More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0468 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009634  Mevan_1002  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  64.92 
 
 
533 aa  736    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0425  Na+/solute symporter  62.1 
 
 
530 aa  636    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0975  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  67.73 
 
 
533 aa  721    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0468  Na+/solute symporter  100 
 
 
528 aa  1051    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.280127  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0971  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  67.35 
 
 
533 aa  718    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1706  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  68.11 
 
 
533 aa  725    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3721  sodium:proline symporter (proline permease)  59.16 
 
 
553 aa  615  1e-175  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0036  Na+ symporter  56.9 
 
 
537 aa  581  1.0000000000000001e-165  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.90526  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2326  Na+/solute symporter  54.94 
 
 
520 aa  556  1e-157  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0034  Na+/solute symporter  54.65 
 
 
543 aa  531  1e-149  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.404882  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0037  Na+/solute symporter  55.09 
 
 
543 aa  530  1e-149  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1847  Na+/solute symporter  53.66 
 
 
543 aa  529  1e-149  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.145671  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0049  Na+/solute symporter  55.11 
 
 
543 aa  529  1e-149  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1134  Na+/solute symporter  53.49 
 
 
527 aa  529  1e-149  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1337  sodium/proline symporter (proline permease)  51.43 
 
 
531 aa  491  1e-137  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1063  hypothetical protein  50.31 
 
 
526 aa  442  1e-123  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.771513 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0408  Na+/proline symporter-like protein  61.29 
 
 
377 aa  184  4.0000000000000006e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3191  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.54 
 
 
504 aa  174  3.9999999999999995e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.205305  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1759  Na+ symporter  30.71 
 
 
531 aa  168  2e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2279  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.27 
 
 
504 aa  158  2e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.257788  hitchhiker  0.0000218485 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1675  sodium/proline permease  27.06 
 
 
489 aa  151  2e-35  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1854  sodium/proline permease  26.84 
 
 
489 aa  152  2e-35  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.794377  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1494  sodium/proline permease  27.06 
 
 
489 aa  151  3e-35  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.858456  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3090  Na+/solute symporter  25 
 
 
508 aa  150  5e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000664536  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1220  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.95 
 
 
489 aa  150  8e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0735  Na+/solute symporter  25.2 
 
 
489 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2308  sodium/proline symporter  23.9 
 
 
492 aa  146  1e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.591948  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07099  hypothetical protein  27.49 
 
 
518 aa  145  2e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1464  Na+/solute symporter  24.41 
 
 
489 aa  144  5e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.675757  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3490  sodium/proline symporter  26.89 
 
 
498 aa  143  6e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.753009  normal  0.0181041 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3752  sodium/proline symporter family protein  23.92 
 
 
492 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4420  sodium/panthothenate symporter  26.3 
 
 
481 aa  142  9.999999999999999e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0607009  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0734  sodium/proline symporter  26.58 
 
 
492 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1961  sodium/proline symporter  25.81 
 
 
482 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0044995 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3331  sodium/proline symporter  24.46 
 
 
487 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.825412  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3673  sodium/proline symporter family protein  24.35 
 
 
492 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.257529  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3396  sodium/proline symporter  24.35 
 
 
493 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.435875  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3347  sodium/proline symporter  24.35 
 
 
493 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1465  sodium/proline symporter  25.61 
 
 
492 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3435  sodium/proline symporter family protein  24.35 
 
 
493 aa  141  3e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3705  sodium/proline symporter family protein  24.35 
 
 
492 aa  141  3e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.338299  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3655  sodium/proline symporter family protein  24.35 
 
 
492 aa  141  3e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3677  sodium/proline symporter family protein  24.13 
 
 
492 aa  140  6e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.289137  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1221  sodium/proline symporter  25.42 
 
 
492 aa  140  7.999999999999999e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0364  sodium/proline symporter  25.72 
 
 
493 aa  139  8.999999999999999e-32  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1440  proline permease  24.91 
 
 
511 aa  139  1e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0406998  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1250  sodium/proline symporter  26.25 
 
 
496 aa  139  1e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.654808  normal  0.469552 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1564  sodium/proline symporter family protein  24.13 
 
 
492 aa  138  2e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.286578 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3463  proline/sodium symporter  26.39 
 
 
495 aa  138  2e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3386  sodium/proline symporter  25.43 
 
 
484 aa  138  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1415  SSS family Na(+)/proline symporter  28.07 
 
 
499 aa  137  4e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.631202 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0612  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.81 
 
