More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0671 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_0671  geranylgeranyl reductase  100 
 
 		 381 aa  745    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.421353  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0303  geranylgeranyl reductase  45.84 
 
 		 396 aa  316  5e-85  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.411579  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0172  bacteriochlorophyll synthase  42.97 
 
 		 396 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.935683 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1711  geranylgeranyl reductase  36.89 
 
 		 365 aa  182  9.000000000000001e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0578  geranylgeranyl reductase  30.58 
 
 		 395 aa  160  3e-38  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1386  geranylgeranyl reductase  32.29 
 
 		 390 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1250  geranylgeranyl reductase  32.03 
 
 		 390 aa  155  1e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.375977  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1308  geranylgeranyl reductase  30.81 
 
 		 406 aa  153  4e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0044  geranylgeranyl reductase  36.69 
 
 		 391 aa  151  2e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.345503  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0522  geranylgeranyl reductase  31.77 
 
 		 390 aa  151  2e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1375  geranylgeranyl reductase  31.32 
 
 		 390 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.545102  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0369  geranylgeranyl reductase  30.77 
 
 		 408 aa  147  3e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0683691  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3422  geranylgeranyl reductase  34.48 
 
 		 407 aa  144  3e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.351163 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1307  geranylgeranyl reductase  31.15 
 
 		 391 aa  139  7.999999999999999e-32  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.398981  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1077  geranylgeranyl reductase  30 
 
 		 399 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0240225  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4276  geranylgeranyl reductase  31.25 
 
 		 405 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0631  geranylgeranyl reductase  29.13 
 
 		 402 aa  129  8.000000000000001e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4038  geranylgeranyl reductase  29.72 
 
 		 406 aa  129  1.0000000000000001e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.670598  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0173  geranylgeranyl reductase  30.81 
 
 		 405 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000608264  normal  0.261316 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0178  geranylgeranyl reductase  30.81 
 
 		 405 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0385  geranylgeranyl reductase  29.8 
 
 		 457 aa  127  4.0000000000000003e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2942  hypothetical protein  32.11 
 
 		 416 aa  125  1e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.33678  normal  0.0128685 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0444  geranylgeranyl reductase  32.68 
 
 		 341 aa  125  1e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1823  geranylgeranyl reductase  29.37 
 
 		 406 aa  125  1e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.626977  normal  0.601961 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0714  geranylgeranyl reductase  33.78 
 
 		 386 aa  124  2e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1497  geranylgeranyl reductase  30.03 
 
 		 418 aa  123  6e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1087  electron transfer flavoprotein  28.17 
 
 		 384 aa  123  6e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.384904  normal  0.110599 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1239  geranylgeranyl reductase  30.12 
 
 		 452 aa  121  1.9999999999999998e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.214331  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0962  geranylgeranyl reductase  30.51 
 
 		 399 aa  120  6e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.493163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08201  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  27.84 
 
 		 446 aa  119  9e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0643  geranylgeranyl reductase  29.92 
 
 		 360 aa  119  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.770726  normal  0.124546 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2205  geranylgeranyl reductase  33.33 
 
 		 363 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1240  geranylgeranyl reductase  29.38 
 
 		 455 aa  118  1.9999999999999998e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.525757 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0768  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  28.36 
 
 		 446 aa  118  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08221  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  27.84 
 
 		 446 aa  117  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16731  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  29.32 
 
 		 468 aa  117  3e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.652632 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0864  geranylgeranyl reductase  25.2 
 
 		 396 aa  117  3.9999999999999997e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000799674  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1392  excinuclease ABC subunit C  31.45 
 
 		 382 aa  116  6e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0201698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0506  geranylgeranyl reductase  31.39 
 
 		 398 aa  114  3e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1664  geranylgeranyl reductase  30.56 
 
 		 407 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08231  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  26.86 
 
 		 445 aa  113  5e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.891697  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0807  geranylgeranyl reductase  28.1 
 
 		 348 aa  112  8.000000000000001e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00458422  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0114  FAD dependent oxidoreductase  26.68 
 
 		 399 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00154267  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1123  geranylgeranyl reductase  28.91 
 
 		 402 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0718  geranylgeranyl reductase  27.76 
 
 		 387 aa  110  3e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0277  geranylgeranyl hydrogenase  30.13 
 
 		 394 aa  110  6e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1920  geranylgeranyl reductase  30.13 
 
 		 394 aa  110  6e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.571775 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2633  geranylgeranyl reductase  29.55 
 
 		 421 aa  109  7.000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0431  PUA domain-containing protein  32.21 
 
 		 397 aa  108  2e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0164  geranylgeranyl reductase  28.36 
 
 		 443 aa  107  3e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.620405  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07961  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  28.36 
 
 		 443 aa  107  3e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.253418  normal  0.790247 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0472  geranylgeranyl reductase  22.14 
 
