More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0686 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_0686  1-phosphofructokinase  100 
 
 
316 aa  636    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.020594  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0175  1-phosphofructokinase  56.55 
 
 
306 aa  340  2e-92  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1715  1-phosphofructokinase  52.08 
 
 
324 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1157  1-phosphofructokinase  38.61 
 
 
310 aa  212  7.999999999999999e-54  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1511  1-phosphofructokinase  40.32 
 
 
303 aa  206  5e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000166616  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1128  carbohydrate kinase, PfkB family  37.26 
 
 
310 aa  201  9.999999999999999e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0576  1-phosphofructokinase  38.19 
 
 
310 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000336585  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0650  1-phosphofructokinase  34.7 
 
 
307 aa  200  1.9999999999999998e-50  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1788  1-phosphofructokinase  34.7 
 
 
311 aa  199  3.9999999999999996e-50  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.468548  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1346  carbohydrate kinase  36.94 
 
 
310 aa  199  7e-50  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3483  1-phosphofructokinase  37.66 
 
 
303 aa  194  2e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.622893  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1776  1-phosphofructokinase  33.55 
 
 
308 aa  192  5e-48  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2395  1-phosphofructokinase  35.71 
 
 
303 aa  187  3e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.378006  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3745  1-phosphofructokinase  37.54 
 
 
303 aa  185  7e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0550156  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3564  1-phosphofructokinase  36.04 
 
 
303 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0892785  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3727  1-phosphofructokinase  36.04 
 
 
303 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5453300000000002e-26 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3847  1-phosphofructokinase  36.04 
 
 
303 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000858241  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1347  1-phosphofructokinase  37.84 
 
 
303 aa  184  2.0000000000000003e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.50692  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3463  1-phosphofructokinase  35.71 
 
 
303 aa  184  3e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00127204  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1834  ribokinase-like domain-containing protein  37.1 
 
 
306 aa  183  3e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3768  1-phosphofructokinase  36.36 
 
 
303 aa  183  3e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000270139  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0589  1-phosphofructokinase  34.65 
 
 
305 aa  182  5.0000000000000004e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0723  1-phosphofructokinase  36.1 
 
 
306 aa  182  6e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0739  1-phosphofructokinase  36.1 
 
 
306 aa  182  6e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0358  1-phosphofructokinase  34.82 
 
 
306 aa  182  8.000000000000001e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2650  1-phosphofructokinase  38.49 
 
 
303 aa  181  2e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1956  tagatose-6-phosphate kinase  36.99 
 
 
310 aa  180  2e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000247641  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3817  1-phosphofructokinase  36.04 
 
 
303 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00128432  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3477  1-phosphofructokinase  35.71 
 
 
303 aa  179  4e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000168948  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0445  fructose-1-phosphate kinase  36.05 
 
 
303 aa  179  4e-44  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00359315  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1252  1-phosphofructokinase  37.26 
 
 
312 aa  179  4e-44  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1485  1-phosphofructokinase  35.71 
 
 
303 aa  179  4e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.211736  normal  0.0136163 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1727  tagatose-6-phosphate kinase  34.08 
 
 
304 aa  178  1e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.209721  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1031  1-phosphofructokinase  37.54 
 
 
311 aa  178  1e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1351  ribokinase-like domain-containing protein  35.16 
 
 
309 aa  177  1e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3541  1-phosphofructokinase  35.48 
 
 
332 aa  177  2e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4571  1-phosphofructokinase  38.89 
 
 
319 aa  177  2e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.78186 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0147  1-phosphofructokinase  35.35 
 
 
315 aa  176  7e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000110184  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1069  1-phosphofructokinase  32.7 
 
 
311 aa  175  8e-43  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3234  1-phosphofructokinase  37.86 
 
 
311 aa  172  5e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1907  tagatose-6-phosphate kinase  33.76 
 
 
307 aa  171  2e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.961969  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0415  6-phosphofructokinase  35.41 
 
 
350 aa  168  9e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3759  1-phosphofructokinase  35.26 
 
 
304 aa  167  2e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0565  1-phosphofructokinase  32.8 
 
 
306 aa  167  2.9999999999999998e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0551  1-phosphofructokinase  32.8 
 
 
306 aa  166  4e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1600  6-phosphofructokinase II  35.58 
 
 
311 aa  166  6.9999999999999995e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.349634 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0828  1-phosphofructokinase  34.84 
 
 
315 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.904747 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0794  1-phosphofructokinase  33.55 
 
 
315 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0702264  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0641  1-phosphofructokinase  35.35 
 
 
311 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.021814  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22720  tagatose-6-phosphate kinase, phosphofructokinase I  32.49 
 
 
315 aa  162  8.000000000000001e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.727681  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1642  tagatose-6-phosphate kinase, phosphofructokinase I  33.12 
 
