280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0518 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_0518  cation transporter  100 
 
 
524 aa  1063    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.608027  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1309  K+ transporter Trk  45.08 
 
 
479 aa  457  1e-127  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1063  K+ transporter Trk  43.94 
 
 
478 aa  434  1e-120  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3423  trk system potassium uptake protein  45.06 
 
 
476 aa  421  1e-116  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.386129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3429  sodium transport protein  44.02 
 
 
483 aa  395  1e-109  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000905163  normal  0.144349 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2454  potassium uptake protein, TrkH family  40.04 
 
 
481 aa  369  1e-101  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.172689  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3217  TrkH family potassium uptake protein  41.48 
 
 
482 aa  357  2.9999999999999997e-97  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2029  K+ transporter Trk  39.74 
 
 
481 aa  354  2.9999999999999997e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00911384  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1468  cation transporter  44.42 
 
 
483 aa  351  1e-95  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0735  potassium uptake protein, TrkH family  41.14 
 
 
494 aa  345  1e-93  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.832198  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0913  K+ transporter trk  39.2 
 
 
482 aa  344  2.9999999999999997e-93  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2912  TrkH family potassium uptake protein  39.49 
 
 
479 aa  342  8e-93  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000731748  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10610  cation transporter  38.07 
 
 
477 aa  339  5.9999999999999996e-92  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0386774  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0265  cation transporter  37.26 
 
 
466 aa  335  1e-90  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1969  potassium uptake protein, TrkH family  42.29 
 
 
482 aa  330  4e-89  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.938293  normal  0.091936 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0087  cation transporter  36.94 
 
 
485 aa  323  5e-87  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2906  potassium uptake protein, TrkH family  40.04 
 
 
486 aa  321  1.9999999999999998e-86  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000847661  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3184  cation transporter  34.27 
 
 
483 aa  313  5.999999999999999e-84  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0747652  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2082  cation transporter  37.61 
 
 
514 aa  312  7.999999999999999e-84  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3134  cation transporter  35.7 
 
 
510 aa  309  6.999999999999999e-83  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1208  cation transporter  36.97 
 
 
512 aa  304  2.0000000000000002e-81  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.432956  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1412  cation transporter  34.75 
 
 
516 aa  305  2.0000000000000002e-81  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0698  cation transporter  37.08 
 
 
505 aa  303  6.000000000000001e-81  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0013  TrkH family potassium uptake protein  36.64 
 
 
482 aa  301  2e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0268571 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0107  cation transporter  36.67 
 
 
485 aa  300  5e-80  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1061  cation transporter  38.19 
 
 
494 aa  300  6e-80  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.316379  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0088  Trk system potassium uptake protein TrkH  37.07 
 
 
480 aa  297  4e-79  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2905  cation transporter  38.04 
 
 
485 aa  296  4e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.313942  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0028  cation transporter  36.47 
 
 
481 aa  296  6e-79  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12238  putative potassium uptake protein  36.03 
 
 
498 aa  296  8e-79  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.590421  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1060  cation transporter  35.63 
 
 
495 aa  293  4e-78  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0768  cation transporter  36.94 
 
 
473 aa  293  6e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.369941 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00018  Trk system potassium uptake protein TrkH  35.96 
 
 
483 aa  292  1e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0029  Trk system potassium uptake protein, putative  36.65 
 
 
481 aa  291  2e-77  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.725548  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_28  cation transport protein, Trk system  35.9 
 
 
481 aa  290  5.0000000000000004e-77  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1876  cation transporter  34 
 
 
520 aa  286  9e-76  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.265158 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3436  cation transporter  38.95 
 
 
478 aa  284  2.0000000000000002e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1184  cation transporter  35.98 
 
 
512 aa  283  6.000000000000001e-75  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.543653  hitchhiker  0.000000321699 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5095  cation transporter  34.03 
 
 
491 aa  282  9e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0015  Trk system potassium uptake protein TrkH  37.23 
 
 
483 aa  282  1e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0202  potassium uptake protein, TrkH family  39.66 
 
 
483 aa  282  1e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0485488  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0654  TrkH family potassium uptake protein  36.44 
 
 
481 aa  281  2e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.77805  normal  0.145227 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0242  K+ transporter Trk  34.89 
 
 
483 aa  280  4e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2266  potassium uptake protein, TrkH family  40.08 
 
 
484 aa  280  4e-74  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.644044  normal  0.0494123 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4081  cation transporter  37.23 
 
 
491 aa  277  3e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0021  TrkH family potassium uptake protein  35.07 
 
 
485 aa  276  4e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0035  TrkH family potassium uptake protein  35.2 
 
 
485 aa  277  4e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.161257  normal  0.16596 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3505  cation transporter  33.08 
 
 
485 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0022  TrkH family potassium uptake protein  35.01 
 
 
485 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00747974  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0026  TrkH family potassium uptake protein  34.7 
 
 
485 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0293301  normal  0.0416133 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0017  potassium uptake protein TrkH  37.13 
 
