More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0015 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 143 aa  279  9e-75  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  48.95 
 
 		 150 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  41.96 
 
 		 150 aa  105  2e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  38.1 
 
 		 157 aa  105  2e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  37.76 
 
 		 147 aa  103  6e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2886  UspA domain-containing protein  44.22 
 
 		 148 aa  102  2e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0844522  normal  0.787665 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0788  UspA domain-containing protein  39.46 
 
 		 147 aa  100  7e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.523142 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  39.44 
 
 		 164 aa  98.6  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0118  UspA domain-containing protein  39.58 
 
 		 144 aa  98.2  3e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.385941 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5263  UspA domain protein  42.36 
 
 		 138 aa  97.4  6e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.179366  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  38.26 
 
 		 151 aa  97.1  8e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  39.58 
 
 		 145 aa  96.3  1e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3218  universal stress protein  44.63 
 
 		 120 aa  96.3  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0127245 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  37.76 
 
 		 148 aa  95.5  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  39.86 
 
 		 148 aa  95.1  3e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  39.44 
 
 		 149 aa  94.7  4e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  38.89 
 
 		 145 aa  94.7  4e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  37.32 
 
 		 290 aa  94.7  4e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  36.36 
 
 		 150 aa  94  6e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  37.25 
 
 		 155 aa  94  7e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  38.46 
 
 		 158 aa  93.6  9e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5121  hypothetical protein  38.36 
 
 		 155 aa  93.6  9e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5738  UspA domain-containing protein  38.36 
 
 		 155 aa  93.6  9e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.192477 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4485  UspA domain-containing protein  38.36 
 
 		 155 aa  93.6  9e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1309  UspA domain protein  39.46 
 
 		 153 aa  93.2  1e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.678787 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2586  universal stress protein  39.13 
 
 		 141 aa  92  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0483395  normal  0.125899 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  38.46 
 
 		 145 aa  91.3  4e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3137  universal stress protein  37.67 
 
 		 155 aa  91.3  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4660  putative universal stress protein (Usp)  41.78 
 
 		 144 aa  91.3  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.969367  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1519  UspA domain-containing protein  39.04 
 
 		 148 aa  90.5  6e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0716802  normal  0.348047 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0228  UspA domain protein  38.31 
 
 		 144 aa  90.5  7e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.115538 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1081  UspA domain-containing protein  41.5 
 
 		 147 aa  90.5  8e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0952859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0997  UspA domain protein  41.5 
 
 		 147 aa  90.5  8e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  37.06 
 
 		 159 aa  90.1  9e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3150  UspA domain-containing protein  37.67 
 
 		 155 aa  89.7  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4356  UspA domain-containing protein  36.11 
 
 		 145 aa  89.7  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.244024  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5009  UspA domain-containing protein  37.67 
 
 		 156 aa  89.7  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  35.81 
 
 		 152 aa  89  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5296  UspA domain-containing protein  38.36 
 
 		 158 aa  89  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1173  UspA domain-containing protein  42.18 
 
 		 147 aa  88.6  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.761945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1858  UspA domain protein  38.89 
 
 		 147 aa  89.4  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4308  hypothetical protein  37.41 
 
 		 147 aa  88.2  4e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00896563  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  37.06 
 
 		 180 aa  87.8  4e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  37.5 
 
 		 145 aa  88.2  4e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  37.76 
 
 		 152 aa  87.8  5e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4350  UspA domain protein  38.73 
 
 		 294 aa  87.4  5e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.252521  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3602  UspA domain protein  32.39 
 
 		 151 aa  87.4  6e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  35.92 
 
 		 287 aa  87.4  7e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  35.66 
 
 		 307 aa  87  8e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2059  UspA domain protein  39.31 
 
 		 156 aa  85.9  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.3944  hitchhiker  0.00218931 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0589  universal stress protein  35.42 
 
 		 140 aa  85.9  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.558284  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1504  hypothetical protein  35.14 
 
 		 151 aa  85.1  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2278  UspA domain protein  36.81 
 
