More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0019 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2085  hypothetical protein  59.96 
 
 
500 aa  644    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41176  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0019  hypothetical protein  100 
 
 
503 aa  1025    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0311  hypothetical protein  59.84 
 
 
500 aa  633  1e-180  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1272  hypothetical protein  60.76 
 
 
502 aa  611  9.999999999999999e-175  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573905  normal  0.202624 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1517  hypothetical protein  58.32 
 
 
502 aa  601  1.0000000000000001e-171  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.743674  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1290  protein of unknown function DUF39  58.52 
 
 
502 aa  597  1e-169  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0616948  normal  0.376218 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0138  hypothetical protein  56.57 
 
 
503 aa  591  1e-167  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0793  hypothetical protein  53.7 
 
 
511 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.455242  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0219  hypothetical protein  53.94 
 
 
513 aa  569  1e-161  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.434471  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0604  hypothetical protein  54.13 
 
 
513 aa  571  1e-161  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.940155 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0451  hypothetical protein  54.93 
 
 
502 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1314  hypothetical protein  53.54 
 
 
513 aa  560  1e-158  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0669  hypothetical protein  52.95 
 
 
513 aa  554  1e-156  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3584  protein of unknown function DUF39  49.62 
 
 
423 aa  387  1e-106  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00707173  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1432  protein of unknown function DUF39  53.09 
 
 
406 aa  379  1e-104  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00503858  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1059  hypothetical protein  52.01 
 
 
403 aa  379  1e-104  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.224866 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0101  hypothetical protein  51.3 
 
 
399 aa  376  1e-103  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.235575  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0732  protein of unknown function DUF39  51.97 
 
 
407 aa  377  1e-103  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.855526  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1464  protein of unknown function DUF39  49.61 
 
 
390 aa  374  1e-102  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.552169 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0430  hypothetical protein  48.32 
 
 
390 aa  366  1e-100  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.943897  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3098  protein of unknown function DUF39  47.93 
 
 
390 aa  364  2e-99  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0613038  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0812  protein of unknown function DUF39  47.49 
 
 
438 aa  362  1e-98  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.433776 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1441  hypothetical protein  47.36 
 
 
412 aa  357  2.9999999999999997e-97  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2469  protein of unknown function DUF39  47.15 
 
 
388 aa  352  7e-96  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000655672  hitchhiker  0.000229248 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0911  hypothetical protein  52.63 
 
 
405 aa  350  3e-95  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00849288  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1281  hypothetical protein  45.41 
 
 
455 aa  350  4e-95  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0805  hypothetical protein  47.98 
 
 
408 aa  345  1e-93  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0664  hypothetical protein  46.13 
 
 
389 aa  344  2e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.120949  normal  0.0723029 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_792  hypothetical protein  47.62 
 
 
408 aa  344  2.9999999999999997e-93  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0921  hypothetical protein  48.43 
 
 
408 aa  343  2.9999999999999997e-93  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3007  hypothetical protein  46.79 
 
 
421 aa  342  1e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2393  hypothetical protein  45.24 
 
 
384 aa  342  1e-92  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.882306 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2809  hypothetical protein  46.11 
 
 
389 aa  336  5e-91  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0777077  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0414  hypothetical protein  45 
 
 
390 aa  336  5.999999999999999e-91  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5211  protein of unknown function DUF39  43.91 
 
 
403 aa  335  1e-90  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000734482 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0733  hypothetical protein  46.17 
 
 
434 aa  331  2e-89  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2541  protein of unknown function DUF39  44.44 
 
 
404 aa  331  2e-89  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3565  protein of unknown function DUF39  44.19 
 
 
404 aa  330  3e-89  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0178473  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0110  hypothetical protein  32.3 
 
 
413 aa  144  5e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.31254  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1625  hypothetical protein  32.21 
 
 
418 aa  143  8e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2735  methanogenesis marker 16 metalloprotein  31.48 
 
 
414 aa  138  3.0000000000000003e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.911419 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2978  hypothetical protein  32.21 
 
 
405 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0798  homoserine O-acetyltransferase  55.17 
 
 
488 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3546  hypothetical protein  30.64 
 
 
438 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0943235  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2043  homoserine O-acetyltransferase  48.15 
 
 
491 aa  118  1.9999999999999998e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.633415 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1460  hypothetical protein  29.64 
 
 
427 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.194077  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1161  homoserine O-acetyltransferase  51.72 
 
 
496 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.985258  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2201  homoserine O-acetyltransferase  50 
 
 
490 aa  114  6e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0429253  normal  0.79235 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0502  pseudouridylate synthase subunit TruB  28 
 
 
408 aa  113  7.000000000000001e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1805  hypothetical protein  31.25 
 
 
388 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0748579  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2428  homoserine O-acetyltransferase  48.28 
 
