More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0260 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_0207  phenylacetate-CoA ligase  66.82 
 
 
434 aa  636  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0260  phenylacetate--CoA ligase  100 
 
 
434 aa  893  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.108553  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0211  phenylacetate-CoA ligase  66.13 
 
 
434 aa  626  1e-178  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.40287  normal  0.756152 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0709  phenylacetate--CoA ligase  64.8 
 
 
433 aa  587  1e-166  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0797552 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0749  phenylacetate--CoA ligase  63.26 
 
 
433 aa  581  1e-165  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0461279  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1624  phenylacetate--CoA ligase  64.19 
 
 
433 aa  575  1e-163  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.962242 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2123  Phenylacetate--CoA ligase  62.7 
 
 
433 aa  557  1e-157  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1456  phenylacetate-CoA ligase  55.32 
 
 
433 aa  510  1e-143  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.386345 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0513  phenylacetate-CoA ligase  55.79 
 
 
432 aa  498  1e-140  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1385  Phenylacetate--CoA ligase  54.4 
 
 
434 aa  496  1e-139  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00741433 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1504  Phenylacetate--CoA ligase  54.63 
 
 
433 aa  490  1e-137  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1574  phenylacetate--CoA ligase  54.63 
 
 
441 aa  484  1e-136  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.888855  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0339  phenylacetate-CoA ligase  54.97 
 
 
433 aa  485  1e-136  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0075  Phenylacetate--CoA ligase  53.6 
 
 
433 aa  483  1e-135  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1569  coenzyme F390 synthetase  55.81 
 
 
433 aa  483  1e-135  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.645557  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1858  Phenylacetate--CoA ligase  54.13 
 
 
435 aa  483  1e-135  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00363139  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2084  phenylacetate-CoA ligase  54.76 
 
 
433 aa  482  1e-135  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.268641  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1825  phenylacetate-CoA ligase  54.4 
 
 
435 aa  482  1e-135  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0442  Phenylacetate--CoA ligase  55.22 
 
 
434 aa  479  1e-134  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.372138 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2323  phenylacetate--CoA ligase  53.94 
 
 
433 aa  479  1e-134  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0815  phenylacetate--CoA ligase  55.56 
 
 
439 aa  481  1e-134  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.180698  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0073  Phenylacetate--CoA ligase  53.35 
 
 
433 aa  476  1e-133  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2884  phenylacetate--CoA ligase  52.41 
 
 
434 aa  477  1e-133  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00316572  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0169  phenylacetate--CoA ligase  53.36 
 
 
432 aa  476  1e-133  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.419801  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0797  Phenylacetate--CoA ligase  54.52 
 
 
433 aa  476  1e-133  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1669  phenylacetate--CoA ligase  53.7 
 
 
433 aa  478  1e-133  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0633  phenylacetate--CoA ligase  53.12 
 
 
432 aa  477  1e-133  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.683184  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3190  phenylacetate--CoA ligase  53.26 
 
 
432 aa  476  1e-133  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0586807  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1139  Phenylacetate--CoA ligase  52.33 
 
 
435 aa  471  1e-132  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  3.76262e-05  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0042  Phenylacetate--CoA ligase  53.85 
 
 
432 aa  474  1e-132  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.125903 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1683  phenylacetate--CoA ligase  55.27 
 
 
433 aa  474  1e-132  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1737  phenylacetate-CoA ligase  53.81 
 
 
435 aa  472  1e-132  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102545  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0669  phenylacetate-CoA ligase  51.63 
 
 
433 aa  473  1e-132  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.73594  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1742  phenylacetate--CoA ligase  53.13 
 
 
432 aa  474  1e-132  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.287077 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1519  phenylacetate--CoA ligase  53.7 
 
 
435 aa  471  1e-131  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00322387 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0615  phenylacetate-CoA ligase  53.13 
 
 
433 aa  470  1e-131  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.893262  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1968  phenylacetate-CoA ligase  51.96 
 
 
433 aa  469  1e-131  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2192  phenylacetate-CoA ligase  52.44 
 
 
434 aa  470  1e-131  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.724395  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2872  phenylacetate-CoA ligase  53.13 
 
 
433 aa  468  1e-131  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0742777  normal  0.0504153 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2035  Phenylacetate--CoA ligase  53.13 
 
 
434 aa  470  1e-131  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.65841e-12 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0861  phenylacetate-CoA ligase  53.36 
 
 
432 aa  471  1e-131  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.354506  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0710  phenylacetate--CoA ligase  54.59 
 
 
423 aa  466  1e-130  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0777272 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0559  Phenylacetate--CoA ligase  52.67 
 
 
434 aa  461  1e-129  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.589341  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1573  phenylacetate--CoA ligase  53.35 
 
 
431 aa  462  1e-129  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1590  phenylacetate--CoA ligase  52.2 
 
 
432 aa  462  1e-129  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1729  phenylacetate-CoA ligase  51.51 
 
 
433 aa  462  1e-129  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0166  Phenylacetate--CoA ligase  54.29 
 
 
432 aa  460  1e-128  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2133  phenylacetate--CoA ligase  52.31 
 
 
434 aa  459  1e-128  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00349267  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0698  phenylacetate--CoA ligase  51.97 
 
 
446 aa  459  1e-128  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.70972  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0750  phenylacetate--CoA ligase  53.95 
 
