More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0044 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_0044  geranylgeranyl reductase  100 
 
 		 391 aa  779    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.345503  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1308  geranylgeranyl reductase  58.85 
 
 		 406 aa  482  1e-135  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3422  geranylgeranyl reductase  58.21 
 
 		 407 aa  439  9.999999999999999e-123  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.351163 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0369  geranylgeranyl reductase  55.15 
 
 		 408 aa  438  9.999999999999999e-123  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0683691  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0962  geranylgeranyl reductase  50.77 
 
 		 399 aa  388  1e-107  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.493163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1123  geranylgeranyl reductase  46.52 
 
 		 402 aa  355  6.999999999999999e-97  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0431  PUA domain-containing protein  45.9 
 
 		 397 aa  338  9.999999999999999e-92  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1945  geranylgeranyl reductase  46.67 
 
 		 398 aa  337  2.9999999999999997e-91  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0506  geranylgeranyl reductase  46.65 
 
 		 398 aa  336  2.9999999999999997e-91  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0578  geranylgeranyl reductase  43.37 
 
 		 395 aa  321  9.999999999999999e-87  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1250  geranylgeranyl reductase  40.1 
 
 		 390 aa  272  8.000000000000001e-72  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.375977  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1307  geranylgeranyl reductase  39.45 
 
 		 391 aa  266  5e-70  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.398981  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1375  geranylgeranyl reductase  38.73 
 
 		 390 aa  263  4.999999999999999e-69  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.545102  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1386  geranylgeranyl reductase  39.85 
 
 		 390 aa  262  8e-69  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0522  geranylgeranyl reductase  39.9 
 
 		 390 aa  260  2e-68  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1077  geranylgeranyl reductase  33.09 
 
 		 399 aa  205  1e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0240225  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0718  geranylgeranyl reductase  34.57 
 
 		 387 aa  191  2e-47  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2942  hypothetical protein  33.33 
 
 		 416 aa  180  4e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.33678  normal  0.0128685 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1711  geranylgeranyl reductase  36.6 
 
 		 365 aa  178  1e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0172  bacteriochlorophyll synthase  32.64 
 
 		 396 aa  172  1e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.935683 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0714  geranylgeranyl reductase  30.28 
 
 		 386 aa  161  2e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0661  geranylgeranyl reductase  30.52 
 
 		 375 aa  157  2e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0631  geranylgeranyl reductase  29.8 
 
 		 402 aa  152  1e-35  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1347  geranylgeranyl reductase  31.47 
 
 		 453 aa  151  2e-35  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0129504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0864  geranylgeranyl reductase  28.22 
 
 		 396 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000799674  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0472  geranylgeranyl reductase  27.08 
 
 		 385 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.730289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1447  geranylgeranyl reductase  27.32 
 
 		 392 aa  146  6e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.134641  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0365  geranylgeranyl reductase  26.2 
 
 		 386 aa  145  9e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.230405  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0681  geranylgeranyl reductase  28.19 
 
 		 453 aa  145  1e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00166018  hitchhiker  0.00000684168 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0303  geranylgeranyl reductase  30.75 
 
 		 396 aa  145  1e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.411579  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0671  geranylgeranyl reductase  37.07 
 
 		 381 aa  145  1e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.421353  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0444  geranylgeranyl reductase  35.42 
 
 		 341 aa  144  3e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1090  bacteriochlorophyll synthase 43 kDa subunit  28.78 
 
 		 385 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1073  geranylgeranyl reductase  29.97 
 
 		 452 aa  140  4.999999999999999e-32  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0539  geranylgeranyl reductase  25.66 
 
 		 391 aa  136  8e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0938  geranylgeranyl reductase  29.29 
 
 		 453 aa  130  3e-29  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.129052 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1349  geranylgeranyl reductase  25.45 
 
 		 392 aa  130  3e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0166  geranylgeranyl reductase  26.52 
 
 		 453 aa  129  9.000000000000001e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1392  excinuclease ABC subunit C  28.14 
 
 		 382 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0201698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0668  geranylgeranyl reductase  28.07 
 
 		 458 aa  127  3e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.159483  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0939  FAD dependent oxidoreductase  28.76 
 
 		 385 aa  124  3e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0379493  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0811  geranylgeranyl reductase  28.77 
 
 		 453 aa  124  4e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1220  dehydrogenase (flavoprotein)-like protein  25.54 
 
 		 378 aa  119  9e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0807  geranylgeranyl reductase  29.5 
 
 		 348 aa  117  3.9999999999999997e-25  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00458422  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0810  geranylgeranyl reductase  24.81 
 
 		 384 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0236364  normal  0.332437 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2205  geranylgeranyl reductase  32.14 
 
 		 363 aa  114  3e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1696  geranylgeranyl reductase  30.87 
 
 		 459 aa  110  5e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0583  geranylgeranyl reductase  29.63 
 
 		 425 aa  109  8.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0643  geranylgeranyl reductase  29.14 
 
 		 360 aa  106  6e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.770726  normal  0.124546 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1294  geranylgeranyl reductase  34.02 
 
