More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0006 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_0006  methyltransferase small  100 
 
 		 209 aa  432  1e-120  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1437  methyltransferase  53.51 
 
 		 203 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1635  methyltransferase  53.33 
 
 		 197 aa  192  2e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2169  methyltransferase small  47.76 
 
 		 202 aa  167  1e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.59077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1845  methyltransferase small  46.77 
 
 		 203 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0217  methyltransferase  46.19 
 
 		 200 aa  158  5e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1507  methyltransferase small  42.03 
 
 		 207 aa  158  6e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.113673  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2083  methyltransferase small  42.64 
 
 		 204 aa  157  1e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2614  methyltransferase small  47.5 
 
 		 202 aa  154  1e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0529  methyltransferase small  42.79 
 
 		 211 aa  149  2e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.118716  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1709  SAM-binding motif-containing protein  40.85 
 
 		 213 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0202  methyltransferase small  39.91 
 
 		 213 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2486  putative RNA methylase  40.59 
 
 		 207 aa  145  5e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0891  methyltransferase  40.38 
 
 		 213 aa  143  2e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1492  methyltransferase small  41.06 
 
 		 207 aa  140  9.999999999999999e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3583  Methyltransferase type 11  38.65 
 
 		 215 aa  136  2e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0651  methyltransferase related protein  38.54 
 
 		 201 aa  135  6.0000000000000005e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0520  methyltransferase small  40 
 
 		 210 aa  135  6.0000000000000005e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1798  hypothetical protein  38.21 
 
 		 219 aa  134  9.999999999999999e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0317  DNA methylase  32.61 
 
 		 230 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0236  methyltransferase  38.27 
 
 		 202 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.140784 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2199  methyltransferase small  38.86 
 
 		 204 aa  112  3e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0747  methyltransferase small  37.31 
 
 		 202 aa  111  8.000000000000001e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2885  Methyltransferase type 11  37.5 
 
 		 202 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0731  methyltransferase  35.64 
 
 		 192 aa  108  7.000000000000001e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.557885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0577  putative RNA methylase  34 
 
 		 209 aa  99  5e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0475078  hitchhiker  0.00520466 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1027  methyltransferase small  37.82 
 
 		 202 aa  98.2  8e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.653498  normal  0.0217295 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_89455  predicted protein  34.1 
 
 		 273 aa  79  0.00000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0270328  hitchhiker  0.00142671 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2286  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  42.22 
 
 		 299 aa  57  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1998  ribosomal L11 methyltransferase  52.73 
 
 		 253 aa  55.8  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.831895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1372  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.86 
 
 		 303 aa  55.5  0.0000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.71577  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1665  ribosomal L11 methyltransferase  41.03 
 
 		 264 aa  55.1  0.0000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0243  ribosomal protein L11 methyltransferase  42.22 
 
 		 295 aa  55.5  0.0000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1586  ribosomal L11 methyltransferase  53.57 
 
 		 275 aa  55.1  0.0000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.472869  normal  0.567959 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1738  ribosomal L11 methyltransferase  41.03 
 
 		 264 aa  55.1  0.0000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0239  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.11 
 
 		 295 aa  55.1  0.0000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00173  ribosomal protein L11 methyltransferase  48.48 
 
 		 295 aa  54.7  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3845  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.11 
 
 		 295 aa  53.5  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.393013  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1435  ribosomal L11 methyltransferase  40.79 
 
 		 276 aa  53.9  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3684  modification methylase HemK  32.46 
 
 		 270 aa  53.9  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1285  hypothetical protein  35.8 
 
 		 262 aa  53.9  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0843441  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3321  modification methylase, HemK family  41.33 
 
 		 288 aa  53.5  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000192098  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3937  ribosomal protein L11 methyltransferase  58.49 
 
 		 296 aa  52.8  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0015501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0506  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.67 
 
 		 293 aa  53.1  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0662184  hitchhiker  0.00329443 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002195  ribosomal protein L11 methyltransferase  48.48 
 
 		 295 aa  53.1  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00271176  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1796  ribosomal protein L11 methyltransferase  49.09 
 
 		 316 aa  53.1  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.508174  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2947  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.89 
 
 		 297 aa  52.8  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3637  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.89 
 
 		 297 aa  52.8  0.000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0388  ribosomal protein L11 methyltransferase  45.45 
 
 		 293 aa  52.4  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000022526  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4421  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.83 
 
 		 293 aa  52.4  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00260494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0699  methyltransferase type 11  40.68 
 
 		 251 aa  52.4  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0454  ribosomal protein L11 methyltransferase  45.45 
 
 		 293 aa  52.4  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.281322  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3687  ribosomal protein L11 methyltransferase  42.22 
 
 		 295 aa  52.4  0.000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.768619  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1210  ribosomal protein L11 methyltransferase  45.45 
 
