More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0455 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_0455  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  100 
 
 
428 aa  844    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0647  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  62.12 
 
 
429 aa  532  1e-150  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.101947  normal  0.0867495 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1170  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  64.41 
 
 
413 aa  530  1e-149  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0707  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  61.94 
 
 
428 aa  516  1.0000000000000001e-145  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.172064 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0744  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  63.44 
 
 
429 aa  513  1e-144  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.225207  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2121  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  60.71 
 
 
428 aa  504  9.999999999999999e-143  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0457  Orotidine 5'-phosphate decarboxylase  56.6 
 
 
426 aa  472  1e-132  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1453  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  56.6 
 
 
427 aa  465  9.999999999999999e-131  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.395706 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1403  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  52.1 
 
 
438 aa  429  1e-119  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.175956  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0321  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  51.87 
 
 
438 aa  429  1e-119  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0516  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  51.17 
 
 
438 aa  427  1e-118  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.35671  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0582  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  50.81 
 
 
437 aa  422  1e-117  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.062003  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2812  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  39.13 
 
 
210 aa  147  5e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2736  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  39.13 
 
 
210 aa  147  5e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0593  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  39.61 
 
 
210 aa  145  1e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0607  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  39.61 
 
 
210 aa  145  1e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0216  hexulose-6-phosphate synthase, putative  39.13 
 
 
210 aa  145  2e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2273  Orotidine 5'-phosphate decarboxylase  37.02 
 
 
240 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3708  hexulose-6-phosphate synthase  39.02 
 
 
207 aa  140  4.999999999999999e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1123  dimethylmenaquinone methyltransferase  40.72 
 
 
192 aa  139  7e-32  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1184  Orotidine 5'-phosphate decarboxylase  38.54 
 
 
225 aa  134  3e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0998927  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2929  3-hexulose-6-phosphate synthase  38.35 
 
 
211 aa  134  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000015488 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1849  3-hexulose-6-phosphate synthase  36.23 
 
 
212 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0250  hexulose-6-phosphate synthase  38.54 
 
 
228 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.00000000013709  normal  0.0274377 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2738  hexulose-6-phosphate synthase/SIS domain-containing protein  37.14 
 
 
389 aa  130  6e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3043  hexulose-6-phosphate synthase  34.45 
 
 
215 aa  127  3e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.146405  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3049  hexulose-6-phosphate synthase  34.45 
 
 
215 aa  127  3e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3212  3-hexulose-6-phosphate synthase  35.44 
 
 
211 aa  125  2e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1654  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  38.42 
 
 
209 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000168104  normal  0.271517 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5671  Orotidine 5'-phosphate decarboxylase  38.92 
 
 
211 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.587401 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2302  Dimethylmenaquinone methyltransferase  33.49 
 
 
225 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1871  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  38.86 
 
 
217 aa  116  8.999999999999998e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.563194  normal  0.356021 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38400  4-carboxy-4-hydroxy-2-oxoadipate aldolase  35.21 
 
 
233 aa  115  1.0000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2429  putative dimethylmenaquinone methyltransferase  33 
 
 
235 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.433884 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0996  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  34.84 
 
 
403 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.566431 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0227  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  35.35 
 
 
227 aa  114  4.0000000000000004e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  decreased coverage  0.0096121 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0823  Dimethylmenaquinone methyltransferase  35.61 
 
 
229 aa  112  9e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0708  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  39.18 
 
 
222 aa  110  3e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.942951  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1085  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  36.67 
 
 
393 aa  111  3e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.136979  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1628  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  36.15 
 
 
393 aa  110  7.000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1611  hypothetical protein  38.8 
 
 
224 aa  109  8.000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.642734  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0479  dimethylmenaquinone methyltransferase  39.75 
 
 
234 aa  109  9.000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.145449  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1686  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  40.4 
 
 
221 aa  108  1e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0279692 
 
 
-
 
NC_003296  RS03175  putative transferase protein  31.55 
 
 
216 aa  108  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.191246 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1994  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  35.81 
 
 
396 aa  108  2e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0988  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  38.5 
 
 
392 aa  107  3e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4023  Dimethylmenaquinone methyltransferase  39.47 
 
 
198 aa  107  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0575059 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5004  Dimethylmenaquinone methyltransferase  36.76 
 
 
219 aa  107  5e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.205814  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3204  hypothetical protein  32.02 
 
 
237 aa  107  5e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.295684  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3165  hypothetical protein  34.92 
 
 
225 aa  106  9e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.25915  normal  0.552325 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8321  hypothetical protein  33.85 
 
 
224 aa  105  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.242879  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4138  hypothetical protein  34.87 
 
 
224 aa  105  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0772  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  36.57 
 
 
393 aa  105  2e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.58783 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3078  hypothetical protein  35.2 
 