 
307 aa  161  1e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1032  tagatose-6-phosphate kinase  33.33 
 
 
305 aa  160  2e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.104168  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0817  1-phosphofructokinase  33.23 
 
 
315 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.419127 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4399  1-phosphofructokinase  34.62 
 
 
315 aa  160  3e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0209  1-phosphofructokinase  31.33 
 
 
310 aa  158  1e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.238071  normal  0.898641 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0109  1-phosphofructokinase  33.02 
 
 
302 aa  158  1e-37  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0078  1-phosphofructokinase  34.7 
 
 
308 aa  157  3e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0138  1-phosphofructokinase  33.97 
 
 
318 aa  156  4e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0012  1-phosphofructokinase  34.06 
 
 
308 aa  156  4e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00179205  unclonable  0.0000000067569 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2263  tagatose-6-phosphate kinase  33.87 
 
 
310 aa  156  5.0000000000000005e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.925431  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2224  tagatose-6-phosphate kinase  33.87 
 
 
310 aa  156  5.0000000000000005e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0091  1-phosphofructokinase  34.91 
 
 
325 aa  156  5.0000000000000005e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.720236  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6213  1-phosphofructokinase  32.57 
 
 
311 aa  155  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.175632  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1721  6-phosphofructokinase 2  32.26 
 
 
310 aa  155  1e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.132739  normal  0.591583 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2174  1-phosphofructokinase  34.62 
 
 
326 aa  154  2e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0611  tagatose-6-phosphate kinase  33.58 
 
 
311 aa  153  4e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0794  PfkB  34.75 
 
 
313 aa  152  8.999999999999999e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0909395  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1929  tagatose-6-phosphate kinase  32.91 
 
 
310 aa  150  2e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5875  1-phosphofructokinase  33.55 
 
 
326 aa  151  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.412228  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0382  1-phosphofructokinase  31.38 
 
 
302 aa  151  2e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000931152  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01692  6-phosphofructokinase II  32.79 
 
 
309 aa  150  3e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1919  1-phosphofructokinase  32.79 
 
 
309 aa  150  3e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1909  6-phosphofructokinase 2  32.79 
 
 
309 aa  150  3e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0142081  normal  0.242978 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1455  6-phosphofructokinase 2  32.13 
 
 
310 aa  150  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.620186  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1804  6-phosphofructokinase 2  32.79 
 
 
309 aa  150  3e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0265259  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01680  hypothetical protein  32.79 
 
 
309 aa  150  3e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.943682  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0347  PfkB  33.12 
 
 
312 aa  150  4e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0042233 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2018  6-phosphofructokinase 2  32.13 
 
 
310 aa  149  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1423  6-phosphofructokinase 2  32.13 
 
 
310 aa  150  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.445434  hitchhiker  0.000900172 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1845  6-phosphofructokinase 2  32.13 
 
 
310 aa  149  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00011126  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4105  ribokinase-like domain-containing protein  36.69 
 
 
332 aa  149  5e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1440  6-phosphofructokinase 2  32.13 
 
 
310 aa  149  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1968  6-phosphofructokinase 2  32.46 
 
 
309 aa  149  8e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1943  6-phosphofructokinase 2  32.46 
 
 
309 aa  149  8e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0791846  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2441  6-phosphofructokinase 2  32.46 
 
 
309 aa  149  8e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.386774  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13290  1-phosphofructokinase  32.7 
 
 
318 aa  149  8e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1793  tagatose-6-phosphate kinase  33.55 
 
 
310 aa  148  1.0000000000000001e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.354584  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1468  6-phosphofructokinase 2  32.46 
 
 
309 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.193621  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0650  1-phosphofructokinase  32.38 
 
 
303 aa  148  1.0000000000000001e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.934038  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2080  ribokinase-like domain-containing protein  33.77 
 
 
312 aa  148  2.0000000000000003e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.234736 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3382  1-phosphofructokinase  32.51 
 
 
308 aa  146  4.0000000000000006e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000263995  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3901  1-phosphofructokinase  32.37 
 
 
300 aa  146  5e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000128039  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1873  1-phosphofructokinase  31.19 
 
 
320 aa  146  5e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00509321 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0955  1-phosphofructokinase  32.7 
 
 
313 aa  145  6e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0064  1-phosphofructokinase  38.38 
 
 
315 aa  145  8.000000000000001e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.596647  normal  0.385199 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1482  1-phosphofructokinase  33.44 
 
 
319 aa  145  9e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.132343  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1807  carbohydrate kinase, PfkB family  33.44 
 
 
319 aa  145  9e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.917848  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2760  1-phosphofructokinase  34.53 
 
 
302 aa  145  9e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2397  1-phosphofructokinase  35.77 
 
 
312 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.296088  hitchhiker  0.000165824 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2441  1-phosphofructokinase  35.77 
 
 
312 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.151265  hitchhiker  0.00000493552 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>