More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0602 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_0602  UspA domain-containing protein  100 
 
 
147 aa  288  1e-77  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.491088  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  45.45 
 
 
164 aa  133  9.999999999999999e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  42.47 
 
 
150 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  45.77 
 
 
150 aa  123  9e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  45.45 
 
 
149 aa  116  9.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  40.97 
 
 
148 aa  114  5e-25  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  43.66 
 
 
151 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2586  universal stress protein  43.57 
 
 
141 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0483395  normal  0.125899 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  43.57 
 
 
180 aa  112  2.0000000000000002e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  40 
 
 
150 aa  111  3e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  42.47 
 
 
156 aa  111  3e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  43.48 
 
 
145 aa  108  3e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  39.04 
 
 
157 aa  107  4.0000000000000004e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  42.75 
 
 
145 aa  106  1e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  41.3 
 
 
145 aa  105  1e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2577  UspA domain protein  44.29 
 
 
148 aa  104  4e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987812  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  42.03 
 
 
145 aa  102  1e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0826  universal stress protein  41.18 
 
 
165 aa  102  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  41.43 
 
 
159 aa  98.2  3e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0704  hypothetical protein  41.78 
 
 
148 aa  97.8  4e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  40.85 
 
 
300 aa  97.4  6e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  42.14 
 
 
158 aa  97.1  8e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  41.01 
 
 
152 aa  97.1  8e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0118  UspA domain-containing protein  40.56 
 
 
144 aa  96.3  1e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.385941 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  36.81 
 
 
148 aa  95.5  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  39.01 
 
 
142 aa  95.5  2e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  38.89 
 
 
147 aa  95.1  3e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1706  universal stress protein  37.88 
 
 
130 aa  94.7  4e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0360451  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0848  hypothetical protein  36.43 
 
 
142 aa  93.6  8e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.957853  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0228  UspA domain protein  42.66 
 
 
144 aa  93.2  1e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.115538 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  39.46 
 
 
156 aa  92  2e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  38.85 
 
 
155 aa  90.1  9e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2196  UspA domain-containing protein  37.86 
 
 
143 aa  90.1  9e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3164  UspA domain protein  38.31 
 
 
156 aa  89.7  1e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1196  UspA domain-containing protein  40.29 
 
 
142 aa  89.4  2e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.196709  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0570  UspA domain protein  42.86 
 
 
141 aa  89  2e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.932953  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0780  UspA domain protein  34.29 
 
 
142 aa  88.2  3e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0608906  normal  0.0365188 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  41.43 
 
 
144 aa  88.2  4e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2204  UspA domain protein  37.33 
 
 
150 aa  86.7  9e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2088  UspA domain-containing protein  39.04 
 
 
153 aa  86.7  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0358891 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4350  UspA domain protein  39.16 
 
 
294 aa  86.3  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.252521  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1117  UspA domain-containing protein  35.76 
 
 
156 aa  86.7  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.656052  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7012  UspA domain-containing protein  35.76 
 
 
156 aa  86.7  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.305575  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2886  UspA domain-containing protein  38.96 
 
 
148 aa  85.5  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0844522  normal  0.787665 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0965  UspA domain protein  37.5 
 
 
152 aa  85.5  2e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5580  UspA domain protein  35.86 
 
 
168 aa  84.7  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.88885  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  36 
 
 
143 aa  84  7e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1603  UspA domain protein  37.14 
 
 
208 aa  83.2  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  38.41 
 
 
307 aa  82.8  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3218  universal stress protein  38.66 
 
 
120 aa  82.8  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0127245 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5263  UspA domain protein  39.01 
 
 
138 aa  82  0.000000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.179366  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  35.92 
 
 
139 aa  81.3  0.000000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2164  UspA domain protein  42.36 
 
 
154 aa  81.3  0.000000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2278  UspA domain protein  40.41 
 
 
143 aa  80.9  0.000000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3827  putative universal stress protein  33.11 
 
 
187 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1230  UspA domain-containing protein  35.42 
 
 
137 aa  80.1  0.000000000000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0762  UspA domain protein  38.36 
 
 
146 aa  80.1  0.000000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4273  UspA domain protein  34.48 
 
 
155 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.664066 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3427  UspA domain protein  36.43 
 
 
156 aa  80.1  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2059  UspA domain protein  36.05 
 
 
156 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.3944  hitchhiker  0.00218931 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3733  UspA domain protein  37.06 
 
 
151 aa  79  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.217159  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4434  UspA domain-containing protein  35.14 
 
 
158 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.947422 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0442  universal stress protein  36.13 
 
 
200 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  38.1 
 
 
152 aa  79  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3096  UspA domain protein  34.29 
 
 
207 aa  79  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0906  UspA domain protein  36.99 
 
 
147 aa  78.2  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00116915 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0607  putative universal stress-related protein  35.86 
 
 
155 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.135512 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1454  universal stress protein  38.36 
 
 
149 aa  78.2  0.00000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000316755  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  39.13 
 
 
287 aa  77.8  0.00000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1853  universal stress protein  34.48 
 
 
168 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.499137  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  35.62 
 
 
290 aa  78.2  0.00000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1382  UspA domain-containing protein  35 
 
 
142 aa  77.8  0.00000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.378027 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1489  UspA domain-containing protein  35.21 
 
 
137 aa  77.8  0.00000000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.854212 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3202  UspA domain protein  32.65 
 
 
151 aa  77.8  0.00000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.805747  normal  0.0850987 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5296  UspA domain-containing protein  34.46 
 
 
158 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3137  universal stress protein  32.21 
 
 
155 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1567  universal stress protein  34.67 
 
 
164 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.84315  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4485  UspA domain-containing protein  33.11 
 
 
155 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5121  hypothetical protein  33.11 
 
 
155 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5738  UspA domain-containing protein  33.11 
 
 
155 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.192477 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0309  hypothetical protein  33.57 
 
 
142 aa  77.4  0.00000000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0224  UspA domain protein  35.21 
 
 
151 aa  77  0.00000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.483112  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1445  universal stress protein UspA  38.78 
 
 
162 aa  77  0.00000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1664  UspA domain-containing protein  34.23 
 
 
156 aa  76.3  0.0000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1884  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 
137 aa  76.3  0.0000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1963  UspA domain-containing protein  37.24 
 
 
147 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1165  UspA domain protein  35.1 
 
 
152 aa  75.5  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000867886  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5916  UspA domain-containing protein  36.73 
 
 
157 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0585154  normal  0.579135 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0052  universal stress protein  33.78 
 
 
155 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5381  UspA domain-containing protein  36.91 
 
 
162 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.122478 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5818  UspA domain-containing protein  32.45 
 
 
153 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0832063 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0032  universal stress protein  34.9 
 
 
155 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1570  UspA domain protein  32.64 
 
 
154 aa  75.5  0.0000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0804  UspA domain protein  39.16 
 
 
138 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.380791 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1465  universal stress protein  34.9 
 
 
155 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1134  UspA domain-containing protein  35.57 
 
 
167 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1185  universal stress protein  34.9 
 
 
155 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0038  universal stress protein  34.9 
 
 
155 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.283622  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0038  universal stress family protein  34.67 
 
 
155 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.98264  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1573  UspA domain protein  37.14 
 
 
149 aa  75.1  0.0000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>