136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0361 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_0361  xylose isomerase domain-containing protein  100 
 
 		 253 aa  523  1e-147  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.934654  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0973  hypothetical protein  51.59 
 
 		 257 aa  278  6e-74  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2151  xylose isomerase-like TIM barrel  50.79 
 
 		 257 aa  276  2e-73  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00601378  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1555  xylose isomerase domain-containing protein  45.78 
 
 		 257 aa  221  9.999999999999999e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.123696  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1974  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  42.19 
 
 		 256 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.520711 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1592  xylose isomerase domain-containing protein  40.56 
 
 		 257 aa  198  6e-50  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.234456 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1715  xylose isomerase-like TIM barrel  38.65 
 
 		 256 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.436698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1364  hypothetical protein  38.74 
 
 		 256 aa  191  8e-48  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00000110599  hitchhiker  0.0000000254981 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1257  xylose isomerase domain-containing protein  30.8 
 
 		 264 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.666664  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1121  xylose isomerase domain-containing protein  30.77 
 
 		 268 aa  132  6e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0027  xylose isomerase domain-containing protein  30.92 
 
 		 268 aa  130  3e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  decreased coverage  0.0054119  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0797  xylose isomerase domain-containing protein  29.89 
 
 		 268 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0606735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0863  xylose isomerase domain-containing protein  32.76 
 
 		 268 aa  125  5e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.780816  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0174  xylose isomerase domain-containing protein  31.25 
 
 		 236 aa  116  3.9999999999999997e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0122  xylose isomerase domain-containing protein  30.6 
 
 		 254 aa  107  2e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.668761  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1299  xylose isomerase domain-containing protein  33.86 
 
 		 237 aa  105  6e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.47167  normal  0.0132415 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0600  xylose isomerase domain-containing protein  35.93 
 
 		 244 aa  104  1e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.352505  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0740  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  33.66 
 
 		 243 aa  103  3e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.103383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0036  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.7 
 
 		 264 aa  99.4  5e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.875943  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1143  xylose isomerase domain-containing protein  32.81 
 
 		 243 aa  94  2e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3793  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.19 
 
 		 256 aa  92.8  5e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0474  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  33.03 
 
 		 256 aa  91.3  1e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3876  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.2 
 
 		 256 aa  90.9  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.883338 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1398  xylose isomerase-like TIM barrel  33.77 
 
 		 271 aa  90.1  3e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0871  hypothetical protein  30.13 
 
 		 241 aa  89  6e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00496229  hitchhiker  0.00660497 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0064  xylose isomerase-like TIM barrel  30.9 
 
 		 256 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1263  hypothetical protein  32.21 
 
 		 269 aa  84.3  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0988  xylose isomerase domain-containing protein  27.76 
 
 		 253 aa  84.3  0.000000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.279783 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1379  hypothetical protein  29.02 
 
 		 242 aa  82  0.000000000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.100757  normal  0.0567681 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4159  xylose isomerase domain-containing protein  30.2 
 
 		 257 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1528  xylose isomerase-like TIM barrel  31.21 
 
 		 269 aa  80.5  0.00000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.317464  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3371  AP endonuclease  28.21 
 
 		 256 aa  77.8  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2972  xylose isomerase domain-containing protein  27.07 
 
 		 255 aa  78.2  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0023  xylose isomerase domain-containing protein  32.57 
 
 		 277 aa  77  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.140146  normal  0.179482 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0876  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.02 
 
 		 255 aa  73.6  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3128  hypothetical protein  28.42 
 
 		 257 aa  68.9  0.00000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0442  hypothetical protein  27.89 
 
 		 240 aa  68.6  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0247  xylose isomerase domain-containing protein TIM barrel  30.09 
 
 		 253 aa  63.2  0.000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1458  xylose isomerase domain-containing protein  29.91 
 
 		 255 aa  62  0.000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.931629 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2460  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.14 
 
 		 270 aa  61.2  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0967776 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2404  xylose isomerase domain-containing protein  25 
 
 		 262 aa  60.1  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.167076 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2599  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.7 
 
 		 282 aa  60.5  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0270  xylose isomerase domain-containing protein  23.31 
 
 		 269 aa  59.7  0.00000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.757164  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0655  AP endonuclease  27.14 
 
 		 278 aa  59.3  0.00000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4299  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  32.59 
 
 		 275 aa  58.9  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.172805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0499  xylose isomerase domain-containing protein  23.35 
 
 		 304 aa  58.9  0.00000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00421742  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0531  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.96 
 
 		 258 aa  58.9  0.00000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4598  xylose isomerase-like TIM barrel  36.67 
 