 
503 aa  136  7.000000000000001e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000214976  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3516  sodium/proline symporter  25.76 
 
 
485 aa  136  9e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0554  sodium/proline symporter  27.43 
 
 
493 aa  136  9e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0171  sodium/proline symporter  26.35 
 
 
496 aa  136  9.999999999999999e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1209  sodium/panthothenate symporter  25.69 
 
 
484 aa  136  9.999999999999999e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00169799  normal  0.818802 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0389  sodium/panthothenate symporter  25.69 
 
 
484 aa  136  9.999999999999999e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00229851  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0455  sodium/panthothenate symporter  25.69 
 
 
484 aa  136  9.999999999999999e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4055  sodium/proline symporter family protein  24.62 
 
 
492 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000025968  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3686  sodium/panthothenate symporter  25.82 
 
 
483 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.925299  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54150  sodium/proline symporter PutP  25.34 
 
 
506 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3696  sodium/panthothenate symporter  26.33 
 
 
483 aa  135  3e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.417916  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1314  sodium/proline symporter family protein  24.72 
 
 
492 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.01893e-22 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1134  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  24.72 
 
 
492 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000164333  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1289  sodium/proline symporter family protein  23.72 
 
 
492 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000753427  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1154  sodium/proline symporter family protein  24.54 
 
 
492 aa  134  5e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000094389  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1391  sodium/proline symporter family protein  24.54 
 
 
492 aa  134  5e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000288563  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1246  sodium/proline symporter family protein  24.54 
 
 
492 aa  134  5e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000709794  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001019  proline/sodium symporter PutP  26.04 
 
 
497 aa  134  6e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.858432  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03116  sodium/panthothenate symporter  27.08 
 
 
483 aa  133  6.999999999999999e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.735141  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0448  sodium/pantothenate symporter  27.08 
 
 
483 aa  133  6.999999999999999e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.293948  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0448  sodium/panthothenate symporter  27.08 
 
 
483 aa  133  6.999999999999999e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.024979  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4575  sodium/panthothenate symporter  27.08 
 
 
483 aa  133  6.999999999999999e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000690231  normal  0.130163 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03067  hypothetical protein  27.08 
 
 
483 aa  133  6.999999999999999e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.647307  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3450  sodium/panthothenate symporter  27.08 
 
 
483 aa  133  6.999999999999999e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000724112  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3742  sodium/panthothenate symporter  27.08 
 
 
483 aa  133  6.999999999999999e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150129  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1128  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  23.72 
 
 
492 aa  133  9e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000418657  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1653  sodium/proline symporter  25.19 
 
 
511 aa  133  9e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3574  sodium/panthothenate symporter  27.08 
 
 
483 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1957  high affinity proline permease  24.33 
 
 
512 aa  132  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0244  sodium/panthothenate symporter  26.24 
 
 
483 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3844  sodium/panthothenate symporter  25.87 
 
 
483 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.325661  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3645  sodium/panthothenate symporter  27.08 
 
 
483 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00060524 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3553  sodium/panthothenate symporter  27.08 
 
 
483 aa  133  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000280994  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3742  sodium/panthothenate symporter  27.08 
 
 
483 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.133198 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1242  sodium/proline symporter  26.19 
 
 
491 aa  133  1.0000000000000001e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1991  high affinity proline permease  24.33 
 
 
512 aa  132  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0240  sodium/panthothenate symporter  26.24 
 
 
483 aa  133  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1939  sodium/proline symporter  25.2 
 
 
498 aa  132  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3680  sodium/panthothenate symporter  27.08 
 
 
483 aa  132  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.433126 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4736  sodium/proline symporter PutP  26.26 
 
 
506 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.865445  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2686  sodium/proline symporter  26.71 
 
 
486 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0529769  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3573  sodium/panthothenate symporter  27.08 
 
 
483 aa  132  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0131777  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3641  sodium/panthothenate symporter  26.84 
 
 
483 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000698464  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2435  sodium/proline symporter  26.27 
 
 
483 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.015008  hitchhiker  0.00456377 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0552  sodium/pantothenate symporter  25.52 
 
 
482 aa  130  5.0000000000000004e-29  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1326  Sodium/proline symporter  26.75 
 
 
488 aa  130  6e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0529188  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1353  sodium/proline symporter family protein  24.3 
 
 
492 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000718577  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2177  sodium/proline symporter  25.38 
 
 
482 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000107736  normal  0.0804917 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2608  sodium/proline symporter  26.21 
 
 
483 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0498264  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>