 
215 aa  104  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.177547  normal  0.0349255 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3070  dimethylmenaquinone methyltransferase  31.31 
 
 
239 aa  103  6e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2988  hypothetical protein  35.06 
 
 
212 aa  102  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5620  hypothetical protein  36.41 
 
 
224 aa  102  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.446281  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2031  hypothetical protein  35.08 
 
 
229 aa  102  1e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.701424  normal  0.731044 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1036  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  35.1 
 
 
393 aa  101  2e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0590  dimethylmenaquinone methyltransferase  34.01 
 
 
206 aa  101  3e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.246427  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0568  hexulose-6-phosphate synthase  37.86 
 
 
217 aa  100  3e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1367  hypothetical protein  35.63 
 
 
212 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.797673 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0935  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  34.74 
 
 
392 aa  100  5e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0033619  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5742  4-carboxy-4-hydroxy-2-oxoadipate aldolase/oxaloacetate decarboxylase  38.46 
 
 
235 aa  100  5e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228064  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2726  dimethylmenaquinone methyltransferase  35.16 
 
 
233 aa  100  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.305233  normal  0.0255457 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1131  Dimethylmenaquinone methyltransferase  35.48 
 
 
450 aa  100  5e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1830  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  35.44 
 
 
221 aa  100  5e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.000143542  normal  0.0955115 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1057  dimethylmenaquinone methyltransferase  36.82 
 
 
230 aa  99.8  9e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0092  hypothetical protein  34.09 
 
 
237 aa  99.4  1e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04570  Dimethylmenaquinone methyltransferase  32.63 
 
 
231 aa  99  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0093  hypothetical protein  34.09 
 
 
237 aa  99.4  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4121  hypothetical protein  34.09 
 
 
237 aa  99.4  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6375  Dimethylmenaquinone methyltransferase  31.47 
 
 
224 aa  99.4  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.830889  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7077  hypothetical protein  31.98 
 
 
224 aa  98.2  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.373269  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6071  Dimethylmenaquinone methyltransferase  31.12 
 
 
209 aa  99  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3633  hypothetical protein  33.67 
 
 
231 aa  99  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.715784 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2610  DlpA protein (isocitrate and isopropylmalate dehydrogenase family protein)  31.61 
 
 
615 aa  98.2  3e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3043  dimethylmenaquinone methyltransferase  29.65 
 
 
217 aa  97.8  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0609983  normal  0.81356 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6359  hypothetical protein  32.46 
 
 
223 aa  97.4  4e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.664548  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3398  hypothetical protein  29.15 
 
 
217 aa  97.4  5e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0614  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  35.92 
 
 
391 aa  97.1  6e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0718  dimethylmenaquinone methyltransferase  36.31 
 
 
232 aa  97.1  6e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.287716 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0600  dimethylmenaquinone methyltransferase  31.66 
 
 
212 aa  96.7  7e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.200875  normal  0.605092 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0782  dimethylmenaquinone methyltransferase  31.28 
 
 
230 aa  96.7  7e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2380  Dimethylmenaquinone methyltransferase  31.61 
 
 
225 aa  96.3  9e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05389  hypothetical protein  36.07 
 
 
224 aa  96.3  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.969658 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2737  DlpA protein (isocitrate and isopropylmalate dehydrogenase family protein)  29.38 
 
 
615 aa  96.3  1e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2817  hypothetical protein  31.38 
 
 
246 aa  95.9  1e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00663011  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5818  Dimethylmenaquinone methyltransferase  35.79 
 
 
205 aa  95.5  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.95078  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3360  hypothetical protein  35.96 
 
 
227 aa  95.1  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2021  dimethylmenaquinone methyltransferase  35.58 
 
 
207 aa  95.1  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4544  Dimethylmenaquinone methyltransferase  32.32 
 
 
224 aa  94.7  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0521479 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2713  hypothetical protein  31.79 
 
 
225 aa  94.4  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3330  Dimethylmenaquinone methyltransferase  39.05 
 
 
187 aa  94  5e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00629512  hitchhiker  0.00927327 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3207  hypothetical protein  35.08 
 
 
234 aa  93.2  7e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1080  Dimethylmenaquinone methyltransferase  32.35 
 
 
211 aa  93.2  8e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.438653  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2698  hypothetical protein  39.22 
 
 
227 aa  93.2  8e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.275881  normal  0.549392 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1928  dimethylmenaquinone methyltransferase  33.83 
 
 
205 aa  92.8  9e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.787476  hitchhiker  0.00228762 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2595  dimethylmenaquinone methyltransferase  34.48 
 
 
214 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.233202  normal  0.0150899 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8625  Dimethylmenaquinone methyltransferase  33.51 
 
 
236 aa  92.8  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.422142  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>