60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0639 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_0639  CRISPR-associated Csh2 family protein  100 
 
 
321 aa  661  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.00285412  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1072  CRISPR-associated Csh2 family protein  54.97 
 
 
330 aa  346  3e-94  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.618984  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0306  CRISPR-associated protein, Csh2 family  57.74 
 
 
318 aa  342  4e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1184  CRISPR-associated protein, Csh2 family  56.77 
 
 
318 aa  336  3e-91  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3202  CRISPR-associated Csh2 family protein  54.46 
 
 
305 aa  334  1e-90  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0623  CRISPR-associated protein, Csh2 family  50.97 
 
 
303 aa  307  1e-82  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1019  CRISPR-associated Csh2 family protein  46.62 
 
 
299 aa  261  1e-68  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1292  CRISPR-associated protein, Csh2 family  42.91 
 
 
306 aa  226  5e-58  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0938  CRISPR-associated Csh2 family protein  40.72 
 
 
302 aa  204  2e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1420  CRISPR-associated protein, Csh2 family  39.13 
 
 
313 aa  200  3e-50  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.634971  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1881  CRISPR-associated Csh2 family protein  38.54 
 
 
302 aa  196  3e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.576122  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2663  CRISPR-associated protein, Csh2 family  40.14 
 
 
301 aa  184  1e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2520  hypothetical protein  33.01 
 
 
301 aa  181  2e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2325  CRISPR-associated Csh2 family protein  35.64 
 
 
293 aa  177  2e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15240  CRISPR-associated protein, Csh2 family  38.61 
 
 
302 aa  174  1e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.105097  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0537  CRISPR-associated Csh2 family protein  33.87 
 
 
329 aa  169  5e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2426  CRISPR-associated protein, Csh2 family  35.53 
 
 
319 aa  167  2e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0614729  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2834  CRISPR-associated protein, Csh2 family  35.65 
 
 
351 aa  165  1e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0973  CRISPR-associated protein, Csh2 family  34.23 
 
 
334 aa  158  1e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0770  CRISPR-associated Csh2 family protein  35.15 
 
 
292 aa  153  4e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0269  CRISPR-associated Csh2 family protein  34.8 
 
 
314 aa  152  5e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1453  CRISPR-associated protein, Csh2 family  31.9 
 
 
359 aa  150  4e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3331  CRISPR-associated protein, Csh2 family  34.93 
 
 
340 aa  150  4e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3938  CRISPR-associated protein, CT1132 family  30.29 
 
 
316 aa  134  3e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4290  CRISPR-associated protein, CT1132 family  31.34 
 
 
356 aa  124  3e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0231  CRISPR-associated Csh2 family protein  32.37 
 
 
291 aa  119  9e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.748958  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1298  CRISPR-associated Csh2 family protein  31.25 
 
 
299 aa  105  1e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.841348  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1067  CRISPR-associated Csh2 family protein  33.48 
 
 
284 aa  104  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0472036 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0654  CRISPR-associated Csh2 family protein  31.86 
 
 
309 aa  100  3e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02698  crispr-associated protein, Csd2 family  30.26 
 
 
288 aa  97.1  3e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.820948  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0823  CRISPR-associated protein, Csd2 family  30.57 
 
 
291 aa  95.1  1e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.582934  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2975  CRISPR-associated Csd2 family protein  28.51 
 
 
290 aa  94.7  2e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.989998  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0495  CRISPR-associated Csh2 family protein  28.69 
 
 
297 aa  94.4  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1631  CRISPR-associated protein, Csd2 family  29.96 
 
 
312 aa  94.7  2e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.835293  normal  0.948126 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1158  CRISPR-associated Csd2 family protein  29.74 
 
 
302 aa  94  3e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1005  CRISPR-associated Csd2 family protein  28.76 
 
 
288 aa  92.8  6e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1486  Csd2 family CRISPR-associated protein  30.54 
 
 
326 aa  90.5  3e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.177259 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0831  CRISPR-associated Csd2 family protein  30.04 
 
 
317 aa  90.1  4e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1480  CRISPR-associated protein, Csd2 family  28.76 
 
 
294 aa  90.1  4e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3579  Csd2 family CRISPR-associated protein  30.81 
 
 
293 aa  89.4  7e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1976  CRISPR-associated protein, Csd2 family  30.25 
 
 
299 aa  87  4e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.856064  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3382  CRISPR-associated RAMP protein, Cmr1 family  31.22 
 
 
327 aa  86.3  6e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.860383  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0478  hypothetical protein  27.75 
 
 
288 aa  86.3  7e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0604  CRISPR-associated Csh2 family protein  26.87 
 
 
293 aa  85.1  1e-15  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.520474  normal  0.472142 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1974  CRISPR-associated protein, Csd2 family  26.23 
 
 
317 aa  84  3e-15  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31600  CRISPR-associated protein Csd2  27.76 
 
 
302 aa  84  3e-15  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1938  CRISPR-associated Csh2 family protein  26 
 
 
316 aa  81.3  2e-14  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.364907  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0236  CRISPR-associated Csd2 family protein  27.68 
 
 
325 aa  79.3  9e-14  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3904  CRISPR-associated Csh2 family protein  27.59 
 
 
294 aa  78.6  1e-13  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.264914  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3522  CRISPR-associated Csd2 family protein  27.7 
 
 
272 aa  76.6  6e-13  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3344  CRISPR-associated Csh2 family protein  30.38 
 
 
295 aa  72.8  7e-12  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00748339  normal  0.380655 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1433  CRISPR-associated Csd2 family protein  46.48 
 
 
366 aa  72.8  7e-12  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.562068  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4332  CRISPR-associated Csd2 family protein  28.23 
 
 
324 aa  70.5  3e-11  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000155089  normal  0.180837 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3648  CRISPR-associated protein, Csd2 family  28.76 
 
 
286 aa  69.7  6e-11  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1007  CRISPR-associated Csh2 family protein  26.91 
 
 
280 aa  69.7  6e-11  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.143713  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1660  CRISPR-associated protein, Csd2 family  49.28 
 
 
346 aa  68.9  1e-10  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1726  CRISPR-associated Csd2 family protein  24.84 
 
 
359 aa  65.5  1e-09  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.111007  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0847  hypothetical protein  26.61 
 
 
307 aa  62.8  7e-09  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0795  CRISPR-associated protein TM1801  28.18 
 
 
286 aa  57.4  3e-07  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2185  CRISPR-associated protein TM1801  26.36 
 
 
294 aa  50.8  3e-05  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>