More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0446 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_0446  ABC transporter related  100 
 
 
266 aa  544  1e-154  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.435384  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4301  ABC transporter related  46.4 
 
 
256 aa  224  1e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2262  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  41.92 
 
 
269 aa  222  4e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.644524 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1423  ABC transporter related  42.91 
 
 
260 aa  221  9.999999999999999e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.226546 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1694  ABC transporter related  44.18 
 
 
278 aa  217  2e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.055567  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4153  ABC transporter related  43.85 
 
 
257 aa  214  8e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0112212  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0371  ABC transporter related  42.8 
 
 
253 aa  214  9e-55  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.176524  normal  0.348572 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3844  ABC transporter related  43.85 
 
 
257 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.239665  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0233  ABC transporter related  42.41 
 
 
253 aa  214  9.999999999999999e-55  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0495  ABC transporter related  41.76 
 
 
256 aa  210  2e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0931596  normal  0.520418 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0509  iron compounds ABC transporter, ATP-binding protein  39.62 
 
 
256 aa  209  3e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0027  ABC transporter-related protein  42.15 
 
 
277 aa  209  4e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47160  ABC transporter  42.06 
 
 
265 aa  207  1e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.321704  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3704  ABC transporter related  40.71 
 
 
278 aa  205  6e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.591184  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2081  ABC transporter related  44 
 
 
257 aa  204  9e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0496  ABC Fe3+-siderophore transporter, ATPase subunit  41.38 
 
 
256 aa  204  2e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.863576  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26450  ABC transporter protein  41.46 
 
 
264 aa  201  8e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.627972  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2736  ABC transporter related  44.22 
 
 
261 aa  201  8e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1993  ABC transporter related  38.93 
 
 
269 aa  201  9.999999999999999e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1595  ABC transporter related  43.88 
 
 
285 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2018  ABC transporter related  39.53 
 
 
277 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1749  ABC transporter related  35.91 
 
 
253 aa  196  5.000000000000001e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1472  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  36.03 
 
 
269 aa  195  6e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2615  ABC transporter related  36.58 
 
 
258 aa  192  6e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0446  ABC transporter related  37.74 
 
 
266 aa  192  6e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0864  ABC transporter related  38.19 
 
 
257 aa  191  8e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4650  ABC transporter related  46.86 
 
 
261 aa  191  1e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.499061  hitchhiker  0.000876955 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4264  ABC transporter related  38.31 
 
 
268 aa  191  2e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0129332  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01870  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  41.37 
 
 
322 aa  188  5.999999999999999e-47  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.110176 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5520  ABC transporter related  44.21 
 
 
261 aa  188  7e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.293027  normal  0.195209 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3223  ABC transporter component  40.73 
 
 
274 aa  187  1e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1719  hypothetical protein  36.82 
 
 
259 aa  186  3e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.97888  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1545  ABC transporter, ATPase subunit  41.3 
 
 
268 aa  186  4e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3528  ABC transporter related  37.07 
 
 
444 aa  185  7e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2397  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  42.11 
 
 
255 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.497702 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0432  ABC transporter related  35.94 
 
 
262 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1206  ABC transporter related  38.04 
 
 
263 aa  182  5.0000000000000004e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000129248 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1491  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  38.04 
 
 
263 aa  182  5.0000000000000004e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0987  ABC transporter related  38.17 
 
 
264 aa  182  7e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.343956  normal  0.294383 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2328  ABC transporter related  41.25 
 
 
272 aa  181  1e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.129327 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1651  ABC transporter-related protein  39.92 
 
 
276 aa  181  1e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1120  ABC transporter related  37.11 
 
 
260 aa  181  1e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000857475  hitchhiker  0.000000000136926 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1172  iron ABC transporter, ATP-binding protein  40.6 
 
 
259 aa  180  2e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1426  ABC transporter related  40.82 
 
 
254 aa  178  8e-44  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.883261  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0814  putative iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  37.65 
 
 
257 aa  178  9e-44  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00224462  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1378  hypothetical protein  37.21 
 
 
409 aa  178  9e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00009791  normal  0.0246408 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1642  ABC transporter related protein  40.64 
 
 
274 aa  178  9e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.019566  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1752  ABC transporter related protein  38 
 
 
266 aa  176  3e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0105422  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1152  multi anti extrusion protein MatE  40.15 
 
