More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0688 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_0688  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
450 aa  919    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.715713  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2729  hydrolase  46.17 
 
 
456 aa  397  1e-109  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.252968  decreased coverage  0.0000538772 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2326  beta-lactamase domain-containing protein  42.27 
 
 
467 aa  363  3e-99  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1892  beta-lactamase domain protein  40.74 
 
 
453 aa  329  7e-89  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0875078  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0421  beta-lactamase-like  39.07 
 
 
450 aa  298  1e-79  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1167  beta-lactamase domain protein  36.75 
 
 
470 aa  274  3e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.705193  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2309  metallo-beta-lactamase family protein  36.13 
 
 
472 aa  272  7e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0946  beta-lactamase domain protein  36.12 
 
 
467 aa  265  1e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2491  beta-lactamase-like  35.03 
 
 
455 aa  262  8e-69  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5172  beta-lactamase domain protein  34.42 
 
 
466 aa  254  2.0000000000000002e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6932  beta-lactamase domain protein  33.76 
 
 
470 aa  246  8e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6177  beta-lactamase domain protein  33.85 
 
 
470 aa  246  9e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.670762  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0543  beta-lactamase domain protein  34.05 
 
 
471 aa  245  9.999999999999999e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000327684 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1354  metallo-beta-lactamase superfamily protein  33.69 
 
 
472 aa  245  9.999999999999999e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.47654  normal  0.245215 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5594  beta-lactamase domain protein  34.78 
 
 
470 aa  243  5e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00681465  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3176  beta-lactamase domain protein  35.19 
 
 
461 aa  238  2e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00491395  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2723  beta-lactamase domain protein  34.26 
 
 
476 aa  237  3e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00124827  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0047  beta-lactamase domain protein  32.49 
 
 
466 aa  236  6e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1215  beta-lactamase domain-containing protein  36.42 
 
 
460 aa  234  3e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0173274 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2849  beta-lactamase domain-containing protein  33.61 
 
 
480 aa  234  3e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3119  beta-lactamase domain protein  34.33 
 
 
463 aa  233  6e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1643  beta-lactamase domain-containing protein  34.27 
 
 
464 aa  233  6e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2631  Rhodanese domain protein  33.26 
 
 
480 aa  230  4e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1183  beta-lactamase domain protein  34.39 
 
 
476 aa  229  9e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0291229  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1571  metallo-beta-lactamase superfamily protein  32.11 
 
 
471 aa  228  2e-58  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4881  beta-lactamase domain-containing protein  32.61 
 
 
471 aa  225  1e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.897195  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5751  beta-lactamase domain-containing protein  34.86 
 
 
459 aa  224  2e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.469011  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3085  rhodanese-like protein  34.64 
 
 
459 aa  224  3e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0383  beta-lactamase domain protein  35.17 
 
 
471 aa  221  1.9999999999999999e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2913  beta-lactamase domain protein  31.95 
 
 
469 aa  221  3e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1830  beta-lactamase domain-containing protein  34.51 
 
 
459 aa  219  7e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.772754  normal  0.208991 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4023  beta-lactamase domain-containing protein  34.51 
 
 
459 aa  219  7e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.139103  normal  0.561085 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3523  hydroxyacylglutathione hydrolase  32.63 
 
 
478 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5691  beta-lactamase domain-containing protein  33.63 
 
 
459 aa  215  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5312  beta-lactamase-like protein  33.63 
 
 
459 aa  215  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5401  beta-lactamase domain-containing protein  33.63 
 
 
459 aa  215  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.854326  normal  0.319128 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0985  beta-lactamase domain-containing protein  33.77 
 
 
459 aa  213  7e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06430  metallo-beta-lactamase superfamily protein  29.55 
 
 
471 aa  209  9e-53  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2361  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain-containing protein  32.21 
 
 
484 aa  208  2e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0105565  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2277  hydroxyacylglutathione hydrolase  32 
 
 
478 aa  207  2e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.95304  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2538  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain-containing protein  32.21 
 
 
484 aa  208  2e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.343645  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1619  beta-lactamase-like protein  33.76 
 
 
479 aa  208  2e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000199695  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1826  beta-lactamase-like protein  33.11 
 
 
457 aa  207  2e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1732  hydroxyacylglutathione hydrolase  31.79 
 
 
478 aa  207  3e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00322507 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2319  hydroxyacylglutathione hydrolase  32 
 
 
478 aa  206  7e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.001105  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1707  Rhodanese domain protein  35.06 
 
 
472 aa  205  1e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.140865  normal  0.999922 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2552  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain protein  31.58 
 
 
478 aa  204  3e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.08286e-25 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4014  beta-lactamase-like protein  33.88 
 
 
453 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4244  beta-lactamase domain-containing protein  33.88 
 
 
453 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.166116 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4088  beta-lactamase domain-containing protein  33.88 
 
 
453 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5378  beta-lactamase domain protein  34.69 
 
