More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0034 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_0034  30S ribosomal protein S7P  100 
 
 		 185 aa  379  1e-104  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3687  30S ribosomal protein S7P  66.49 
 
 		 185 aa  260  6.999999999999999e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.270725 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1172  30S ribosomal protein S7P  65.76 
 
 		 186 aa  258  4e-68  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000105021  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2206  30S ribosomal protein S7P  58.47 
 
 		 197 aa  226  2e-58  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.661018  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0509  30S ribosomal protein S7P  54.35 
 
 		 204 aa  221  6e-57  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2384  30S ribosomal protein S7P  55.98 
 
 		 202 aa  218  3e-56  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.469279  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2158  ribosomal protein S7  55.43 
 
 		 202 aa  218  5e-56  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0071  ribosomal protein S7  57.92 
 
 		 187 aa  216  1e-55  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000211426  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0100  30S ribosomal protein S7P  55.68 
 
 		 217 aa  216  1e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.252795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0359  ribosomal protein S7  53.8 
 
 		 202 aa  214  5e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0264  30S ribosomal protein S7P  53.01 
 
 		 204 aa  213  1.9999999999999998e-54  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0280  30S ribosomal protein S7P  53.55 
 
 		 204 aa  208  4e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0531447  normal  0.094163 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1197  ribosomal protein S7  56.22 
 
 		 193 aa  207  9e-53  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0784  30S ribosomal protein S7P  51.08 
 
 		 188 aa  203  1e-51  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2829  30S ribosomal protein S7P  55.74 
 
 		 194 aa  202  2e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.337095 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1614  30S ribosomal protein S7P  51.91 
 
 		 194 aa  202  3e-51  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.759072 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0678  30S ribosomal protein S7P  50.54 
 
 		 188 aa  201  4e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.857285  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1305  30S ribosomal protein S7P  51.08 
 
 		 188 aa  199  9.999999999999999e-51  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0613  30S ribosomal protein S7P  51.08 
 
 		 188 aa  199  9.999999999999999e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0040  30S ribosomal protein S7P  51.35 
 
 		 194 aa  196  2.0000000000000003e-49  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000291032  normal  0.0943991 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0210  30S ribosomal protein S7P  50.54 
 
 		 188 aa  195  3e-49  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0268  30S ribosomal protein S7P  50.81 
 
 		 200 aa  189  2e-47  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0655  30S ribosomal protein S7P  50.27 
 
 		 224 aa  187  8e-47  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.156738  hitchhiker  0.00506477 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1931  30S ribosomal protein S7P  46.45 
 
 		 234 aa  185  4e-46  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.37816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0001  30S ribosomal protein S7P  48.09 
 
 		 223 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0006  30S ribosomal protein S7P  46.99 
 
 		 223 aa  181  5.0000000000000004e-45  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_2007  30S ribosomal protein S7P  46.45 
 
 		 224 aa  178  2.9999999999999997e-44  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006680  CNK03230  40s ribosomal protein s5-1, putative  45.16 
 
 		 205 aa  175  4e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_12674  Ribosomal protein S5, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  45.21 
 
 		 194 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00843  hypothetical protein similar to ribosomal protein S5 (Broad)  44.62 
 
 		 215 aa  167  8e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_29097  predicted protein  43.09 
 
 		 225 aa  163  2.0000000000000002e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78426  predicted protein  43.55 
 
 		 228 aa  161  6e-39  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0242103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0355  30S ribosomal protein S7P  39.79 
 
 		 199 aa  141  4e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0838  ribosomal protein S7  37.86 
 
 		 155 aa  72.8  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.214031  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0808  30S ribosomal protein S7  37.96 
 
 		 157 aa  72.4  0.000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000412886  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0126  30S ribosomal protein S7  32.85 
 
 		 155 aa  70.9  0.00000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1398  30S ribosomal protein S7  36.5 
 
 		 155 aa  68.6  0.00000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000110546  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1288  30S ribosomal protein S7  36.5 
 
 		 155 aa  68.6  0.00000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000249604  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2715  ribosomal protein S7  35.56 
 
 		 156 aa  66.6  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0530682  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1528  ribosomal protein S7  35.77 
 
 		 156 aa  66.2  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000192136  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0977  30S ribosomal protein S7  34.81 
 
 		 156 aa  66.2  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000000522075  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0103  30S ribosomal protein S7  33.58 
 
 		 156 aa  64.7  0.0000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0107  30S ribosomal protein S7  34.07 
 
 		 156 aa  64.3  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000442376  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0315  30S ribosomal protein S7  32.84 
 
 		 156 aa  62.8  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  9.99875e-22  hitchhiker  0.000536681 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0863  30S ribosomal protein S7  35.07 
 
 		 156 aa  62.8  0.000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000741191  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01130  ribosomal protein S7  32.12 
 
 		 155 aa  62.8  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  6.61057e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0710  ribosomal protein S7  36.61 
 
 		 155 aa  62.4  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.191969  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1315  30S ribosomal protein S7  32.85 
 
 		 156 aa  61.6  0.000000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000003043  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2728  30S ribosomal protein S7  35.56 
 
 		 156 aa  60.8  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000610678  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0676  30S ribosomal protein S7  29.93 
 
