67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0378 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_0378  ABC-2 type transporter  100 
 
 
261 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.572571  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2239  hypothetical protein  26.59 
 
 
268 aa  95.5  7e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.627796  normal  0.0598095 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0127  ABC-2 transporter component  26.42 
 
 
282 aa  88.2  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0177807  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0406  ABC-2 type transporter  28.47 
 
 
279 aa  84  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0129272  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0062  hypothetical protein  25.39 
 
 
276 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0577  ABC-2 type transporter  28.11 
 
 
276 aa  79  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.228177  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0128  hypothetical protein  26.14 
 
 
276 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.474534  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0434  ABC-2 type transporter  25 
 
 
266 aa  76.3  0.0000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7657  putative ABC transporter, permease protein  28.28 
 
 
270 aa  73.9  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0868338  normal  0.877787 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0357  hypothetical protein  24.69 
 
 
271 aa  71.2  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1438  ABC-2 type transporter  26.02 
 
 
273 aa  70.9  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2356  ABC-2 type transporter  27.51 
 
 
286 aa  67.8  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.328671  normal  0.119199 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3266  ABC-2 type transporter  29.09 
 
 
281 aa  66.6  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2789  ABC-2 type transporter  27.72 
 
 
267 aa  65.1  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2477  ABC-2 type transporter  27.51 
 
 
286 aa  63.5  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.299444 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1805  ABC-2 type transporter  27.95 
 
 
290 aa  58.9  0.00000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2950  ABC transporter related  28.5 
 
 
943 aa  57.8  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3359  ABC-2 type transporter  23.97 
 
 
270 aa  57.4  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1954  ABC-2 type transporter  25.47 
 
 
275 aa  57.4  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00280004  normal  0.727691 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1792  ABC-2 type transporter  26.94 
 
 
275 aa  57  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3168  ABC transporter, inner membrane subunit  23.55 
 
 
270 aa  56.2  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3285  ABC-2 type transporter  23.55 
 
 
270 aa  55.1  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1618  ABC-2 type transporter  22.31 
 
 
269 aa  54.3  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.794446 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1491  ABC-2 type transporter  28.26 
 
 
375 aa  53.5  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_354  ABC-2 type transport system, permease protein  25.78 
 
 
255 aa  52  0.000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.216034  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0411  putative NodJ  25.78 
 
 
255 aa  51.6  0.00001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1005  ABC transporter, permease protein  24.49 
 
 
254 aa  51.2  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2479  ABC-2 type transporter  28.92 
 
 
376 aa  50.4  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.664004  normal  0.270232 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0390  ABC-2 type transporter  25.39 
 
 
255 aa  50.4  0.00003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3104  ABC-2 type transporter  26.79 
 
 
375 aa  50.1  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0132  ABC-2 type transporter  30.16 
 
 
370 aa  50.4  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.223413  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0714  ABC-2 type transporter  25 
 
 
332 aa  50.1  0.00004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03454  hypothetical protein  25.74 
 
 
256 aa  49.7  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2358  ABC-2 type transporter  24.63 
 
 
376 aa  49.3  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4695  ABC-2 type transporter  32.77 
 
 
370 aa  48.1  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.595113 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1455  ABC-2 type transporter  28.46 
 
 
270 aa  48.1  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1500  ABC-2 type transporter  28.46 
 
 
270 aa  48.1  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3318  ABC-2 type transporter  27.88 
 
 
271 aa  47  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.561179  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0121  putative permease  21.39 
 
 
256 aa  47.4  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.228328  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002558  ABC-type multidrug transport system permease component  23.4 
 
 
256 aa  47  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.644442  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0407  ABC-2 type transporter  22.58 
 
 
308 aa  46.6  0.0004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0243  hypothetical protein  24.45 
 
 
251 aa  46.2  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.021198  normal  0.905832 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2879  ABC-2 type transporter  28.1 
 
 
286 aa  46.2  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0552  ABC-2 type transporter  26.32 
 
 
336 aa  46.2  0.0006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0152  ABC-2 type transporter  26.23 
 
 
325 aa  45.4  0.0009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0553  ABC-2 type transporter  23.88 
 
 
361 aa  44.7  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0640  ABC-2 transporter component  27.13 
 
 
270 aa  44.7  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3320  ABC-2 type transporter  24.4 
 
 
269 aa  45.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1171  16S rRNA processing protein RimM  26.06 
 
 
257 aa  45.1  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.730617  hitchhiker  0.000000152208 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0857  hypothetical protein  25.77 
 
 
377 aa  45.4  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5370  ABC-2 type transporter  25.27 
 
 
273 aa  45.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5840  ABC-2 type transporter  22.56 
 
 
367 aa  45.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.564028 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1801  ABC-2 type transporter  27.23 
 
 
253 aa  44.3  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1790  ABC-2 transporter component  29.41 
 
 
371 aa  44.3  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2367  hypothetical protein  29.55 
 
 
370 aa  43.9  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.175245  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0539  ABC-2 type transporter  23.88 
 
 
361 aa  43.9  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0703  ABC-2 type transporter  24.85 
 
 
363 aa  43.5  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.422501  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0656  hypothetical protein  25.85 
 
 
377 aa  43.5  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00117213 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0800  ABC-2 type transporter  28.41 
 
 
257 aa  43.1  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0251444  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1766  ABC-2 type transporter  23.46 
 
 
370 aa  43.1  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.174884  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3308  ABC-2 type transporter  30.72 
 
 
380 aa  43.1  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3223  ABC-2 type transporter  30.72 
 
 
380 aa  43.1  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0649112  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2878  ABC-2 type transporter  23 
 
 
294 aa  42.4  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2769  ABC-2 type transporter  24.81 
 
 
413 aa  42  0.01  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.160651  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1106  ABC-2 type transporter  23.53 
 
 
379 aa  42  0.01  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.762924 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3882  ABC-2 type transporter  27.03 
 
 
278 aa  42  0.01  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1151  ABC transporter related  29.08 
 
 
994 aa  42  0.01  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.64731  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>