More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0595 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1299  DNA topoisomerase type IA central domain protein  47.44 
 
 		 938 aa  665    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.596273  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3010  DNA topoisomerase I  47.65 
 
 		 863 aa  647    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2731  DNA topoisomerase I  47.18 
 
 		 844 aa  646    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.186723  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0859  DNA topoisomerase  44.86 
 
 		 942 aa  658    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.293507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2410  DNA topoisomerase I  55.81 
 
 		 771 aa  883    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.11035 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1139  hypothetical protein  46.07 
 
 		 935 aa  645    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1011  DNA topoisomerase  47.37 
 
 		 931 aa  687    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0783808  normal  0.0479859 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0770  DNA topoisomerase  47.42 
 
 		 931 aa  681    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0112956  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0095  DNA topoisomerase I  57.03 
 
 		 743 aa  896    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000317173  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0595  DNA topoisomerase I  100 
 
 		 744 aa  1520    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2461  DNA topoisomerase  44.8 
 
 		 843 aa  630  1e-179  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1458  DNA topoisomerase I  46.46 
 
 		 827 aa  620  1e-176  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0259  DNA topoisomerase type IA central domain protein  43.88 
 
 		 864 aa  608  9.999999999999999e-173  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1964  DNA topoisomerase I  47.54 
 
 		 702 aa  586  1e-166  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23450  topoisomerase IA  40.56 
 
 		 837 aa  523  1e-147  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000217154  decreased coverage  0.0000000285044 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0335  DNA topoisomerase I  42.88 
 
 		 747 aa  515  1e-144  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1139  DNA topoisomerase type IA central domain protein  39.89 
 
 		 849 aa  511  1e-143  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.395203 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1093  DNA topoisomerase type IA central domain protein  39.33 
 
 		 837 aa  493  9.999999999999999e-139  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09220  topoisomerase IA  39.03 
 
 		 834 aa  480  1e-134  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.143894  normal  0.0154062 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0705  DNA topoisomerase  33.28 
 
 		 780 aa  357  2.9999999999999997e-97  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1699  DNA topoisomerase I  34.6 
 
 		 814 aa  352  2e-95  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2128  DNA topoisomerase, type I  29.67 
 
 		 855 aa  340  5e-92  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.572238 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0203  DNA topoisomerase I  34.09 
 
 		 814 aa  339  9.999999999999999e-92  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.698596 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0781  DNA topoisomerase I  33.69 
 
 		 812 aa  337  3.9999999999999995e-91  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.935548  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0158  DNA topoisomerase I  32.92 
 
 		 817 aa  337  3.9999999999999995e-91  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.087887  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0026  DNA topoisomerase I  31.37 
 
 		 853 aa  331  4e-89  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1359  DNA topoisomerase  33.67 
 
 		 602 aa  311  4e-83  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.013738 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0392  DNA topoisomerase  33.61 
 
 		 604 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.225119  normal  0.175863 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1735  DNA topoisomerase type IA central domain-containing protein  33.5 
 
 		 604 aa  300  6e-80  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.718005  hitchhiker  0.000823973 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1115  DNA topoisomerase  34.51 
 
 		 596 aa  299  1e-79  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0885  DNA topoisomerase  32.72 
 
 		 631 aa  291  4e-77  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0843416  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0109  DNA topoisomerase type IA central domain-containing protein  32.24 
 
 		 610 aa  288  2e-76  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.00000681889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1700  DNA topoisomerase I  31.16 
 
 		 693 aa  253  8.000000000000001e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00616947  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07540  DNA topoisomerase I  32.2 
 
 		 691 aa  248  3e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00641456  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1889  DNA topoisomerase I  30.07 
 
 		 668 aa  243  9e-63  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.806156  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1026  DNA topoisomerase I  31.58 
 
 		 697 aa  240  8e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00786254  unclonable  0.0000000108626 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2181  DNA topoisomerase I  30.06 
 
 		 693 aa  236  9e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0024842  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8810  DNA topoisomerase  28.4 
 
 		 868 aa  234  5e-60  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.917921  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1984  DNA topoisomerase I  31.82 
 
 		 710 aa  234  6e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.073944  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1674  DNA topoisomerase I  30.73 
 
 		 700 aa  233  8.000000000000001e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.121954  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34564  DNA topoisomerase  28.84 
 
 		 616 aa  233  1e-59  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.496706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1956  DNA topoisomerase I  30.73 
 
 		 700 aa  233  1e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1289  DNA topoisomerase I  30.5 
 
 		 684 aa  232  2e-59  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.781177  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1381  DNA topoisomerase I  31.3 
 
 		 696 aa  231  3e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2463  DNA topoisomerase I  30.42 
 
 		 804 aa  231  3e-59  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1310  DNA topoisomerase I  29.9 
 
 		 691 aa  230  7e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1335  DNA topoisomerase I  29.9 
 
 		 691 aa  230  7e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.419976  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1223  DNA topoisomerase I  29.57 
 
 		 697 aa  230  8e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1526  DNA topoisomerase I  30.37 
 
 		 696 aa  227  6e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000864041  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0460  DNA topoisomerase I  29.19 
 
 		 702 aa  226  1e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.159815  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2148  DNA topoisomerase I  31.16 
 
