More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0087 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
366 aa  741    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  35.07 
 
 
927 aa  256  3e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  33.52 
 
 
543 aa  236  3e-61  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  33.05 
 
 
1276 aa  229  5e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  35.96 
 
 
562 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  33.52 
 
 
1694 aa  221  9.999999999999999e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4726  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  33.65 
 
 
730 aa  203  5e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  30.08 
 
 
4079 aa  193  5e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  32.54 
 
 
602 aa  190  4e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 
878 aa  189  5e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  32.05 
 
 
397 aa  187  2e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  29.59 
 
 
1979 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1552  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  30.43 
 
 
707 aa  183  5.0000000000000004e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0225548 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.88 
 
 
810 aa  182  6e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0698  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.37 
 
 
784 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.03 
 
 
1056 aa  177  3e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.93 
 
 
1022 aa  176  7e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.03 
 
 
784 aa  176  7e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  29.53 
 
 
576 aa  176  8e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.32 
 
 
1056 aa  175  9e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  30.23 
 
 
1138 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  31.83 
 
 
4489 aa  172  6.999999999999999e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.61 
 
 
988 aa  172  7.999999999999999e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.19 
 
 
818 aa  171  2e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2318  tetratricopeptide protein  30.65 
 
 
573 aa  171  2e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0280  TPR domain-containing protein  31.69 
 
 
1013 aa  166  5e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.416311 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  31.4 
 
 
1069 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0225  TPR repeat-containing protein  30.12 
 
 
414 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0629  TPR repeat-containing protein  30.17 
 
 
1049 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2953  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 
711 aa  162  1e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0781794 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  30.14 
 
 
465 aa  160  2e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0930  TPR repeat-containing protein  31.31 
 
 
329 aa  160  3e-38  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0675  TPR repeat-containing protein  31.19 
 
 
344 aa  159  6e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  29.67 
 
 
3035 aa  157  2e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0163  TPR repeat-containing protein  27.73 
 
 
356 aa  157  2e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00233758  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1947  tetratricopeptide TPR_2  27.89 
 
 
564 aa  157  2e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0106408 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  30.03 
 
 
745 aa  156  4e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0955  tetratricopeptide TPR_2  27.04 
 
 
635 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.750671 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  27.03 
 
 
462 aa  156  7e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1811  TPR repeat-containing protein  32.02 
 
 
523 aa  155  1e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.18 
 
 
632 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2406  tetratricopeptide TPR_2  25.36 
 
 
436 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2370  TPR repeat-containing protein  27.91 
 
 
425 aa  149  1.0000000000000001e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00134041  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  29.81 
 
 
620 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  27.64 
 
 
1094 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3569  tetratricopeptide TPR_2  28.78 
 
 
314 aa  148  1.0000000000000001e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2320  TPR repeat-containing protein  27.02 
 
 
617 aa  148  2.0000000000000003e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4355  TPR repeat-containing protein  26.98 
 
 
1192 aa  146  6e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.862224  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  30.89 
 
 
1007 aa  144  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2895  O-linked N-acetylglucosamine transferase  27.21 
 
 
292 aa  142  7e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0140366 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2005  TPR repeat-containing protein  32.07 
 
 
512 aa  142  7e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.915591 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28721  hypothetical protein  27.8 
 
 
706 aa  141  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1451  TPR repeat-containing protein  38.12 
 
 
244 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.346129  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  29.93 
 
 
615 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  29.26 
 
 
620 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1782  TPR repeat-containing protein  29.05 
 
 
467 aa  139  7.999999999999999e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  27.08 
 
 
750 aa  139  1e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28501  hypothetical protein  25.29 
 
 
706 aa  137  3.0000000000000003e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  35.6 
 
 
560 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0384  TPR repeat-containing protein  35.68 
 
 
279 aa  136  4e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.890218  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  26.82 
 
 
740 aa  137  4e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  28.84 
 
 
626 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  28.5 
 
 
955 aa  136  7.000000000000001e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  29.87 
 
 
614 aa  135  9e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  29.87 
 
 
626 aa  135  9e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0774  tetratricopeptide TPR_2  27.14 
 
 
519 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.169881  normal  0.452711 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0436  tetratricopeptide TPR_2  27.81 
 
 
1056 aa  135  9.999999999999999e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0901  TPR repeat-containing protein  27.76 
 
 
409 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1827  TPR repeat-containing protein  25.32 
 
 
761 aa  134  1.9999999999999998e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0460239  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0471  TPR repeat-containing protein  23.65 
 
 
1297 aa  134  3e-30  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1342  TPR repeat-containing protein  24.65 
 
 
391 aa  134  3.9999999999999996e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1603  TPR repeat-containing protein  25.98 
 
 
804 aa  133  6e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  29.55 
 
 
614 aa  133  6e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  29.55 
 
 
614 aa  133  6e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  29.55 
 
 
614 aa  133  6e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  29.55 
 
 
626 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  29.82 
 
 
795 aa  132  7.999999999999999e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2461  hypothetical protein  26.9 
 
 
398 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.125521  normal  0.0258605 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2212  TPR repeat-containing protein  26.48 
 
 
1276 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.524691  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3209  tetratricopeptide repeat-containing protein  31.28 
 
 
743 aa  131  2.0000000000000002e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2367  protein kinase  34.78 
 
 
623 aa  131  2.0000000000000002e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1518  TPR repeat-containing protein  28.89 
 
 
375 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.946116  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2322  TPR repeat-containing protein  27.53 
 
 
352 aa  131  2.0000000000000002e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4492  TPR repeat-containing protein  25.3 
 
 
605 aa  130  3e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0858  TPR repeat-containing protein  27.12 
 
 
589 aa  129  6e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1699  TPR repeat-containing protein  27.69 
 
 
409 aa  129  7.000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.52405  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  24.33 
 
 
649 aa  129  1.0000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0564  TPR repeat-containing protein  35.91 
 
 
202 aa  127  2.0000000000000002e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.151741 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2328  TPR repeat-containing protein  29.87 
 
 
363 aa  128  2.0000000000000002e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.759887 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  30.23 
 
 
612 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0755  TPR repeat-containing protein  29.25 
 
 
662 aa  128  2.0000000000000002e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.466717  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  32.23 
 
 
614 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0035  TPR repeat-containing protein  25.51 
 
 
402 aa  126  5e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.446314  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  28.25 
 
 
3560 aa  126  5e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2318  TPR repeat-containing protein  32.2 
 
 
245 aa  126  5e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3049  TPR repeat-containing protein  23.96 
 
 
591 aa  126  6e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000157665  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0949  TPR repeat-containing protein  28.94 
 
 
1121 aa  126  7e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849269  normal  0.0980091 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0823  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.35 
 
 
296 aa  125  9e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0401477 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1449  tetratricopeptide TPR_2  24.59 
 
 
1067 aa  125  1e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1773  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.12 
 
 
466 aa  125  1e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>