 
255 aa  176  3e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1049  ABC cobalamin/Fe3+-siderophores transporter, ATPase subunit  37.4 
 
 
250 aa  175  5e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0442  ABC transporter related  36.54 
 
 
261 aa  175  7e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0298  ABC transporter related  37.9 
 
 
266 aa  175  9e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2015  ABC transporter related protein  36.55 
 
 
278 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00270172  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1987  ABC transporter related  41.06 
 
 
261 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1193  ABC transporter related protein  39.31 
 
 
250 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1949  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  37.96 
 
 
252 aa  172  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0406982 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1464  ABC transporter related  40.65 
 
 
255 aa  172  3.9999999999999995e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1095  ABC cobalamin/Fe3+-siderophores transporter, ATPase subunit  34.68 
 
 
262 aa  171  9e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.927351  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1543  ABC transporter related  35.46 
 
 
262 aa  171  1e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0289  ABC transporter related  35.14 
 
 
268 aa  171  1e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.137233  normal  0.108159 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1932  ABC transporter related  35.89 
 
 
266 aa  170  2e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5559  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  35.63 
 
 
270 aa  170  3e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5510  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  35.63 
 
 
270 aa  170  3e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5473  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  35.63 
 
 
270 aa  169  3e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5061  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  35.63 
 
 
270 aa  169  3e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5078  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  35.63 
 
 
270 aa  170  3e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2394  iron ABC transporter, ATP-binding protein  36.11 
 
 
290 aa  170  3e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0955  ABC transporter related  37.5 
 
 
271 aa  170  3e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1472  ABC transporter related  37.92 
 
 
280 aa  170  3e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.140058  normal  0.304695 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2416  ABC transporter related  35.57 
 
 
273 aa  169  4e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.118562 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1286  sensor histidine kinase  35.48 
 
 
258 aa  169  4e-41  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00496781  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1463  ABC transporter related  39.2 
 
 
264 aa  169  5e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5230  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  35.63 
 
 
270 aa  169  6e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5629  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  35.63 
 
 
270 aa  169  6e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1319  ABC transporter related  36.1 
 
 
258 aa  169  6e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0114884 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1214  ABC transporter related  38.55 
 
 
274 aa  169  6e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.719028  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0187  ABC transporter related  36.05 
 
 
275 aa  168  9e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.184625  normal  0.796471 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5174  ABC transporter related  35.63 
 
 
270 aa  167  1e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5504  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  35.63 
 
 
270 aa  167  1e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0155  ATP-binding component of ferric enterobactin transport  41.06 
 
 
279 aa  168  1e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0810  putative ferrichrome ABC transporter, ATP-binding protein  34.52 
 
 
260 aa  167  1e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.024008  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0781  iron(III) dicitrate transport permease-like protein yusV  33.33 
 
 
258 aa  167  1e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.215395  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3902  ABC transporter-related protein  35.22 
 
 
270 aa  168  1e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1284  ABC transporter related  35.59 
 
 
276 aa  167  2e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0797  ferrichrome ABC transporter ATP-binding protein  34.13 
 
 
260 aa  167  2e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.274021  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5447  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  35.22 
 
 
270 aa  167  2e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.753542  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1201  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  33.85 
 
 
257 aa  167  2e-40  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.173549  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1258  ABC transporter related  38.75 
 
 
412 aa  167  2e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0754  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  38.71 
 
 
265 aa  166  5e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0648275  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2830  ABC transporter-like  35.66 
 
 
268 aa  166  5e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.652667  normal  0.515297 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1821  ABC transporter related  35.91 
 
 
274 aa  165  5.9999999999999996e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.77339  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1134  ABC transporter related  37.6 
 
 
250 aa  165  5.9999999999999996e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00501593  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0601  putative iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  37.7 
 
 
245 aa  165  9e-40  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1042  hypothetical protein  34.15 
 
 
260 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.660345  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2074  ABC transporter, ATPase subunit  36.69 
 
 
276 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3607  ABC transporter related protein  38.84 
 
 
536 aa  164  1.0000000000000001e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4682  ferric enterobactin transport ATP-binding protein FepC  34.4 
 
 
273 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.207042  hitchhiker  1.64862e-21 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1285  ABC transporter related  42.13 
 
 
247 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.562669 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2100  ABC transporter-related protein  38.68 
 
 
262 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0221  ABC transporter related  34.11 
 
 
252 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.785412 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>