60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0053 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_0053  hypothetical protein  100 
 
 		 204 aa  393  1e-108  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0647937  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0336  hypothetical protein  39.9 
 
 		 229 aa  142  3e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.705551 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1488  hypothetical protein  31.25 
 
 		 340 aa  73.2  0.000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.560243  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2833  heat shock protein Hsp20  30.82 
 
 		 183 aa  63.2  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1812  hypothetical protein  32.22 
 
 		 170 aa  48.9  0.00005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2384  heat shock protein Hsp20  33.72 
 
 		 164 aa  48.5  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0640  heat shock protein Hsp20  36.49 
 
 		 170 aa  47.4  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.402449  normal  0.271447 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0982  HSP20 family protein  32.11 
 
 		 176 aa  46.6  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6390  heat shock protein Hsp20  30.53 
 
 		 187 aa  46.2  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.065602 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6093  heat shock protein Hsp20  31.18 
 
 		 187 aa  46.2  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1620  heat shock protein Hsp20  29.8 
 
 		 175 aa  46.6  0.0003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.192454  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0231  heat shock protein Hsp20  32.98 
 
 		 176 aa  45.8  0.0004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0010  heat shock protein HSP20  33.02 
 
 		 163 aa  45.8  0.0004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0805  heat shock protein Hsp20  31.9 
 
 		 195 aa  45.4  0.0005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2532  HSP20 family protein  29.17 
 
 		 144 aa  45.1  0.0007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1246  heat shock protein, HSP20 family protein  25.35 
 
 		 177 aa  45.1  0.0007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.143675  normal  0.0444206 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0629  heat shock protein Hsp20  27.17 
 
 		 189 aa  45.1  0.0008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.185609 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2600  putative heat shock protein Hsp20  40 
 
 		 187 aa  44.7  0.0009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.207676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0529  HSP20 family protein  31.36 
 
 		 133 aa  44.7  0.0009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1440  HSP20 family protein  31.36 
 
 		 133 aa  44.7  0.0009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0625  HSP20 family protein  31.36 
 
 		 133 aa  44.7  0.0009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1246  HSP20 family protein  31.36 
 
 		 133 aa  44.7  0.0009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1494  hypothetical protein  35.9 
 
 		 184 aa  44.3  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.911601  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20170  heat shock protein Hsp20  32.97 
 
 		 177 aa  44.3  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.638214  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1471  HSP20 family protein  31.36 
 
 		 133 aa  44.7  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.43946  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2678  HSP20 family protein  34.38 
 
 		 151 aa  44.3  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0537  heat shock protein Hsp20  28.95 
 
 		 173 aa  44.7  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0220395 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1571  putative heat shock protein  31.36 
 
 		 133 aa  44.7  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.483559  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0695  hypothetical protein  31.96 
 
 		 183 aa  44.3  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.756333  normal  0.812325 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2601  Hsp20 family heat-shock protein  32.97 
 
 		 135 aa  44.3  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0188281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1171  heat shock protein Hsp20  26.36 
 
 		 189 aa  44.7  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.726376  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0052  heat shock protein Hsp20  29.03 
 
 		 151 aa  43.9  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1492  heat shock protein Hsp20  37.04 
 
 		 182 aa  43.9  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0735  heat shock protein Hsp20  26.21 
 
 		 145 aa  43.5  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000037192  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0369  HSP20 family protein  28.3 
 
 		 153 aa  43.9  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.93231e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3412  small HspC2 heat shock protein  28.26 
 
 		 189 aa  43.5  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.260583  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2522  heat shock protein Hsp20  27.78 
 
 		 150 aa  43.5  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0447  heat shock protein Hsp20  36.49 
 
 		 171 aa  43.9  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3394  heat shock protein Hsp20  27 
 
 		 189 aa  43.1  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0219016  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2810  HSP20 family protein  31.62 
 
 		 131 aa  43.1  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0175635  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0906  hypothetical protein  30.77 
 
 		 165 aa  43.1  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0942345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2351  heat shock protein Hsp20  27.37 
 
 		 158 aa  42.4  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1657  heat shock protein Hsp20  29.82 
 
 		 174 aa  42.7  0.004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.760781 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5491  heat shock protein Hsp20  33.7 
 
 		 211 aa  42.7  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.710483  normal  0.352797 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2802  heat shock protein Hsp20  28.57 
 
 		 167 aa  42.4  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.20157 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3582  heat shock protein Hsp20  26.96 
 
 		 166 aa  42  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2287  heat shock protein Hsp20  27.17 
 
 		 189 aa  42  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02640  low molecular weight heat shock protein  30 
 
 		 158 aa  42  0.006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1648  heat shock protein, Hsp20 family  28.36 
 
 		 148 aa  42  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.715277  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1347  heat shock protein Hsp20  28.36 
 
 		 148 aa  42  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.452932  normal  0.819182 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6892  heat shock protein Hsp20  31.58 
 
 		 157 aa  41.6  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.862152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0891  heat shock protein Hsp20  29.47 
 
 		 137 aa  41.6  0.008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.805469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3074  heat shock protein Hsp20  30 
 
 		 144 aa  41.6  0.008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2578  putative heat shock protein  28.12 
 
 		 185 aa  41.6  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1856  heat shock protein Hsp20  23.15 
 
 		 176 aa  41.6  0.008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2730  heat shock protein Hsp20  29.67 
 
 		 148 aa  41.6  0.009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3241  heat shock protein Hsp20  31.11 
 
 		 166 aa  41.6  0.009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.406826  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0247  heat shock protein Hsp20  29.23 
 
 		 148 aa  41.6  0.009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3667  heat shock protein Hsp20  30.77 
 
 		 139 aa  41.6  0.009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2796  heat shock protein  26.83 
 
 		 152 aa  41.2  0.01  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.300285  normal  0.746249 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>