 
579 aa  110  8.000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71707  normal  0.191879 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0850  hypothetical protein  30.92 
 
 
388 aa  108  2e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.711109  normal  0.0659427 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1067  methanogenesis marker 16 metalloprotein  30.26 
 
 
388 aa  107  4e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0245608  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1207  homoserine O-acetyltransferase  44.96 
 
 
490 aa  106  1e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0144114  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0545  homoserine O-acetyltransferase  47.37 
 
 
487 aa  105  2e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.419548  normal  0.193935 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0914  hypothetical protein  27.18 
 
 
388 aa  104  3e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0172  homoserine O-acetyltransferase  40.68 
 
 
492 aa  99  2e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1368  hypothetical protein  26.37 
 
 
410 aa  89.4  2e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0765  CBS  35.38 
 
 
224 aa  78.2  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2675  CBS:HPP  34.9 
 
 
379 aa  76.6  0.0000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0113  CBS domain containing protein  39.5 
 
 
216 aa  76.6  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2015  CBS domain containing membrane protein  35.88 
 
 
368 aa  75.1  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00292892  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3778  CBS domain-containing protein  40.62 
 
 
225 aa  73.9  0.000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.857066  normal  0.425445 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2437  signal transduction protein  36.89 
 
 
166 aa  73.9  0.000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.188385 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0916  CBS domain-containing protein  39.06 
 
 
225 aa  73.6  0.000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0373364 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0657  signal transduction protein  33.06 
 
 
309 aa  73.6  0.000000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00784458  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6330  CBS domain containing protein  36.75 
 
 
139 aa  72  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.1107  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1013  CBS domain-containing protein  40.65 
 
 
216 aa  72.4  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0086429  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1895  CBS domain-containing protein  36.43 
 
 
133 aa  72  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.272783 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1695  signal transduction protein  31.45 
 
 
281 aa  72.4  0.00000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000133254 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0527  CBS domain containing protein  38.98 
 
 
147 aa  71.2  0.00000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1505  CBS domain-containing protein  30.65 
 
 
282 aa  71.2  0.00000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.206773  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1605  CBS domain-containing protein  35.61 
 
 
215 aa  70.5  0.00000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1308  putative signal transduction protein with CBS domains  29.75 
 
 
161 aa  70.9  0.00000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0503  signal transduction protein  31.06 
 
 
137 aa  70.5  0.00000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0935  CBS domain-containing protein  30.6 
 
 
225 aa  69.3  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.872585  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1231  CBS domain-containing protein  30.3 
 
 
137 aa  68.9  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.022182  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0164  CBS domain-containing protein  30.16 
 
 
139 aa  68.9  0.0000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00289218  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1405  signal transduction protein  31.06 
 
 
137 aa  68.6  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0535  CBS domain-containing protein  28.1 
 
 
256 aa  68.2  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0750  CBS domain containing protein  39.66 
 
 
867 aa  68.2  0.0000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.596795  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1383  signal transduction protein  32.76 
 
 
282 aa  67.8  0.0000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.56563 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0027  CBS domain containing protein  32.87 
 
 
210 aa  67.4  0.0000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.63793  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2980  signal transduction protein  29.1 
 
 
423 aa  67.4  0.0000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1671  CBS domain-containing protein  34.85 
 
 
215 aa  67.4  0.0000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1497  CBS domain containing protein  35.77 
 
 
845 aa  67.4  0.0000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1387  CBS domain containing protein  33.05 
 
 
148 aa  67  0.0000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1567  CBS domain-containing protein  29.41 
 
 
280 aa  66.2  0.000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  unclonable  0.0000000000000154873 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2958  putative signal transduction protein with CBS domains  29.77 
 
 
217 aa  65.5  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.330392  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1823  putative chloride channel  35.34 
 
 
593 aa  65.5  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.039576  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2776  putative signal transduction protein with CBS domains  33.85 
 
 
141 aa  65.9  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000774578 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1198  CBS  36.67 
 
 
139 aa  65.5  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1614  CBS domain containing membrane protein  33.05 
 
 
155 aa  65.9  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.267585  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2342  CBS domain-containing protein  34.07 
 
 
145 aa  65.9  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1763  putative PAS/PAC sensor protein  31.71 
 
 
698 aa  65.5  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2162  Cl- channel, voltage gated  37.5 
 
 
862 aa  64.7  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.30551 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2115  signal transduction protein  32.5 
 
 
300 aa  65.1  0.000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.548765 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1915  CBS domain-containing protein  34.62 
 
 
223 aa  65.1  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.451224  unclonable  0.00000680839 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1482  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  31.78 
 
 
482 aa  65.1  0.000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1436  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  31.78 
 
 
482 aa  65.1  0.000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>