 		 277 aa  58.5  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0319  xylose isomerase domain-containing protein TIM barrel  25.7 
 
 		 273 aa  57  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2110  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.48 
 
 		 249 aa  56.2  0.0000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.517822  normal  0.355951 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0511  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.79 
 
 		 258 aa  56.2  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.717082  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4163  xylose isomerase domain-containing protein  33.33 
 
 		 257 aa  55.5  0.0000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3010  xylose isomerase-like TIM barrel  30.73 
 
 		 281 aa  55.5  0.0000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0781  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  33.08 
 
 		 282 aa  55.1  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03223  predicted isomerase  20.75 
 
 		 276 aa  53.5  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0340  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  20.75 
 
 		 276 aa  53.5  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03175  hypothetical protein  20.75 
 
 		 276 aa  53.5  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3842  fructoselysine 3-epimerase  20.75 
 
 		 276 aa  53.5  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1537  xylose isomerase domain-containing protein  25.11 
 
 		 265 aa  53.5  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.36398  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4684  fructoselysine 3-epimerase  20.75 
 
 		 275 aa  53.5  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9360  apurinic endonuclease Apn1  24.29 
 
 		 252 aa  53.1  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.480693  normal  0.839717 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3568  fructoselysine 3-epimerase  20.75 
 
 		 276 aa  53.1  0.000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0649  xylose isomerase domain-containing protein  30.51 
 
 		 304 aa  52.8  0.000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000488201  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0340  fructoselysine 3-epimerase  20.75 
 
 		 276 aa  52.4  0.000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.452792 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1698  xylose isomerase domain-containing protein TIM barrel  26.43 
 
 		 268 aa  51.6  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0984  xylose isomerase domain-containing protein  21.89 
 
 		 269 aa  51.6  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.221697  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2851  xylose isomerase domain-containing protein  28.03 
 
 		 316 aa  51.6  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2030  xylose isomerase domain-containing protein  25.68 
 
 		 307 aa  51.6  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3403  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.93 
 
 		 293 aa  51.2  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3105  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.74 
 
 		 257 aa  50.4  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2709  hypothetical protein  27.35 
 
 		 305 aa  50.8  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.320407  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00570  sugar phosphate isomerase/epimerase  26.32 
 
 		 294 aa  51.2  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.170304 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17470  sugar phosphate isomerase/epimerase  40.45 
 
 		 325 aa  51.2  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.105049  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0509  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.29 
 
 		 289 aa  51.2  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.440598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8563  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.1 
 
 		 278 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0314267  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6746  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.67 
 
 		 272 aa  50.8  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.249045  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7362  xylose isomerase  35.24 
 
 		 326 aa  50.4  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.730487  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0830  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.38 
 
 		 272 aa  50.4  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.801774  normal  0.909409 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1644  xylose isomerase domain-containing protein  23.91 
 
 		 269 aa  49.7  0.00005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.960602 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4546  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.14 
 
 		 314 aa  49.3  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3693  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.95 
 
 		 270 aa  49.7  0.00005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0949  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.2 
 
 		 272 aa  49.3  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5868  xylose isomerase domain-containing protein  27.34 
 
 		 283 aa  48.9  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3750  fructoselysine 3-epimerase  20.38 
 
 		 276 aa  48.9  0.00007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.238004  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2522  xylose isomerase domain-containing protein  25.11 
 
 		 281 aa  48.5  0.00009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2613  hydroxypyruvate isomerase  30.53 
 
 		 267 aa  48.1  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0246  xylose isomerase domain-containing protein  27.15 
 
 		 296 aa  48.5  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.483047  normal  0.792489 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5002  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.7 
 
 		 312 aa  48.1  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0821356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1494  xylose isomerase domain-containing protein  24.26 
 
 		 269 aa  48.1  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.747131  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0530  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.55 
 
 		 273 aa  48.1  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.297775  normal  0.967129 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0995  xylose isomerase-like TIM barrel  26.2 
 
 		 304 aa  47.8  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1978  xylose isomerase domain-containing protein  31.61 
 
 		 274 aa  47.4  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4979  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.44 
 
 		 283 aa  47.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.426661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1981  xylose isomerase domain-containing protein  26.9 
 
 		 287 aa  47  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2692  xylose isomerase domain-containing protein  34.51 
 
 		 284 aa  47  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0533  xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.79 
 
 		 282 aa  47.4  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.605213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4027  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.86 
 
 		 275 aa  47  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.383869  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14000  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  21.93 
 
 		 254 aa  46.6  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.50908  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0185  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27 
 
 		 284 aa  46.2  0.0005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1699  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  21.62 
 
 		 286 aa  46.2  0.0005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>