More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0433 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_0433  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 
365 aa  751    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.293902  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0105  radical SAM domain-containing protein  31.91 
 
 
290 aa  145  1e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.287918  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1270  radical SAM domain-containing protein  32.17 
 
 
344 aa  138  2e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.391836  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1017  Radical SAM domain protein  28.53 
 
 
345 aa  122  9e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1280  Radical SAM domain protein  30.12 
 
 
346 aa  120  3e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  29.38 
 
 
380 aa  113  5e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  30.7 
 
 
380 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0409  radical SAM domain-containing protein  28 
 
 
439 aa  110  5e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0029  Radical SAM domain protein  29.53 
 
 
452 aa  106  6e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1909  radical SAM domain-containing protein  26.23 
 
 
450 aa  105  1e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00558063  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0534  Radical SAM domain protein  26.25 
 
 
447 aa  105  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00011095  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2198  radical SAM domain-containing protein  26.23 
 
 
457 aa  105  2e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  28.53 
 
 
389 aa  104  3e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0969  radical SAM domain-containing protein  28.57 
 
 
377 aa  103  4e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0623  Radical SAM domain protein  27.78 
 
 
453 aa  103  5e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000646743  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3559  radical SAM domain-containing protein  29.09 
 
 
347 aa  102  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.152847  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1460  radical SAM domain-containing protein  25.42 
 
 
461 aa  102  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000686349  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0679  Radical SAM domain protein  26.59 
 
 
462 aa  102  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  30.5 
 
 
384 aa  100  3e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1008  Radical SAM domain protein  28.53 
 
 
460 aa  99  1e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2423  radical SAM family protein  28.85 
 
 
473 aa  96.7  6e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000017109  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0609  radical SAM domain-containing protein  29.71 
 
 
384 aa  96.3  7e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4272  Radical SAM domain protein  28.53 
 
 
337 aa  96.3  7e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0912  Radical SAM domain protein  27.5 
 
 
367 aa  95.5  1e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0100915  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2159  radical SAM domain-containing protein  29.25 
 
 
330 aa  95.5  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0939338  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3298  radical SAM domain-containing protein  25.6 
 
 
450 aa  95.9  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000268991  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0328  Radical SAM domain protein  37.67 
 
 
468 aa  94.7  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0069  Radical SAM domain protein  25.37 
 
 
452 aa  94.7  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000122492  hitchhiker  0.00745391 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1786  Radical SAM domain protein  25.28 
 
 
489 aa  94  3e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0257396  hitchhiker  0.00364528 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0945  Radical SAM domain protein  28.24 
 
 
453 aa  93.6  5e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00793831  normal  0.0982171 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0906  radical SAM family protein  23.74 
 
 
450 aa  93.2  6e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000066146  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3029  radical SAM family protein  28.65 
 
 
484 aa  92.8  9e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.0038885  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1580  Radical SAM domain protein  26.69 
 
 
429 aa  92.4  1e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0862  radical SAM domain-containing protein  27.66 
 
 
317 aa  91.7  2e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000001092  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  27.72 
 
 
399 aa  92  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0691  radical SAM domain-containing protein  28.96 
 
 
333 aa  91.3  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1837  Radical SAM domain protein  31.55 
 
 
518 aa  91.3  2e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.654863  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2076  Radical SAM domain protein  29.48 
 
 
382 aa  91.3  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2372  Radical SAM domain protein  26.25 
 
 
463 aa  90.9  3e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.545422  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4919  Radical SAM domain protein  25.29 
 
 
476 aa  90.9  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000220499  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11630  predicted Fe-S oxidoreductase  28.53 
 
 
397 aa  89  1e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.790216 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0871  radical SAM domain-containing protein  24.93 
 
 
489 aa  89  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.128121  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2677  radical SAM domain-containing protein  34.9 
 
 
464 aa  89  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.773927  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2425  radical SAM domain-containing protein  25.6 
 
 
434 aa  88.2  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.200383  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2395  Radical SAM domain protein  25.15 
 
 
394 aa  87.8  3e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0515  radical SAM domain-containing protein  24.76 
 
 
400 aa  87.4  3e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000107878  hitchhiker  0.000774187 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3056  radical SAM domain-containing protein  34.91 
 
 
393 aa  87.4  4e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.228039 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10707  coenzyme PQQ synthesis protein E pqqE  27.38 
 
 
391 aa  86.7  6e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0095  radical SAM domain-containing protein  24.85 
 
 
316 aa  86.3  8e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0204398  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1246  radical SAM family protein  25.82 
 
 
432 aa  85.9  9e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0936067  normal  0.0177716 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1520  radical SAM domain-containing protein  25.26 
 
