More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0082 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_2698  beta-lactamase domain protein  57.34 
 
 
641 aa  783    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.132267  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0966  beta-lactamase domain protein  56.79 
 
 
641 aa  763    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0049  beta-lactamase domain-containing protein  55.17 
 
 
635 aa  744    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2052  beta-lactamase domain protein  54.53 
 
 
640 aa  727    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0193  cleavage and polyadenylation specificity factor  66.72 
 
 
637 aa  934    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.209182  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0190  beta-lactamase domain-containing protein  55.49 
 
 
635 aa  742    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1572  beta-lactamase domain-containing protein  55.49 
 
 
635 aa  741    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.342192  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2598  KH-domain/beta-lactamase-domain protein  57.39 
 
 
644 aa  783    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1385  beta-lactamase domain-containing protein  62.64 
 
 
639 aa  870    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.741277  normal  0.763255 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3129  beta-lactamase domain protein  53.93 
 
 
634 aa  709    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.43915 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1721  beta-lactamase domain-containing protein  55.49 
 
 
635 aa  742    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.959276 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0845  beta-lactamase-like  62.2 
 
 
629 aa  842    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.554835  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0375  beta-lactamase-like protein  66.19 
 
 
636 aa  934    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000359908  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0122  KH-domain/beta-lactamase-domain protein  53.01 
 
 
647 aa  717    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0325  KH-domain/beta-lactamase-domain protein  57.7 
 
 
644 aa  784    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.04093  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0777  beta-lactamase domain protein  64.09 
 
 
630 aa  886    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.867846  normal  0.0104567 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1199  beta-lactamase domain-containing protein  65.2 
 
 
630 aa  888    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0390608  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0082  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
635 aa  1298    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1014  ADP-ribosylation/crystallin J1  59.59 
 
 
636 aa  806    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.5583 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0882  beta-lactamase domain-containing protein  55.49 
 
 
635 aa  742    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.28665  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2254  beta-lactamase domain-containing protein  47.6 
 
 
642 aa  597  1e-169  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.311245 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1817  KH-domain/beta-lactamase-domain protein  46.38 
 
 
635 aa  579  1e-164  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1727  beta-lactamase domain-containing protein  45.3 
 
 
646 aa  549  1e-155  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0637994 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0309  beta-lactamase domain-containing protein  43.35 
 
 
639 aa  526  1e-148  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0455  beta-lactamase domain-containing protein  40.81 
 
 
636 aa  511  1e-143  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.263173 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1107  beta-lactamase domain-containing protein  42.24 
 
 
640 aa  482  1e-134  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.519523  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0030  beta-lactamase domain-containing protein  41.67 
 
 
634 aa  477  1e-133  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0060  beta-lactamase domain-containing protein  41.77 
 
 
634 aa  476  1e-133  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.287706  normal  0.0538773 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0064  beta-lactamase domain-containing protein  40.28 
 
 
635 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1047  beta-lactamase domain-containing protein  39.23 
 
 
426 aa  305  2.0000000000000002e-81  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1292  beta-lactamase domain-containing protein  36.82 
 
 
422 aa  291  2e-77  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.358627  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0626  beta-lactamase domain-containing protein  36.82 
 
 
422 aa  291  2e-77  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0197  beta-lactamase domain-containing protein  36.36 
 
 
422 aa  288  2e-76  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.904798  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0691  beta-lactamase domain-containing protein  37.7 
 
 
421 aa  283  7.000000000000001e-75  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1187  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  32.15 
 
 
536 aa  225  2e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.177034  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0238  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 
468 aa  223  8e-57  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.465693 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1277  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  31.22 
 
 
540 aa  214  3.9999999999999995e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1728  beta-lactamase domain-containing protein  32.75 
 
 
425 aa  213  1e-53  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.254192  decreased coverage  0.00045837 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1759  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  31.69 
 
 
543 aa  212  1e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1938  beta-lactamase domain protein  30.85 
 
 
821 aa  212  2e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.199019  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1776  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  33.96 
 
 
460 aa  211  2e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.904116  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0611  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  31.47 
 
 
541 aa  210  6e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000296821  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0992  Beta-lactamase-like:RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  32.03 
 
 
470 aa  209  1e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1206  beta-lactamase domain-containing protein  34.11 
 
 
433 aa  208  2e-52  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0642  exonuclease  32.68 
 
 
469 aa  209  2e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000258182  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0025  beta-lactamase domain-containing protein  31.92 
 
 
432 aa  208  2e-52  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0768  beta-lactamase domain protein  33.05 
 
 
451 aa  208  2e-52  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000108746  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1747  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  31.65 
 
 
467 aa  207  6e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1416  beta-lactamase domain-containing protein  33.95 
 
 
433 aa  207  6e-52  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.449675  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1361  beta-lactamase domain protein  31.95 
 
 
422 aa  207  7e-52  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2360  hypothetical protein  31.87 
 