 
429 aa  461  1e-128  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.564813  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0163  Phenylacetate--CoA ligase  54.35 
 
 
438 aa  455  1e-127  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1515  phenylacetate-CoA ligase  50.24 
 
 
433 aa  455  1e-127  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.049443  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1422  Phenylacetate--CoA ligase  51.51 
 
 
444 aa  455  1e-127  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.393229  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1754  phenylacetate--CoA ligase  51.52 
 
 
435 aa  455  1e-127  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0384873  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1218  phenylacetate-CoA ligase  50.46 
 
 
436 aa  455  1e-127  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0790  phenylacetate--CoA ligase  50 
 
 
433 aa  457  1e-127  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.740022  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1237  phenylacetate--CoA ligase  51.97 
 
 
444 aa  457  1e-127  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1625  phenylacetate--CoA ligase  52.2 
 
 
429 aa  458  1e-127  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.314491  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0066  phenylacetate--CoA ligase  52.78 
 
 
432 aa  458  1e-127  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.922632  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2043  phenylacetate-CoA ligase  50.81 
 
 
433 aa  454  1e-126  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.58285e-15 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2184  phenylacetate-CoA ligase  50.81 
 
 
433 aa  454  1e-126  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4008  phenylacetate--CoA ligase  51.51 
 
 
444 aa  449  1e-125  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4320  phenylacetate--CoA ligase  52.25 
 
 
444 aa  449  1e-125  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2124  Phenylacetate--CoA ligase  52.79 
 
 
430 aa  449  1e-125  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2124  phenylacetate--CoA ligase  49.89 
 
 
434 aa  450  1e-125  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1457  phenylacetate-CoA ligase  50.69 
 
 
428 aa  445  1e-124  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.387558 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1160  phenylacetate--CoA ligase  48.58 
 
 
433 aa  446  1e-124  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.580282  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1015  phenylacetate-CoA ligase  50.23 
 
 
439 aa  447  1e-124  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1507  Phenylacetate--CoA ligase  51.75 
 
 
433 aa  447  1e-124  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3083  phenylacetate--CoA ligase  52.12 
 
 
423 aa  444  1e-123  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0041  phenylacetate--CoA ligase  53.54 
 
 
446 aa  444  1e-123  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1165  phenylacetate--CoA ligase  48.82 
 
 
433 aa  444  1e-123  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_886  acyl-CoA synthetase (AMP-forming) / AMP-acid ligase  49.77 
 
 
439 aa  444  1e-123  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1818  phenylacetate-CoA ligase  51.51 
 
 
433 aa  437  1e-121  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1578  Phenylacetate--CoA ligase  50.12 
 
 
436 aa  436  1e-121  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.198004 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1910  Phenylacetate--CoA ligase  49.54 
 
 
436 aa  438  1e-121  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  1.90319e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0902  phenylacetate-CoA ligase  48.6 
 
 
439 aa  435  1e-121  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0070  phenylacetate--CoA ligase  51.54 
 
 
445 aa  437  1e-121  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3091  phenylacetate--CoA ligase  49.88 
 
 
437 aa  428  1e-119  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  1.25462e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2870  phenylacetate-CoA ligase  50.58 
 
 
443 aa  429  1e-119  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0811  Phenylacetate--CoA ligase  50.9 
 
 
442 aa  427  1e-118  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0054  Phenylacetate--CoA ligase  51.89 
 
 
441 aa  426  1e-118  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2278  phenylacetate-CoA ligase  50.82 
 
 
430 aa  427  1e-118  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.129528  hitchhiker  2.41897e-05 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0042  Phenylacetate--CoA ligase  51.89 
 
 
441 aa  427  1e-118  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1976  phenylacetate-CoA ligase  49.41 
 
 
437 aa  427  1e-118  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0038  phenylacetate-CoA ligase  52.36 
 
 
441 aa  428  1e-118  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.455543  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1320  coenzyme F390 synthetase  48.6 
 
 
436 aa  416  1e-115  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1756  phenylacetate--CoA ligase  49.18 
 
 
432 aa  415  1e-115  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13410  phenylacetate-CoA ligase  48.26 
 
 
435 aa  412  1e-114  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0571  phenylacetate--CoA ligase  47.87 
 
 
432 aa  409  1e-113  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2322  Phenylacetate--CoA ligase  47.87 
 
 
449 aa  409  1e-113  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1826  Phenylacetate--CoA ligase  47.18 
 
 
430 aa  410  1e-113  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1153  Phenylacetate--CoA ligase  46.95 
 
 
434 aa  407  1e-112  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.107215 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1321  Phenylacetate--CoA ligase  46.41 
 
 
449 aa  405  1e-112  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.710343  normal  0.230718 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0440  phenylacetate-CoA ligase  47.74 
 
 
436 aa  404  1e-111  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.908613 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0039  phenylacetate--CoA ligase  47.81 
 
 
441 aa  402  1e-111  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.728722  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3626  phenylacetate-CoA ligase  48.24 
 
 
432 aa  401  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0611072  normal  0.539384 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3165  phenylacetate-CoA ligase  48.12 
 
 
434 aa  399  1e-110  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0404023  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2967  phenylacetate-CoA ligase  48.85 
 
 
439 aa  399  1e-110  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0444  phenylacetate-CoA ligase  48.24 
 
 
432 aa  399  1e-110  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>