 
482 aa  273  4.0000000000000004e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000733585  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3474  cation transporter  35.48 
 
 
514 aa  271  2e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0877614  normal  0.0193815 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0197  potassium uptake protein, TrkH family protein  35.12 
 
 
488 aa  271  2.9999999999999997e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.846232  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4543  cation transporter  35.87 
 
 
498 aa  270  4e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1370  cation transporter  33.76 
 
 
479 aa  270  4e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00804508  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2976  Trk system potassium uptake protein TrkH  35.21 
 
 
485 aa  270  7e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0016  potassium uptake protein TrkH  35.43 
 
 
483 aa  269  8.999999999999999e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2041  TrkH family potassium uptake protein  35.74 
 
 
485 aa  268  1e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.505265  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0024  potassium uptake protein TrkH  36.28 
 
 
486 aa  268  1e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0024  TrkH family potassium uptake protein  33.89 
 
 
485 aa  268  2e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.981015  normal  0.0103181 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1185  cation transporter  34.33 
 
 
502 aa  267  2.9999999999999995e-70  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000630162 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0016  potassium uptake protein, TrkH family protein  34.32 
 
 
485 aa  267  4e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.339355  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0019  TrkH family potassium uptake protein  35.77 
 
 
485 aa  266  8.999999999999999e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000172617  normal  0.0765099 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0021  TrkH family potassium uptake protein  35.77 
 
 
485 aa  265  1e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000191681  hitchhiker  0.00118285 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0027  TrkH family potassium uptake protein  35.77 
 
 
485 aa  265  1e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0260602  hitchhiker  0.0000000366479 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0186  K+ transporter Trk  34.77 
 
 
483 aa  264  2e-69  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.568155  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4231  potassium transporter  36.18 
 
 
483 aa  264  3e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00335322  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0018  K+ transporter Trk  34.88 
 
 
485 aa  264  3e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0016  TrkH family potassium uptake protein  35 
 
 
485 aa  264  3e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.917288  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3946  potassium transporter  36.7 
 
 
483 aa  264  3e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000895633  decreased coverage  0.00222416 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4041  potassium transporter  35.99 
 
 
483 aa  263  6.999999999999999e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.011777  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0023  potassium uptake protein, TrkH family  35.07 
 
 
485 aa  263  8e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000299675 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0024  TrkH family potassium uptake protein  35.07 
 
 
485 aa  263  8e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0989593  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0023  TrkH family potassium uptake protein  35.07 
 
 
485 aa  263  8e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.211854  normal  0.0148489 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0019  TrkH family potassium uptake protein  35.07 
 
 
485 aa  263  8e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.195703  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4132  potassium uptake protein, TrkH family  36.47 
 
 
483 aa  262  1e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000031848  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4368  potassium transporter  36.47 
 
 
483 aa  262  1e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000385721  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4161  potassium transporter  36.47 
 
 
483 aa  262  1e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00100489  decreased coverage  0.00000337879 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4072  potassium transporter  36.47 
 
 
483 aa  262  1e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000258715  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4319  potassium transporter  36.47 
 
 
483 aa  262  1e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000419761  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5288  potassium transporter  36.47 
 
 
483 aa  262  1e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000758223  normal  0.0471596 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03740  potassium transporter  36.47 
 
 
483 aa  261  2e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0315647  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4265  potassium transporter  35.9 
 
 
483 aa  261  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0305009  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4216  potassium transporter  35.9 
 
 
483 aa  261  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000196268  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4193  potassium transporter  35.9 
 
 
483 aa  261  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000606727  normal  0.556467 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4312  potassium transporter  35.9 
 
 
483 aa  261  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0637309  normal  0.15299 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03689  hypothetical protein  36.47 
 
 
483 aa  261  2e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.025775  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4230  potassium transporter  36.47 
 
 
483 aa  261  2e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000116067  normal  0.0142841 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4372  potassium transporter  35.9 
 
 
483 aa  261  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0170672  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0016  TrkH family potassium uptake protein  36.69 
 
 
483 aa  259  9e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.81784  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2536  potassium uptake protein TrkH  35.99 
 
 
485 aa  258  2e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000177354  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3898  potassium transporter  36.23 
 
 
483 aa  258  2e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000274395  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5998  cation transporter  35.82 
 
 
488 aa  257  4e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00443617 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2873  K+ transporter Trk  37.61 
 
 
482 aa  256  5e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3744  potassium transporter  36.8 
 
 
483 aa  256  6e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000338344  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2078  potassium uptake protein, TrkH family  34.07 
 
 
483 aa  256  8e-67  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1730  cation transporter  34.01 
 
 
509 aa  255  1.0000000000000001e-66  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3911  cation transporter  34.22 
 
 
488 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.874012 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1271  cation transporter  37.18 
 
 
478 aa  252  1e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0599313  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3260  cation transporter  34.03 
 
 
488 aa  251  2e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.208251  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>