 		 420 aa  106  9e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.730528  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4420  geranylgeranyl reductase  29.97 
 
 		 418 aa  105  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0881  geranylgeranyl reductase  30.1 
 
 		 455 aa  104  3e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.170951  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0173  geranylgeranyl reductase  26.3 
 
 		 405 aa  102  9e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000608264  normal  0.261316 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3043  geranylgeranyl reductase  25.78 
 
 		 376 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.483009 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4276  geranylgeranyl reductase  26.55 
 
 		 405 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1497  geranylgeranyl reductase  25.76 
 
 		 418 aa  101  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0279  geranylgeranyl reductase  32.14 
 
 		 424 aa  101  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1087  electron transfer flavoprotein  28.21 
 
 		 384 aa  102  2e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.384904  normal  0.110599 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0178  geranylgeranyl reductase  26.05 
 
 		 405 aa  101  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1007  FAD dependent oxidoreductase  28.35 
 
 		 409 aa  100  3e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0385  geranylgeranyl reductase  25.5 
 
 		 457 aa  100  5e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4038  geranylgeranyl reductase  25.5 
 
 		 406 aa  99.8  7e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.670598  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1664  geranylgeranyl reductase  27.27 
 
 		 407 aa  99.4  9e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0044  geranylgeranyl reductase  28.72 
 
 		 380 aa  99.8  9e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0468  geranylgeranyl reductase  30.81 
 
 		 431 aa  99  1e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1298  geranylgeranyl reductase  32.04 
 
 		 369 aa  99.4  1e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2633  geranylgeranyl reductase  25.87 
 
 		 421 aa  98.2  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2954  geranylgeranyl reductase  30.42 
 
 		 457 aa  98.6  2e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2696  geranylgeranyl reductase, plantal and  30 
 
 		 435 aa  97.4  4e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3460  geranylgeranyl reductase  30.12 
 
 		 362 aa  97.1  4e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0973  geranylgeranyl reductase  30.73 
 
 		 430 aa  96.7  6e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0022  geranylgeranyl reductase  28.3 
 
 		 380 aa  96.7  6e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1823  geranylgeranyl reductase  26.25 
 
 		 406 aa  96.7  7e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.626977  normal  0.601961 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1377  geranylgeranyl reductase  29.53 
 
 		 467 aa  96.7  7e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3230  geranylgeranyl reductase  28.08 
 
 		 431 aa  95.9  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716202 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1523  geranylgeranyl reductase  28.02 
 
 		 495 aa  95.5  1e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.545892  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0016  geranylgeranyl reductase  29.65 
 
 		 380 aa  95.9  1e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.828893  normal  0.344079 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1239  geranylgeranyl reductase  25.25 
 
 		 452 aa  95.9  1e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.214331  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0697  FAD dependent oxidoreductase  27.08 
 
 		 393 aa  95.5  1e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2206  FAD dependent oxidoreductase  24.63 
 
 		 410 aa  95.5  1e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.685598 
 
 
-
 
NC_002936  DET0771  hypothetical protein  25.85 
 
 		 379 aa  95.1  2e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1273  geranylgeranyl reductase  31.75 
 
 		 457 aa  94.7  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0513601 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3265  geranylgeranyl reductase  27.19 
 
 		 406 aa  95.1  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0200135 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0266  geranylgeranyl reductase  30.29 
 
 		 445 aa  94.7  2e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.224418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1240  geranylgeranyl reductase  24.94 
 
 		 455 aa  94.4  3e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.525757 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1496  geranylgeranyl reductase  30.3 
 
 		 361 aa  94  4e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.963353  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2774  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  29.13 
 
 		 430 aa  94  4e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.372841  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1955  hypothetical protein  28.33 
 
 		 405 aa  94  5e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2778  geranylgeranyl reductase  29 
 
 		 471 aa  94  5e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1413  geranylgeranyl reductase  29.95 
 
 		 456 aa  93.6  6e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.145276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3127  geranylgeranyl reductase  30 
 
 		 458 aa  92.8  9e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.541663  normal  0.393865 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08221  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  24.4 
 
 		 446 aa  92.8  9e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2507  FAD dependent oxidoreductase  25.71 
 
 		 414 aa  92.4  1e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.206191  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3751  geranylgeranyl reductase  27.49 
 
 		 406 aa  92.4  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0101048  hitchhiker  0.000524672 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08201  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  24.15 
 
 		 446 aa  91.7  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8053  geranylgeranyl reductase  27.99 
 
 		 423 aa  91.7  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.661392 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0513  FAD dependent oxidoreductase  28.19 
 
 		 385 aa  91.7  2e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.349245  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1042  geranylgeranyl reductase  28.57 
 
 		 388 aa  91.7  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1407  geranylgeranyl reductase  27.15 
 
 		 398 aa  92  2e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.426262  normal  0.248213 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0023  geranylgeranyl reductase  26.81 
 
 		 379 aa  90.9  3e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0136897  hitchhiker  0.00371909 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>