 
470 aa  206  1e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0096  beta-lactamase-like  32.97 
 
 
411 aa  205  2e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.619146  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1428  beta-lactamase domain-containing protein  33.41 
 
 
433 aa  205  2e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.1615  normal  0.318951 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0726  beta-lactamase domain protein  32.45 
 
 
465 aa  205  2e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.723322 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2788  beta-lactamase domain protein  31.69 
 
 
570 aa  205  2e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001774  metallo-beta-lactamase family protein RNA-specific  31.67 
 
 
441 aa  204  3e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.122303  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0394  beta-lactamase domain protein  30.23 
 
 
547 aa  204  3e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2156  beta-lactamase domain protein  33.47 
 
 
460 aa  204  5e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0490  beta-lactamase domain-containing protein  30.85 
 
 
463 aa  204  5e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.955165 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0095  metallo-beta-lactamase superfamily protein  31.15 
 
 
474 aa  202  9.999999999999999e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.04699  normal  0.438592 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0480  beta-lactamase domain-containing protein  33.18 
 
 
433 aa  203  9.999999999999999e-51  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.104405  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1548  beta-lactamase domain-containing protein  34.03 
 
 
425 aa  201  3e-50  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00297769  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1781  metallo-beta-lactamase family protein  30.46 
 
 
535 aa  200  5e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.133044  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3744  beta-lactamase domain protein  29.94 
 
 
466 aa  200  6e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000226651  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1749  beta-lactamase domain-containing protein  33.04 
 
 
428 aa  200  6e-50  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00852065 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1456  beta-lactamase domain protein  31.86 
 
 
464 aa  200  7e-50  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1362  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  31.89 
 
 
471 aa  200  7e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2064  beta-lactamase domain protein  33.26 
 
 
460 aa  199  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.576902  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0558  beta-lactamase domain-containing protein  33.64 
 
 
430 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00303127 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3028  beta-lactamase domain-containing protein  32.42 
 
 
455 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.745492  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38530  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  31.6 
 
 
468 aa  198  2.0000000000000003e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0506935  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0851  beta-lactamase domain protein  32.02 
 
 
464 aa  198  2.0000000000000003e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0171  beta-lactamase domain protein  29.41 
 
 
536 aa  197  3e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000341552 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1266  beta-lactamase-like protein  31.41 
 
 
469 aa  198  3e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.23851  normal  0.0118241 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2041  beta-lactamase domain-containing protein  33.18 
 
 
461 aa  198  3e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00175331 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4513  beta-lactamase domain protein  31.55 
 
 
454 aa  197  5.000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0937857  normal  0.557779 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5264  beta-lactamase domain-containing protein  30.47 
 
 
830 aa  197  5.000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4381  beta-lactamase domain protein  31.55 
 
 
454 aa  197  5.000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.496128  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2691  beta-lactamase domain-containing protein  32.01 
 
 
452 aa  197  6e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.770917  normal  0.585542 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1382  beta-lactamase-like protein  31.16 
 
 
455 aa  197  7e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0930  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  32.79 
 
 
410 aa  196  9e-49  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1539  beta-lactamase domain-containing protein  31.89 
 
 
421 aa  196  1e-48  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000502709 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1075  beta-lactamase domain protein  32.35 
 
 
522 aa  196  1e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1906  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  33.19 
 
 
466 aa  196  1e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0103  beta-lactamase domain protein  30.77 
 
 
465 aa  194  3e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.623243  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1400  beta-lactamase domain-containing protein  32.2 
 
 
535 aa  194  3e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.736343  normal  0.560132 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3493  metallo-beta-lactamase family protein  30.98 
 
 
468 aa  194  4e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.828376  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1267  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  31.49 
 
 
465 aa  194  4e-48  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2486  beta-lactamase domain-containing protein  31.92 
 
 
467 aa  194  5e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000215978 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2467  beta-lactamase domain-containing protein  34.09 
 
 
455 aa  194  6e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.941259  normal  0.38784 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3291  metallo-beta-lactamase family protein  33.86 
 
 
455 aa  193  7e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.119615  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0705  beta-lactamase domain-containing protein  30.17 
 
 
525 aa  193  7e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0554  beta-lactamase domain-containing protein  28.99 
 
 
464 aa  193  8e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.199142  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3879  beta-lactamase-like  33.56 
 
 
452 aa  193  9e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.486794  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1772  beta-lactamase domain-containing protein  29.85 
 
 
465 aa  193  9e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1444  metallo-beta-lactamase family protein  30.53 
 
 
470 aa  192  1e-47  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0201  hypothetical protein  30.6 
 
 
452 aa  191  2e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.384627 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0378  beta-lactamase domain protein  32.17 
 
 
411 aa  192  2e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.834555  normal  0.393865 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1299  beta-lactamase domain protein  30.69 
 
 
470 aa  192  2e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.591175  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0816  beta-lactamase domain protein  29.03 
 
 
462 aa  191  2.9999999999999997e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>