More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0385 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_0385  cobyric acid synthase  100 
 
 
490 aa  987    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3191  cobyric acid synthase  58.97 
 
 
485 aa  556  1e-157  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.293071  hitchhiker  0.00488811 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2361  cobyric acid synthase  60.37 
 
 
495 aa  552  1e-156  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2912  cobyric acid synthase  54.56 
 
 
478 aa  508  1e-143  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.698516 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1991  cobyric acid synthase  54.56 
 
 
487 aa  505  9.999999999999999e-143  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.213046 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1999  cobyric acid synthase  54.49 
 
 
492 aa  496  1e-139  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1901  cobyric acid synthase  53.81 
 
 
480 aa  493  9.999999999999999e-139  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.461706 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0211  cobyric acid synthase  47.39 
 
 
491 aa  429  1e-119  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.264631 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0196  cobyric acid synthase  47.6 
 
 
491 aa  419  1e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.152835 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3093  cobyric acid synthase  45.61 
 
 
515 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.546568  normal  0.0117123 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0181  cobyric acid synthase CobQ  48.1 
 
 
494 aa  412  1e-114  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0190399  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2141  cobyric acid synthase  44.58 
 
 
506 aa  412  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2195  cobyric acid synthase  44.38 
 
 
513 aa  409  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2354  cobyric acid synthase  44.38 
 
 
506 aa  410  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.066722 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2241  cobyric acid synthase  44.58 
 
 
506 aa  411  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.386357  normal  0.07507 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1098  cobyric acid synthase  47.06 
 
 
517 aa  410  1e-113  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3857  cobyric acid synthase CobQ  46.8 
 
 
491 aa  411  1e-113  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.929745  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2188  cobyric acid synthase  44.18 
 
 
506 aa  406  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1304  cobyric acid synthase CobQ  45.33 
 
 
514 aa  405  1.0000000000000001e-112  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0820  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  45.82 
 
 
503 aa  404  1e-111  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3640  cobyric acid synthase CobQ  45.76 
 
 
495 aa  402  1e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3957  cobyric acid synthase  45.16 
 
 
488 aa  404  1e-111  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.117227  normal  0.976243 
 
 
-
 
NC_002936  DET0936  cobyric acid synthase CobQ  45.62 
 
 
506 aa  399  9.999999999999999e-111  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.164528  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_807  cobyric acid synthase  46.41 
 
 
503 aa  401  9.999999999999999e-111  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2705  cobyric acid synthase CobQ  45.78 
 
 
512 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.554279  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1284  cobyric acid synthase  44.88 
 
 
514 aa  396  1e-109  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2747  cobyric acid synthase CobQ  44.38 
 
 
502 aa  394  1e-108  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.230019  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0300  cobyric acid synthase  43.5 
 
 
507 aa  390  1e-107  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0485  cobyric acid synthase CobQ:precorrin-3B C17-methyltransferase region  45.94 
 
 
797 aa  389  1e-107  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1655  cobyric acid synthase CobQ  43.85 
 
 
495 aa  387  1e-106  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1628  cobyric acid synthase CobQ  43.85 
 
 
495 aa  387  1e-106  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1457  cobyric acid synthase  43.54 
 
 
492 aa  382  1e-105  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1705  cobyric acid synthase  44.18 
 
 
501 aa  384  1e-105  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3605  cobyric acid synthase CobQ  44.49 
 
 
772 aa  384  1e-105  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1018  cobyric acid synthase CobQ  43.55 
 
 
494 aa  384  1e-105  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0041  cobyric acid synthase CobQ  44.36 
 
 
787 aa  381  1e-104  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1112  cobyric acid synthase  43.35 
 
 
513 aa  380  1e-104  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3539  cobyric acid synthase CobQ  43.65 
 
 
776 aa  380  1e-104  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.714834  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1854  cobyric acid synthase  45.78 
 
 
498 aa  376  1e-103  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.490035 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1848  cobyric acid synthase CobQ  46.37 
 
 
496 aa  374  1e-102  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7399  adenosylcobyric acid synthase (glutamine- hydrolyzing)  44.18 
 
 
509 aa  374  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0375  cobyric acid synthase  42.49 
 
 
492 aa  373  1e-102  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0399109  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0238  cobyric acid synthase  45.55 
 
 
518 aa  374  1e-102  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.267463  normal  0.284689 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0944  cobyric acid synthase CobQ  43.4 
 
 
560 aa  369  1e-101  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.835021  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0871  cobyric acid synthase CobQ  43.79 
 
 
777 aa  370  1e-101  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.383971  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5883  cobyric acid synthase CobQ  44.73 
 
 
509 aa  370  1e-101  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0462  cobyric acid synthase  43.25 
 
 
492 aa  365  1e-99  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0586994  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1560  cobyric acid synthase  43 
 
 
503 aa  365  1e-99  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0577  cobyric acid synthase  43.97 
 