 
462 aa  199  1.0000000000000001e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.120982  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0267  beta-lactamase domain protein  33.91 
 
 
484 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.30409  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0513  beta-lactamase domain-containing protein  32.59 
 
 
617 aa  198  2.0000000000000003e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2338  beta-lactamase domain-containing protein  30.95 
 
 
478 aa  197  3e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.415527  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0074  beta-lactamase domain-containing protein  29.87 
 
 
444 aa  196  8.000000000000001e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0076  beta-lactamase domain-containing protein  29.87 
 
 
444 aa  196  8.000000000000001e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5835  beta-lactamase domain-containing protein  33.41 
 
 
450 aa  196  1e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.33754 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0208  beta-lactamase domain protein  32.7 
 
 
470 aa  194  2e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0980  beta-lactamase domain-containing protein  32.43 
 
 
455 aa  194  3e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3839  beta-lactamase domain-containing protein  31.87 
 
 
469 aa  192  1e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21680  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  32 
 
 
470 aa  189  5.999999999999999e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2578  beta-lactamase domain protein  33.94 
 
 
471 aa  189  7e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0010585  decreased coverage  0.0000461867 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2606  beta-lactamase domain protein  31.56 
 
 
444 aa  189  1e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0866757 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2429  beta-lactamase domain protein  32.39 
 
 
464 aa  186  9e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00447087  normal  0.135271 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0359  beta-lactamase domain protein  32.65 
 
 
476 aa  183  4.0000000000000006e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34990  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  34.02 
 
 
453 aa  182  9.000000000000001e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.848513  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21300  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  32.37 
 
 
456 aa  181  2e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.617308  hitchhiker  0.0075618 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2435  metallo-beta-lactamase family protein  28.6 
 
 
442 aa  178  2e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28130  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  32.75 
 
 
502 aa  176  7e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2937  beta-lactamase domain-containing protein  31.15 
 
 
452 aa  176  9.999999999999999e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.142956  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2086  beta-lactamase domain-containing protein  31.47 
 
 
470 aa  172  9e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.472502  normal  0.029766 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2681  beta-lactamase-like  31.76 
 
 
464 aa  172  1e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2225  beta-lactamase domain-containing protein  31.44 
 
 
470 aa  167  4e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.4809 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3361  beta-lactamase domain-containing protein  32.87 
 
 
466 aa  161  2e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.655276  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11813  Rhodanese-like protein  29.59 
 
 
442 aa  161  2e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.154405  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0108  beta-lactamase domain-containing protein  32.56 
 
 
454 aa  159  7e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3957  beta-lactamase domain-containing protein  31.32 
 
 
489 aa  157  5.0000000000000005e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.381216 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3632  beta-lactamase domain-containing protein  31.09 
 
 
488 aa  155  1e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.182786  normal  0.236484 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2892  beta-lactamase domain-containing protein  32.24 
 
 
452 aa  155  1e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.193457  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4226  beta-lactamase domain protein  27.63 
 
 
480 aa  154  4e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2038  beta-lactamase domain protein  29.28 
 
 
451 aa  145  1e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0124329  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1960  beta-lactamase domain-containing protein  30.82 
 
 
478 aa  146  1e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0558054  normal  0.587362 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1900  metallo-beta-lactamase family protein  28.22 
 
 
446 aa  138  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.309949  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12628  hypothetical protein  24.77 
 
 
448 aa  124  3e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.520905  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1014  beta-lactamase domain protein  27.32 
 
 
454 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.532589  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0093  Beta-lactamase-like  32.51 
 
 
244 aa  116  6.9999999999999995e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000294531  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2790  beta-lactamase domain protein  30.8 
 
 
246 aa  116  7.999999999999999e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0757  beta-lactamase domain protein  33.48 
 
 
244 aa  116  8.999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.717339  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2738  putative metallo-beta-lactamase family protein  31.15 
 
 
243 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.292941  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4842  beta-lactamase-like  28.45 
 
 
346 aa  115  1.0000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3773  beta-lactamase-like protein  29.67 
 
 
354 aa  105  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.957871  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3935  beta-lactamase-like  30.37 
 
 
251 aa  102  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.361961 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0269  metallo-beta-lactamase family protein  34.35 
 
 
229 aa  100  6e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0318981  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0446  beta-lactamase domain protein  34.35 
 
 
229 aa  100  6e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000228616 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2007  metallo-beta-lactamase family protein  23.38 
 
 
361 aa  97.1  6e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2688  beta-lactamase-like protein  30.8 
 
 
250 aa  95.5  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2898  beta-lactamase domain protein  28.75 
 
 
375 aa  95.5  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0819  hypothetical protein  25.51 
 
 
235 aa  94.7  3e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0566  beta-lactamase domain protein  28.76 
 
 
378 aa  93.2  8e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00148503  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0844  hypothetical protein  25.1 
 
 
235 aa  91.7  3e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>