38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0126 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_0126  hypothetical protein  100 
 
 
177 aa  362  1e-99  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1841  hypothetical protein  48.12 
 
 
237 aa  170  1e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.242761  normal  0.999986 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2542  protein of unknown function DUF116  47.5 
 
 
232 aa  167  6e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1695  hypothetical protein  49.09 
 
 
234 aa  166  2e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0977  hypothetical protein  46.2 
 
 
245 aa  157  6e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.310915  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0624  hypothetical protein  44.1 
 
 
230 aa  156  1e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.381935  normal  0.220202 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0788  hypothetical protein  38.71 
 
 
214 aa  106  2e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1162  hypothetical protein  37.9 
 
 
214 aa  105  4e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1513  hypothetical protein  37.1 
 
 
214 aa  104  6e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0687908  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1601  hypothetical protein  32.43 
 
 
206 aa  104  8e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2439  hypothetical protein  33.33 
 
 
208 aa  103  1e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1003  hypothetical protein  33.33 
 
 
223 aa  98.2  5e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1167  hypothetical protein  34.45 
 
 
214 aa  97.1  1e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2915  protein of unknown function DUF116  31.76 
 
 
634 aa  87.8  8e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1600  hypothetical protein  31.68 
 
 
211 aa  86.3  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2438  hypothetical protein  34.81 
 
 
211 aa  82.8  0.000000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1230  hypothetical protein  30.66 
 
 
250 aa  77.8  0.00000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00155832  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0243  hypothetical protein  26.24 
 
 
275 aa  71.2  0.000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1530  protein of unknown function DUF116  31.36 
 
 
251 aa  68.9  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.17942  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2312  protein of unknown function DUF116  25.87 
 
 
262 aa  67  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.568933  hitchhiker  0.00168334 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1706  hypothetical protein  24.48 
 
 
255 aa  65.5  0.0000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2842  protein of unknown function DUF116  25.76 
 
 
268 aa  62  0.000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.833781  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3340  hypothetical protein  31.09 
 
 
251 aa  62  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0131  hypothetical protein  29.2 
 
 
251 aa  61.6  0.000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0820  hypothetical protein  29.41 
 
 
256 aa  61.2  0.000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0899  hypothetical protein  26.55 
 
 
269 aa  61.2  0.000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.613511  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1335  protein of unknown function DUF116  23.81 
 
 
269 aa  59.7  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0220692  normal  0.691762 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2041  protein of unknown function DUF116  28.32 
 
 
354 aa  59.7  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3218  protein of unknown function DUF116  28.32 
 
 
259 aa  58.9  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0569  hypothetical protein  32.61 
 
 
251 aa  59.3  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000609757  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0013  protein of unknown function DUF116  27 
 
 
291 aa  58.5  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.877315  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0149  hypothetical protein  30.59 
 
 
267 aa  58.5  0.00000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.691923  normal  0.569731 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0512  hypothetical protein  29.75 
 
 
258 aa  58.5  0.00000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0031  hypothetical protein  29.46 
 
 
307 aa  58.5  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0636  protein of unknown function DUF116  31.25 
 
 
259 aa  57.8  0.00000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.62091  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0650  protein of unknown function DUF116  31.25 
 
 
256 aa  55.8  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.03585e-24 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1754  hypothetical protein  21.88 
 
 
250 aa  53.9  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0017  protein of unknown function DUF116  28.97 
 
 
298 aa  52.8  0.000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>