 		 385 aa  105  1e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.730289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1349  geranylgeranyl reductase  25.46 
 
 		 392 aa  105  1e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10031  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  28.95 
 
 		 449 aa  105  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.245076  normal  0.232729 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1447  geranylgeranyl reductase  22.56 
 
 		 392 aa  105  1e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.134641  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1018  geranylgeranyl reductase  29.87 
 
 		 394 aa  105  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.175097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119498  geranylgeranyl reductase  28.08 
 
 		 462 aa  105  2e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0539  geranylgeranyl reductase  25.81 
 
 		 391 aa  104  2e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1090  bacteriochlorophyll synthase 43 kDa subunit  26.49 
 
 		 385 aa  104  3e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0365  geranylgeranyl reductase  22.39 
 
 		 386 aa  103  6e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.230405  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1945  geranylgeranyl reductase  31.93 
 
 		 398 aa  102  8e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0661  geranylgeranyl reductase  28.27 
 
 		 375 aa  102  1e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3265  geranylgeranyl reductase  30.41 
 
 		 406 aa  101  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0200135 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0279  geranylgeranyl reductase  32.32 
 
 		 424 aa  100  4e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3751  geranylgeranyl reductase  30.03 
 
 		 406 aa  100  5e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0101048  hitchhiker  0.000524672 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8053  geranylgeranyl reductase  28.7 
 
 		 423 aa  99.4  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.661392 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2696  geranylgeranyl reductase, plantal and  31.21 
 
 		 435 aa  98.2  2e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2717  geranylgeranyl reductase  28.4 
 
 		 443 aa  97.4  4e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.593407 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0023  geranylgeranyl reductase  29.17 
 
 		 379 aa  97.1  5e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0136897  hitchhiker  0.00371909 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3528  geranylgeranyl reductase  28.83 
 
 		 394 aa  96.7  6e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.673829 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0023  geranylgeranyl reductase  29.97 
 
 		 379 aa  95.5  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.086385  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1220  dehydrogenase (flavoprotein)-like protein  26.01 
 
 		 378 aa  95.5  1e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0468  geranylgeranyl reductase  28.97 
 
 		 431 aa  94.7  2e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0808  geranylgeranyl reductase  30.26 
 
 		 378 aa  95.1  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000424296 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0973  geranylgeranyl reductase  30.47 
 
 		 430 aa  94.7  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4420  geranylgeranyl reductase  29.31 
 
 		 418 aa  94.4  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0016  geranylgeranyl reductase  29.13 
 
 		 380 aa  94  4e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.828893  normal  0.344079 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2507  FAD dependent oxidoreductase  24.52 
 
 		 414 aa  94  4e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.206191  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5052  geranylgeranyl reductase  29.75 
 
 		 434 aa  93.2  6e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0167  geranylgeranyl reductase  27.81 
 
 		 393 aa  93.2  7e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3745  geranylgeranyl reductase  30.03 
 
 		 400 aa  92.8  8e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000410516 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3556  FAD dependent oxidoreductase  29.1 
 
 		 432 aa  92.4  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0035  geranylgeranyl reductase  28.2 
 
 		 380 aa  91.3  2e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.916237  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0266  geranylgeranyl reductase  30.72 
 
 		 445 aa  90.9  3e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.224418  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0583  geranylgeranyl reductase  29.47 
 
 		 425 aa  90.5  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3230  geranylgeranyl reductase  29 
 
 		 431 aa  90.1  6e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716202 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0133  geranylgeranyl reductase  31.64 
 
 		 368 aa  89.7  7e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4291  geranylgeranyl reductase  27.89 
 
 		 393 aa  89.7  8e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.464527 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0044  geranylgeranyl reductase  28.57 
 
 		 380 aa  89.4  9e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_50650  predicted protein  29.49 
 
 		 463 aa  89  1e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2774  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  27.18 
 
 		 430 aa  89  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.372841  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1273  geranylgeranyl reductase  27.45 
 
 		 457 aa  87.4  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0513601 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6683  geranylgeranyl reductase  27.95 
 
 		 426 aa  87.4  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00871957  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3043  geranylgeranyl reductase  27.78 
 
 		 376 aa  87.4  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.483009 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0783  monooxygenase, FAD-binding  25.47 
 
 		 375 aa  86.3  9e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2055  geranylgeranyl reductase  28.61 
 
 		 393 aa  86.3  9e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3081  FAD dependent oxidoreductase  22.95 
 
 		 413 aa  85.9  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4464  geranylgeranyl reductase  29.5 
 
 		 423 aa  85.9  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.152921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0939  FAD dependent oxidoreductase  26.05 
 
 		 385 aa  85.1  0.000000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0379493  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0022  geranylgeranyl reductase  27.25 
 
 		 380 aa  85.1  0.000000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>