 		 143 aa  84.7  3e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1383  UspA domain protein  33.33 
 
 		 142 aa  85.1  3e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1954  hypothetical protein  36.81 
 
 		 144 aa  85.1  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  35.42 
 
 		 156 aa  85.1  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0704  hypothetical protein  37.76 
 
 		 148 aa  85.1  3e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  38.46 
 
 		 144 aa  84.7  4e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  34.48 
 
 		 153 aa  84.3  5e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0602  UspA domain-containing protein  36 
 
 		 147 aa  84  7e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.491088  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2088  UspA domain-containing protein  36.3 
 
 		 153 aa  83.6  9e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0358891 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1134  UspA domain-containing protein  35.37 
 
 		 167 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  35.86 
 
 		 153 aa  82.8  0.000000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0267  universal stress protein  34.48 
 
 		 145 aa  83.2  0.000000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.793437  normal  0.0161119 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2196  UspA domain-containing protein  37.14 
 
 		 143 aa  82.4  0.000000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  32.62 
 
 		 300 aa  82  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1016  UspA domain-containing protein  36.24 
 
 		 149 aa  82.4  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.597353  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0916  hypothetical protein  33.56 
 
 		 173 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4074  hypothetical protein  36.55 
 
 		 145 aa  82.4  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1603  UspA domain protein  34.27 
 
 		 208 aa  82.4  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  35.29 
 
 		 156 aa  81.6  0.000000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0997  hypothetical protein  40.97 
 
 		 143 aa  82  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0966  hypothetical protein  40.97 
 
 		 143 aa  81.6  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1997  universal stress protein  35.37 
 
 		 144 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0827286  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  37.76 
 
 		 128 aa  81.3  0.000000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3813  UspA domain-containing protein  34.93 
 
 		 156 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.175974  normal  0.56362 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2183  hypothetical protein  33.92 
 
 		 176 aa  80.9  0.000000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1388  UspA domain protein  36.99 
 
 		 145 aa  80.9  0.000000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.120958  normal  0.124251 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3427  UspA domain protein  32.87 
 
 		 156 aa  80.5  0.000000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3403  UspA domain protein  35.46 
 
 		 301 aa  80.5  0.000000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4745  hypothetical protein  36.49 
 
 		 151 aa  80.5  0.000000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.829975  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2306  UspA domain-containing protein  32.19 
 
 		 155 aa  80.5  0.000000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1359  hypothetical protein  34.03 
 
 		 168 aa  80.1  0.000000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1387  hypothetical protein  35.42 
 
 		 144 aa  80.1  0.000000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00373989  normal  0.527764 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4244  UspA domain protein  37.93 
 
 		 283 aa  80.1  0.000000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.284447  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1233  UspA domain protein  34.03 
 
 		 144 aa  79.7  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.997743  normal  0.558302 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3643  UspA domain protein  37.06 
 
 		 141 aa  79.7  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0969583  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2230  UspA domain-containing protein  37.24 
 
 		 171 aa  79.7  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0395018 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0271  UspA domain-containing protein  38.51 
 
 		 250 aa  79.7  0.00000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00141886  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1677  hypothetical protein  36.24 
 
 		 146 aa  80.1  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.884231 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3096  UspA domain protein  32.87 
 
 		 207 aa  79.7  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  34.27 
 
 		 288 aa  79.3  0.00000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1299  UspA domain protein  34.03 
 
 		 144 aa  79.7  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0196706  normal  0.273134 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4273  UspA domain protein  37.41 
 
 		 155 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.664066 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2772  UspA domain-containing protein  39.46 
 
 		 147 aa  79  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0826  universal stress protein  35.51 
 
 		 165 aa  79  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0904  hypothetical protein  35.62 
 
 		 157 aa  79  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.381712  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0848  hypothetical protein  37.93 
 
 		 142 aa  79.3  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.957853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0309  hypothetical protein  32.87 
 
 		 142 aa  79  0.00000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0624  UspA domain-containing protein  36.81 
 
 		 139 aa  79  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>