aa  380  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.854881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1585  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  36.61 
 
 		 1158 aa  377  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.484303 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0224  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.8 
 
 		 1167 aa  378  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0837  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  38.64 
 
 		 1168 aa  376  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.303418 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21700  putative two-component sensor  38.3 
 
 		 1159 aa  377  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1850  putative two-component sensor  38.46 
 
 		 1159 aa  378  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.460329  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1695  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.44 
 
 		 1159 aa  375  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.948496  normal  0.574545 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3255  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.08 
 
 		 1177 aa  375  1e-102  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0680649  normal  0.187811 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3900  sensory box histidine kinase/response regulator  36.35 
 
 		 1157 aa  375  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1292  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.28 
 
 		 1159 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0372313  normal  0.867611 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3169  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.21 
 
 		 1168 aa  374  1e-102  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0939  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  36.03 
 
 		 1168 aa  371  1e-101  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1250  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.75 
 
 		 1158 aa  372  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0252543 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4025  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.12 
 
 		 1159 aa  373  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0792472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1660  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  37.28 
 
 		 1156 aa  369  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0486727  normal  0.0112915 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4538  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.42 
 
 		 1172 aa  370  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3978  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.97 
 
 		 1152 aa  363  8e-99  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.508831  normal  0.169335 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35230  integral membrane sensor hybrid histidine protein kinase  37.4 
 
 		 1161 aa  362  2e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.234785  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02752  two-component system sensor protein  37.21 
 
 		 1150 aa  359  9.999999999999999e-98  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0663  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.44 
 
 		 1172 aa  360  9.999999999999999e-98  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.564919 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3460  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.28 
 
 		 1175 aa  359  1.9999999999999998e-97  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.549126 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3284  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.28 
 
 		 1168 aa  358  2.9999999999999997e-97  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.431447 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2742  sensor histidine kinase/response regulator  34.86 
 
 		 1145 aa  349  1e-94  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0620  two component sensor kinase/response regulator hybrid  36.62 
 
 		 1169 aa  349  1e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0523  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  36.08 
 
 		 1179 aa  343  9e-93  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.183484 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2361  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.7 
 
 		 1146 aa  338  3.9999999999999995e-91  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00248753 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1753  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.6 
 
 		 1146 aa  338  5e-91  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1749  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.6 
 
 		 1146 aa  337  5e-91  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0353406  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0849  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.63 
 
 		 981 aa  337  5.999999999999999e-91  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.000864337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2829  membrane associated response regulator, histidine kinase  36.9 
 
 		 1148 aa  337  7e-91  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2531  histidine kinase  35.44 
 
 		 1146 aa  335  2e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.014523  hitchhiker  0.00504999 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0523  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.82 
 
 		 1145 aa  335  3e-90  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1792  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.6 
 
 		 1146 aa  335  3e-90  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.103598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1864  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.69 
 
 		 1159 aa  335  3e-90  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0562222 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1470  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  32.84 
 
 		 1140 aa  332  2e-89  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2348  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.25 
 
 		 1145 aa  332  2e-89  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2724  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.28 
 
 		 1140 aa  332  3e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.178694  hitchhiker  0.00103188 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2557  histidine kinase  35.25 
 
 		 1142 aa  332  3e-89  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.257497  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2695  sensor histidine kinase  35.23 
 
 		 1147 aa  331  4e-89  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00164  sensor histidine kinase  33.65 
 
 		 1177 aa  331  4e-89  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2433  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.18 
 
 		 1146 aa  323  9.999999999999999e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0799381 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0068  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  33.02 
 
 		 1156 aa  320  7e-86  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2522  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.4 
 
 		 1146 aa  320  1e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00042371 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1534  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.25 
 
 		 1140 aa  319  2e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.254728  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1029  two-component sensor CbrA  37.2 
 
 		 986 aa  317  7e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.211087  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2078  sensor histidine kinase/response regulator  32.69 
 
 		 1141 aa  316  1.9999999999999998e-84  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.45474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1788  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.71 
 
 		 885 aa  314  4.999999999999999e-84  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00597808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1985  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.24 
 
 		 1138 aa  313  1e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1893  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.44 
 
 		 985 aa  304  7.000000000000001e-81  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.426931  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0675  two-component sensor kinase CbrA  33.91 
 
 		 975 aa  300  1e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00719  Multidomain protein contains Na+/proline symporter PutP-like domain, sensory histidine kinase and receiver domain  31.4 
 
 		 1147 aa  296  1e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1424  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.45 
 
 		 1152 aa  286  1.0000000000000001e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.68675 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>