 		 156 aa  60.5  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00139219  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0662  30S ribosomal protein S7  30.08 
 
 		 156 aa  60.1  0.00000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000445482  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1189  30S ribosomal protein S7  32.85 
 
 		 157 aa  59.7  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.109999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2159  30S ribosomal protein S7  33.57 
 
 		 156 aa  60.1  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.134079  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0694  30S ribosomal protein S7  30.08 
 
 		 156 aa  60.1  0.00000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000170955  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0711  ribosomal protein S7  34 
 
 		 157 aa  60.1  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0100  30S ribosomal protein S7  31.85 
 
 		 156 aa  59.3  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000900899  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0127  30S ribosomal protein S7  31.85 
 
 		 156 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000184124  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4030  30S ribosomal protein S7  32.85 
 
 		 157 aa  59.7  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00016253  hitchhiker  0.00000688583 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2623  30S ribosomal protein S7  32.12 
 
 		 156 aa  59.7  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000189797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0715  30S ribosomal protein S7  31.85 
 
 		 156 aa  59.3  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000287313  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4008  ribosomal protein S7  32.37 
 
 		 162 aa  59.3  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0613135  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1048  30S ribosomal protein S7  32.59 
 
 		 156 aa  58.5  0.00000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000242991  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0106  30S ribosomal protein S7  31.85 
 
 		 156 aa  58.9  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000153509  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1328  30S ribosomal protein S7  29.2 
 
 		 156 aa  58.5  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.34373  normal  0.104548 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0106  30S ribosomal protein S7  31.85 
 
 		 156 aa  58.9  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000101536  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0102  30S ribosomal protein S7  31.85 
 
 		 156 aa  58.9  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.10325e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0100  30S ribosomal protein S7  31.85 
 
 		 156 aa  58.9  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000171364  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0118  30S ribosomal protein S7  31.85 
 
 		 156 aa  58.9  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.49729e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0137  30S ribosomal protein S7  31.85 
 
 		 156 aa  58.9  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000219716  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0106  30S ribosomal protein S7  31.85 
 
 		 156 aa  58.9  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000154226  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0295  30S ribosomal protein S7  30.37 
 
 		 159 aa  58.9  0.00000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0886  30S ribosomal protein S7  30.3 
 
 		 156 aa  58.2  0.00000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00092509 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2464  30S ribosomal protein S7  32.09 
 
 		 156 aa  58.2  0.00000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.025991 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0051  30S ribosomal protein S7  31.34 
 
 		 156 aa  58.2  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0187  30S ribosomal protein S7  30.37 
 
 		 156 aa  57.8  0.00000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00197814  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0583  30S ribosomal protein S7  30.37 
 
 		 156 aa  57.8  0.00000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000892295  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0569  30S ribosomal protein S7  30.37 
 
 		 156 aa  57.8  0.00000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000147883  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2233  30S ribosomal protein S7  34.81 
 
 		 155 aa  57.8  0.00000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000525699  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1908  30S ribosomal protein S7  30.07 
 
 		 156 aa  57.8  0.00000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.049372 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1426  30S ribosomal protein S7  29.2 
 
 		 156 aa  57.8  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0991095  normal  0.0239957 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0949  30S ribosomal protein S7  32.12 
 
 		 155 aa  57  0.0000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000145029  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5074  30S ribosomal protein S7  30.08 
 
 		 156 aa  57.8  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182809  normal  0.19105 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1872  30S ribosomal protein S7  33.81 
 
 		 156 aa  57.4  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.339504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2068  30S ribosomal protein S7  33.33 
 
 		 155 aa  57.4  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000773315  normal  0.805993 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0458  ribosomal protein S7  32.61 
 
 		 156 aa  56.6  0.0000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000000312429  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0176  30S ribosomal protein S7  34.81 
 
 		 155 aa  57  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.000000000018595  normal  0.461741 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0357  30S ribosomal protein S7  31.58 
 
 		 156 aa  57  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.720773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1904  30S ribosomal protein S7  31.58 
 
 		 156 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0532387  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2119  30S ribosomal protein S7  30.66 
 
 		 156 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.369187 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2214  30S ribosomal protein S7  30.66 
 
 		 156 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.269456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4340  30S ribosomal protein S7  29.2 
 
 		 155 aa  56.2  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.30257  normal  0.435501 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16270  SSU ribosomal protein S7P  29.93 
 
 		 156 aa  56.6  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.0000189839  hitchhiker  0.0000425179 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1607  ribosomal protein S7  29.63 
 
 		 155 aa  55.8  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.398796 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2436  30S ribosomal protein S7  30.66 
 
 		 156 aa  55.8  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.421557 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5199  30S ribosomal protein S7  33.04 
 
 		 156 aa  55.8  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107065  unclonable  1.00774e-25 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4448  ribosomal protein S7  29.63 
 
 		 155 aa  56.2  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1834  30S ribosomal protein S7  28.78 
 
 		 156 aa  55.8  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0342202  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0307  30S ribosomal protein S7  32.35 
 
 		 157 aa  55.8  0.0000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.000000218135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2158  30S ribosomal protein S7  30.66 
 
 		 156 aa  55.8  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2069  ribosomal protein S7  26.67 
 
 		 156 aa  55.8  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000023208  normal  0.630428 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>