 
351 aa  85.9  9e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  27.42 
 
 
496 aa  85.5  0.000000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0791  Radical SAM domain protein  29.54 
 
 
415 aa  85.9  0.000000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0101  radical SAM domain-containing protein  25.7 
 
 
323 aa  85.9  0.000000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1458  heme biosynthesis protein  28.99 
 
 
349 aa  84.7  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1253  Radical SAM domain protein  34.25 
 
 
396 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.942502  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2362  Radical SAM domain protein  27.22 
 
 
409 aa  84.7  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000000979641  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2473  radical SAM domain-containing protein  26.44 
 
 
458 aa  84.7  0.000000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000751779  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1180  radical SAM domain-containing protein  28.8 
 
 
418 aa  85.1  0.000000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.832103  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0109  Radical SAM domain protein  27.6 
 
 
465 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0879  radical SAM domain-containing protein  29.57 
 
 
349 aa  85.1  0.000000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.11149  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2352  Radical SAM domain protein  28.18 
 
 
565 aa  84.3  0.000000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1704  radical SAM domain-containing protein  26.72 
 
 
485 aa  84  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.347799  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3326  radical SAM domain-containing protein  29.17 
 
 
396 aa  84  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.579785 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0102  radical SAM domain-containing protein  25.62 
 
 
323 aa  84  0.000000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12350  predicted Fe-S oxidoreductase  31.42 
 
 
422 aa  84  0.000000000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3864  Radical SAM domain protein  28.67 
 
 
319 aa  84  0.000000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0170641  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2157  radical SAM domain-containing protein  26.51 
 
 
402 aa  83.6  0.000000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0955  radical SAM domain-containing protein  29.03 
 
 
391 aa  83.2  0.000000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1001  radical SAM family protein  28.53 
 
 
401 aa  83.2  0.000000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1018  radical SAM domain-containing protein  28.53 
 
 
401 aa  83.2  0.000000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0572613  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1028  radical SAM domain-containing protein  28.53 
 
 
401 aa  83.2  0.000000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1343  radical SAM domain-containing protein  29.19 
 
 
334 aa  82.8  0.000000000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1296  radical SAM domain-containing protein  26.99 
 
 
395 aa  82.8  0.000000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0595995 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2638  Radical SAM domain protein  27.74 
 
 
378 aa  82.4  0.00000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.44859  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0575  Radical SAM domain protein  24.85 
 
 
434 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2391  Radical SAM domain protein  33.68 
 
 
397 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0071  Radical SAM domain protein  31.34 
 
 
428 aa  82  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1255  Radical SAM domain protein  27.11 
 
 
330 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.411599  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5060  radical SAM domain-containing protein  26.69 
 
 
396 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2068  Radical SAM domain protein  35.2 
 
 
399 aa  81.6  0.00000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.184452  hitchhiker  0.00128487 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1008  Radical SAM domain protein  26.83 
 
 
370 aa  80.9  0.00000000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2161  radical SAM domain-containing protein  34.38 
 
 
390 aa  80.9  0.00000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000156576  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4047  Radical SAM domain protein  31.84 
 
 
403 aa  80.9  0.00000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4492  Radical SAM domain protein  25.34 
 
 
460 aa  80.5  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.153991  normal  0.0565392 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01455  hypothetical protein  21.35 
 
 
385 aa  80.5  0.00000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2149  Radical SAM domain protein  21.35 
 
 
385 aa  80.5  0.00000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.967723  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1582  radical SAM domain-containing protein  21.35 
 
 
385 aa  80.5  0.00000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.28073  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01468  hypothetical protein  21.35 
 
 
385 aa  80.5  0.00000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2160  radical SAM domain-containing protein  21.35 
 
 
385 aa  80.5  0.00000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.821975 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3352  Radical SAM domain protein  31.53 
 
 
391 aa  80.1  0.00000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0055  radical SAM domain-containing protein  25.36 
 
 
429 aa  80.1  0.00000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3206  radical SAM domain-containing protein  29.34 
 
 
412 aa  79.7  0.00000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1793  metallo cofactor biosynthesis protein  30.14 
 
 
399 aa  79  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.91522  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0479  radical SAM domain-containing protein  22.57 
 
 
471 aa  78.6  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3149  putative sulfatase regulator  23.85 
 
 
391 aa  78.6  0.0000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.997665  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2110  radical SAM domain protein  21.35 
 
 
385 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.73629  normal  0.549751 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1225  radical SAM domain-containing protein  36.21 
 
 
395 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1264  putative sulfatase regulator  23.85 
 
 
391 aa  78.6  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1687  radical SAM domain-containing protein  21.05 
 
 
385 aa  78.6  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>