 		 306 aa  52.4  0.000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000191055  normal  0.886421 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1783  modification methylase, HemK family  33.75 
 
 		 281 aa  52  0.000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0103  putative RNA methylase  27.34 
 
 		 310 aa  51.6  0.000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.802972  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0194  ribosomal protein L11 methyltransferase  45.59 
 
 		 292 aa  51.6  0.000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0373  ribosomal protein L11 methyltransferase  45.59 
 
 		 292 aa  51.6  0.000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0981448 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_6437  predicted protein  48.08 
 
 		 297 aa  50.8  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000205122  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5177  HemK family modification methylase  31.87 
 
 		 283 aa  51.2  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.825959  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5012  HemK family modification methylase  31.87 
 
 		 283 aa  51.2  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000084912  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5028  HemK family modification methylase  31.87 
 
 		 283 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.497663  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5420  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  31.87 
 
 		 283 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.97899e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5571  HemK family modification methylase  31.87 
 
 		 283 aa  51.2  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0023749  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1101  ribosomal protein L11 methyltransferase  43.24 
 
 		 298 aa  51.2  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0205003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0228  ribosomal protein L11 methyltransferase  43.66 
 
 		 328 aa  50.8  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00278387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1673  HemK family modification methylase  32.38 
 
 		 268 aa  51.2  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0452249  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0566  ribosomal protein L11 methyltransferase  46.97 
 
 		 296 aa  51.2  0.00001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0178303  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3708  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  36.78 
 
 		 285 aa  50.8  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.432001  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4117  ribosomal protein L11 methyltransferase  43.28 
 
 		 293 aa  51.2  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0350894  hitchhiker  0.000425949 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0859  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.57 
 
 		 293 aa  50.8  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.236714  normal  0.0659327 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3390  ribosomal protein L11 methyltransferase  46.48 
 
 		 297 aa  50.8  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.375634 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4079  ribosomal protein L11 methyltransferase  45.16 
 
 		 293 aa  50.4  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0139274  normal  0.0416888 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1185  ribosomal protein L11 methyltransferase  43.94 
 
 		 324 aa  50.8  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00304497 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5455  HemK family modification methylase  31.87 
 
 		 283 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00426366  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1496  ribosomal protein L11 methyltransferase  40.26 
 
 		 296 aa  50.8  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0391  ribosomal protein L11 methyltransferase  43.28 
 
 		 293 aa  50.4  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000998179  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5079  methyltransferase small  29.41 
 
 		 481 aa  50.4  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.857902  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12780  ribosomal protein L11 methyltransferase  46.55 
 
 		 289 aa  50.4  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000157571  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3938  ribosomal protein L11 methyltransferase  45.16 
 
 		 293 aa  50.4  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000797733  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0509  methyltransferase type 11  41.27 
 
 		 210 aa  50.4  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3886  ribosomal protein L11 methyltransferase  45.16 
 
 		 293 aa  50.4  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.393855  hitchhiker  0.00000257617 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5126  HemK family modification methylase  30.77 
 
 		 283 aa  50.4  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0481456  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3963  ribosomal protein L11 methyltransferase  45.16 
 
 		 293 aa  50.4  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00574631  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3442  ribosomal protein L11 methyltransferase  45.16 
 
 		 293 aa  50.4  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.116345  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3208  ribosomal protein L11 methyltransferase  50.88 
 
 		 300 aa  50.1  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0770215  decreased coverage  0.00369905 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5501  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  31.87 
 
 		 283 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000174977  unclonable  6.52131e-26 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0020  HemK family modification methylase  35.14 
 
 		 285 aa  49.7  0.00003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3803  modification methylase, HemK family  37.18 
 
 		 285 aa  49.7  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0208  ribosomal protein L11 methyltransferase  49.06 
 
 		 506 aa  50.1  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00971698  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2938  modification methylase, HemK family  33.33 
 
 		 282 aa  50.1  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.557385  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32720  methyltransferase family protein  37.93 
 
 		 549 aa  50.1  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.676312  normal  0.572008 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0401  ribosomal protein L11 methyltransferase  43.55 
 
 		 293 aa  49.7  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0130632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3624  ribosomal protein L11 methyltransferase  43.55 
 
 		 293 aa  49.7  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000162524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0455  ribosomal protein L11 methyltransferase  46.77 
 
 		 293 aa  50.1  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000781607  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0400  ribosomal protein L11 methyltransferase  43.55 
 
 		 293 aa  49.7  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0151894  normal  0.0533338 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5506  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  31.87 
 
 		 283 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000117496  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0801  putative RNA methylase  26.04 
 
 		 351 aa  49.3  0.00004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1594  ribosomal L11 methyltransferase  44.44 
 
 		 288 aa  49.3  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.77497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3214  methyltransferase of 50S ribosomal subunit protein L11  43.55 
 
 		 311 aa  49.3  0.00004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.450631 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>