 		 868 aa  223  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25110  DNA topoisomerase I  31.16 
 
 		 868 aa  223  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0779  DNA topoisomerase I  28.85 
 
 		 706 aa  222  1.9999999999999999e-56  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000394767  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0891  DNA topoisomerase I  29.69 
 
 		 758 aa  222  1.9999999999999999e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000570299  decreased coverage  1.1513e-16 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2658  DNA topoisomerase I  32.12 
 
 		 859 aa  222  1.9999999999999999e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00218044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1551  DNA topoisomerase I  28.8 
 
 		 689 aa  221  3.9999999999999997e-56  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0171  DNA topoisomerase I  30.26 
 
 		 743 aa  220  6e-56  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3689  DNA topoisomerase I  28.8 
 
 		 756 aa  220  7e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000324271  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32265  predicted protein  27.38 
 
 		 863 aa  220  1e-55  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.142978  normal  0.982566 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0572  DNA topoisomerase I  28.86 
 
 		 686 aa  219  2e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0758735  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1102  DNA topoisomerase I  31.21 
 
 		 691 aa  219  2e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000153126  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0840  DNA topoisomerase  29.02 
 
 		 694 aa  218  2e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000150599  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2549  DNA topoisomerase I  30 
 
 		 757 aa  218  2.9999999999999998e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0550694  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0916  DNA topoisomerase I  28.76 
 
 		 693 aa  218  2.9999999999999998e-55  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000916095  hitchhiker  0.000814664 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0600  DNA topoisomerase I  29.01 
 
 		 711 aa  218  4e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00101448  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1021  DNA topoisomerase I  28.94 
 
 		 669 aa  218  4e-55  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0905515  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2058  DNA topoisomerase I  29.61 
 
 		 700 aa  217  5.9999999999999996e-55  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2296  DNA topoisomerase I  29.7 
 
 		 704 aa  216  8e-55  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14470  DNA topoisomerase I  30.63 
 
 		 868 aa  216  9e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04555  DNA topoisomerase III (Eurofung)  27.55 
 
 		 629 aa  216  9.999999999999999e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.755081  normal  0.215917 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2139  DNA topoisomerase I  31.34 
 
 		 869 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.124713 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3266  DNA topoisomerase I  29.25 
 
 		 758 aa  216  9.999999999999999e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000837338  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3603  DNA topoisomerase I  31.34 
 
 		 869 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0171104  normal  0.313127 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1679  DNA topoisomerase I  31.34 
 
 		 869 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229175 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4786  DNA topoisomerase III  28.39 
 
 		 729 aa  215  1.9999999999999998e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000176541  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1432  DNA topoisomerase I  29.55 
 
 		 865 aa  214  4.9999999999999996e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0283977  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1655  DNA topoisomerase I  31.38 
 
 		 869 aa  214  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.967668  normal  0.788315 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1841  DNA topoisomerase I  29.55 
 
 		 865 aa  214  4.9999999999999996e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.253396  hitchhiker  0.0000000000877757 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1904  DNA topoisomerase I  29.55 
 
 		 865 aa  214  4.9999999999999996e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.42777  hitchhiker  2.78185e-16 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1846  DNA topoisomerase I  29.55 
 
 		 865 aa  214  5.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.996923  normal  0.0120486 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4389  DNA topoisomerase I  29.39 
 
 		 793 aa  214  5.999999999999999e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00166014  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1614  DNA topoisomerase I  29.55 
 
 		 865 aa  214  5.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.848842  hitchhiker  0.000000000000466003 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1678  DNA topoisomerase I  28.42 
 
 		 700 aa  213  7e-54  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2289  DNA topoisomerase III  27.82 
 
 		 768 aa  213  7e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3340  DNA topoisomerase  29.14 
 
 		 853 aa  213  7.999999999999999e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.1537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2485  DNA topoisomerase I  30.64 
 
 		 692 aa  213  7.999999999999999e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000595417  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1854  DNA topoisomerase I  28.42 
 
 		 700 aa  213  9e-54  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1474  DNA topoisomerase I  28.71 
 
 		 865 aa  213  9e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00320061  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0816  DNA topoisomerase I  30.58 
 
 		 689 aa  212  2e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.996687  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1583  DNA topoisomerase I  30.05 
 
 		 868 aa  212  2e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.590699 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01250  DNA topoisomerase I  28.55 
 
 		 865 aa  211  3e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.856005  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2375  DNA topoisomerase I  28.55 
 
 		 865 aa  211  3e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000189026  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01260  hypothetical protein  28.55 
 
 		 865 aa  211  3e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.742047  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2354  DNA topoisomerase I  28.55 
 
 		 865 aa  211  3e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.01053  unclonable  0.0000000472675 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2100  DNA topoisomerase I  29.34 
 
 		 765 aa  211  3e-53  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.000378679  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1498  DNA topoisomerase I  28.55 
 
 		 865 aa  211  3e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1383  DNA topoisomerase I  28.55 
 
 		 865 aa  211  3e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1304  DNA topoisomerase I  29.27 
 
 		 708 aa  211  4e-53  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.01574  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0161  DNA topoisomerase I  27.6 
 
 		 695 aa  211  5e-53  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1346  DNA topoisomerase I  28.4 
 
 		 708 aa  211  5e-53  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000122971  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>