 
490 aa  364  2e-99  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1739  cobyric acid synthase CobQ  40.94 
 
 
514 aa  363  4e-99  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0175478 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21140  cobyric acid synthase  43.75 
 
 
508 aa  363  5.0000000000000005e-99  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1051  cobyric acid synthase  41.73 
 
 
489 aa  362  6e-99  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1288  cobyric acid synthase CobQ  44.22 
 
 
501 aa  361  1e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00711481  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2504  cobyric acid synthase  42.8 
 
 
520 aa  361  1e-98  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.177282  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2992  cobyric acid synthase  42.57 
 
 
532 aa  360  4e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2606  cobyric acid synthase  42.52 
 
 
503 aa  360  4e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0484  cobyric acid synthase  41.72 
 
 
864 aa  360  5e-98  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0530  cobyric acid synthase  41.9 
 
 
491 aa  357  3.9999999999999996e-97  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.479348  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2744  cobyric acid synthase CobQ  45.44 
 
 
512 aa  352  1e-95  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0267335  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1456  cobyric acid synthase CobQ  43.84 
 
 
495 aa  352  1e-95  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.727464  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1269  cobyric acid synthase  40.4 
 
 
493 aa  351  2e-95  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2161  cobyric acid synthase  41.05 
 
 
539 aa  351  2e-95  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.468126  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0558  cobyric acid synthase CobQ  41.97 
 
 
511 aa  350  3e-95  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0632  cobyric acid synthase  43.6 
 
 
490 aa  350  3e-95  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.761759  normal  0.250853 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3928  cobyric acid synthase CobQ  42.04 
 
 
575 aa  350  3e-95  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.111937  normal  0.0307354 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3679  cobyric acid synthase CobQ  42.48 
 
 
863 aa  350  5e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1236  cobyric acid synthase  43.29 
 
 
484 aa  350  5e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.170511  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1734  cobyric acid synthase CobQ  42.06 
 
 
498 aa  348  1e-94  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.534175  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1683  cobyric acid synthase CobQ  40.12 
 
 
858 aa  347  3e-94  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1030  cobyric acid synthase  42.35 
 
 
518 aa  347  4e-94  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1596  cobyric acid synthase  39.88 
 
 
496 aa  346  5e-94  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.928807  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1276  cobyric acid synthase  43.61 
 
 
484 aa  346  5e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.651231  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2157  cobyric acid synthase  42.54 
 
 
485 aa  345  7e-94  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.711251  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1677  cobyric acid synthase  42.89 
 
 
484 aa  345  8e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3554  cobyric acid synthase CobQ  41.72 
 
 
863 aa  345  1e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.235354  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4113  cobyric acid synthase  44.47 
 
 
490 aa  344  2e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0666  cobyric acid synthase  41.68 
 
 
484 aa  344  2e-93  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16121  cobyric acid synthase  39.6 
 
 
494 aa  343  2.9999999999999997e-93  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08361  cobyric acid synthase  39.26 
 
 
506 aa  343  5e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0771  cobyric acid synthase  39.33 
 
 
504 aa  343  5.999999999999999e-93  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3068  cobyric acid synthase CobQ  41 
 
 
563 aa  342  8e-93  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0766  cobyric acid synthase  40.36 
 
 
498 aa  342  8e-93  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0695553 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4042  cobyric acid synthase  42.48 
 
 
484 aa  342  1e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1119  cobyric acid synthase  41.4 
 
 
487 aa  342  1e-92  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.155962  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3554  cobyric acid synthase CobQ  41.65 
 
 
521 aa  341  2e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3127  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  40.08 
 
 
500 aa  341  2e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2128  cobyric acid synthase CobQ  42.69 
 
 
517 aa  341  2e-92  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.347874  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1066  cobyric acid synthase  39.92 
 
 
503 aa  340  4e-92  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.641596  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17700  cobyric acid synthase  41.53 
 
 
498 aa  339  5.9999999999999996e-92  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0379411  normal  0.993656 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1693  cobyric acid synthase CobQ  41.98 
 
 
507 aa  339  8e-92  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0137801  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2446  cobyric acid synthase CobQ  42.45 
 
 
509 aa  338  9e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.117915 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1300  cobyric acid synthase  40.85 
 
 
487 aa  338  9.999999999999999e-92  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.203276  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47690  cobyric acid synthase  43.63 
 
 
490 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00733771  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1117  cobyric acid synthase  40 
 
 
505 aa  336  5e-91  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0634  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  41.72 
 
 
499 aa  336  7e-91  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1252  cobyric acid synthase  40.35 
 
 
493 aa  335  7.999999999999999e-91  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0103  cobyric acid synthase  42.05 
 
 
483 aa  335  1e-90  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3377  cobyric acid synthase  40.27 
 
 
536 aa  335  1e-90  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0061  cobyric acid synthase CobQ  42.48 
 
 
954 aa  335  1e-90  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1012  cobyric acid synthase  38.77 
 
 
506 aa  334  2e-90  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>