86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0067 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_0067  PadR-like family transcriptional regulator  100 
 
 		 129 aa  258  1e-68  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.995572  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0340  PadR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 131 aa  70.1  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.637105 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2053  transcriptional regulator, PadR-like family  39.13 
 
 		 180 aa  61.2  0.000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000846941 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1488  response regulator receiver protein  27.78 
 
 		 450 aa  57  0.00000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.379239 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1528  response regulator receiver protein  29.52 
 
 		 450 aa  55.8  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.00374994  normal  0.77554 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3486  PadR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 155 aa  55.8  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.179924 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5239  PadR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 213 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4960  PadR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 220 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4871  PadR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 220 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1695  transcriptional regulator, PadR-like family  40.26 
 
 		 195 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000619842 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1309  PadR-like family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 189 aa  53.1  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.123604 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2175  transcriptional regulator, PadR-like family  34.94 
 
 		 114 aa  52.8  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000935551  normal  0.0245277 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0311  PadR-like family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 159 aa  51.6  0.000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5462  PadR-like family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 249 aa  50.8  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.802601 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1087  PadR family transcriptional regulator  32 
 
 		 113 aa  50.4  0.000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0408636 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3835  transcriptional regulator, PadR-like family  37.84 
 
 		 263 aa  50.1  0.000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0380451  normal  0.116098 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1895  PadR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 115 aa  50.4  0.000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1748  transcriptional regulator, PadR-like family  37.97 
 
 		 217 aa  49.7  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000246986  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2223  PadR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 372 aa  50.1  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0957891  hitchhiker  0.0000188934 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1330  PadR-like family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 240 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.855689  normal  0.544163 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5903  transcriptional regulator, PadR-like family  36.76 
 
 		 316 aa  49.3  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.33122  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1925  PadR-like family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 118 aa  48.1  0.00004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1147  PadR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 240 aa  48.1  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6747  transcriptional regulator protein-like protein  33.68 
 
 		 250 aa  47.4  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.222506 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3476  transcriptional regulator, PadR-like family  40 
 
 		 205 aa  47.4  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.133107  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2278  PadR-like family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 203 aa  46.2  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0846058  normal  0.116293 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1507  PadR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 152 aa  46.2  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3375  transcriptional regulator, PadR-like family  32.43 
 
 		 114 aa  46.2  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000695283  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5885  transcriptional regulator, PadR-like family  33.33 
 
 		 334 aa  46.6  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0613  PadR-like family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 101 aa  45.4  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1068  transcriptional regulator, PadR family  32.56 
 
 		 110 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00406829  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1313  transcriptional regulator, PadR-like family  33.71 
 
 		 113 aa  45.8  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.107904  normal  0.0202461 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5149  transcriptional regulator, PadR-like family  30.43 
 
 		 117 aa  45.8  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0918525  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5114  PadR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 121 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2108  transcriptional regulator, PadR-like family  38.81 
 
 		 251 aa  45.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.48804 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0735  PadR-like family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 111 aa  45.8  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0073319 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4626  PadR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 114 aa  45.4  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.658032 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0619  PadR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 305 aa  45.1  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.224139  normal  0.712803 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3967  PadR-like family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 152 aa  45.1  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2202  PadR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 102 aa  45.4  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3465  transcriptional regulator, PadR-like family  42.65 
 
 		 230 aa  45.1  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.236404 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0950  PadR-like family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 110 aa  45.4  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000224962  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5211  PadR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 109 aa  45.1  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5082  transcriptional regulator, PadR family  30.23 
 
 		 109 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2503  PadR-like family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 152 aa  45.1  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1595  PadR-like family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 157 aa  45.4  0.0003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3603  PadR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 113 aa  45.4  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0899906 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1021  transcriptional regulator, PadR-like family  36.23 
 
 		 148 aa  44.7  0.0004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0763  PadR-like family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 108 aa  44.7  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.31288  normal  0.603278 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3563  PadR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 125 aa  44.7  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2059  PadR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 127 aa  44.7  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1993  transcriptional regulator, PadR-like family  28.4 
 
 		 107 aa  44.7  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.765293  normal  0.399206 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4741  transcriptional regulator, PadR-like family  36.11 
 
 		 116 aa  44.7  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0305  transcriptional regulator, PadR-like family  30.59 
 
 		 119 aa  44.7  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.867238  normal  0.137028 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1475  transcriptional regulator, PadR-like family  34.57 
 
 		 116 aa  44.3  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1173  PadR-like family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 131 aa  44.3  0.0006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2308  transcriptional regulator, PadR-like family  32.53 
 
 		 124 aa  44.3  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00197276 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2935  transcriptional regulator, PadR-like family  30.59 
 
 		 116 aa  43.9  0.0007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000047727  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4845  PadR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 188 aa  43.9  0.0008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8234  transcriptional regulator, PadR-like family  32.43 
 
 		 123 aa  43.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3199  transcriptional regulator, PadR-like family  37.31 
 
 		 277 aa  43.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.637642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1303  PadR-like family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 156 aa  43.5  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.213126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0565  PadR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 154 aa  43.1  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1237  transcriptional regulator, PadR-like family  28.16 
 
 		 226 aa  42.7  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0180596 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2191  transcriptional regulator, PadR-like family  35 
 
 		 210 aa  43.5  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0106416  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3031  transcriptional regulator, PadR-like family  32 
 
 		 150 aa  42.7  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00550  predicted transcriptional regulator  38.81 
 
 		 271 aa  42.7  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.100515 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1168  PadR-like family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 152 aa  42.4  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2347  PadR-like family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 103 aa  42.4  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.68087  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3281  PadR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 109 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0782  PadR-like family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 152 aa  42.7  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.661391  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3245  transcriptional regulator, PadR-like family  39.13 
 
 		 206 aa  42.7  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4136  transcriptional regulator, PadR family  30.99 
 
 		 110 aa  42  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.345707  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1102  transcriptional regulator, PadR family  30.99 
 
 		 110 aa  42  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2736  PadR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 236 aa  42  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.504798 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2305  transcriptional regulator, PadR-like family  35.21 
 
 		 250 aa  42  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3858  PadR-like family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 110 aa  41.6  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0346  PadR-like family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 108 aa  41.6  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4033  transcriptional regulator, PadR-like family  32.39 
 
 		 255 aa  41.6  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.878781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39320  transcriptional regulator, PadR family  37.66 
 
 		 184 aa  41.2  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.700238 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7032  transcriptional regulator, PadR-like family  33.33 
 
 		 181 aa  41.6  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0961  transcriptional regulator, PadR-like family  35.9 
 
 		 115 aa  41.2  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6014  PadR-like family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 325 aa  40.4  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0871441  normal  0.166118 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2728  PadR-like family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 110 aa  40.8  0.007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.323988  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2589  transcriptional regulator, PadR-like family  36.92 
 
 		 119 aa  40.4  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0792  PadR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 157 aa  40  0.01  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>