31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0231 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_0231  50S ribosomal protein L37e  100 
 
 
56 aa  114  6e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.301389  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0229  50S ribosomal protein L37e  64.15 
 
 
60 aa  77  0.00000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.409519  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2180  50S ribosomal protein L37e  62.5 
 
 
56 aa  76.3  0.0000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0395  50S ribosomal protein L37e  66.04 
 
 
60 aa  74.3  0.0000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0295683 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0094  50S ribosomal protein L37e  60.38 
 
 
60 aa  73.2  0.000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3499  50S ribosomal protein L37e  58.93 
 
 
56 aa  72.4  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0696455  normal  0.486472 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3060  50S ribosomal protein L37e  62.26 
 
 
60 aa  67.8  0.00000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0673  50S ribosomal protein L37e  56.6 
 
 
57 aa  66.2  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.638312  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1067  Ribosomal protein L37e  55.77 
 
 
58 aa  65.1  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1813  Ribosomal protein L37e  59.62 
 
 
61 aa  65.1  0.0000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1082  50S ribosomal protein L37e  62.75 
 
 
52 aa  64.3  0.0000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.247855  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2140  50S ribosomal protein L37e  62.75 
 
 
52 aa  63.9  0.0000000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2925  Ribosomal protein L37e  53.85 
 
 
58 aa  63.2  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2096  Ribosomal protein L37e  53.85 
 
 
57 aa  62.4  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.762385 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0039  50S ribosomal protein L37e  58.82 
 
 
52 aa  62  0.000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00771386 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0291  50S ribosomal protein L37e  59.26 
 
 
62 aa  62.8  0.000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0042  50S ribosomal protein L37e  58.82 
 
 
52 aa  62  0.000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.558285  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2252  50S ribosomal protein L37e  59.62 
 
 
61 aa  60.5  0.000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.135184 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2045  50S ribosomal protein L37e  51.92 
 
 
58 aa  58.9  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0509029  normal  0.0973133 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76246  predicted protein  51.85 
 
 
88 aa  57.8  0.00000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.304139  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0397  50S ribosomal protein L37e  50 
 
 
64 aa  57.4  0.00000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0438  50S ribosomal protein L37e  50 
 
 
64 aa  57.4  0.00000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1522  50S ribosomal protein L37e  48.15 
 
 
64 aa  56.6  0.0000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0495076  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0420  50S ribosomal protein L37e  55.56 
 
 
63 aa  56.6  0.0000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0469  50S ribosomal protein L37e  49.02 
 
 
64 aa  55.5  0.0000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.39506  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0164  50S ribosomal protein L37e  55.32 
 
 
61 aa  54.7  0.0000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.11275  normal  0.178232 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10196  predicted protein  46.3 
 
 
90 aa  54.3  0.0000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.609433  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC00700  PRCDNA38, putative  50 
 
 
91 aa  52.8  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.637781  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32818  Ribosomal protein L37, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  50 
 
 
93 aa  48.9  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.973212 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1390  Ribosomal protein L37e  50 
 
 
55 aa  47.8  0.00005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.434822  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0220  50S ribosomal protein L37e  47.17 
 
 
55 aa  44.7  0.0004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>