17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0005 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_0005  exosome complex RNA-binding protein Csl4  100 
 
 		 185 aa  376  1e-104  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1636  putative RNA-binding protein  45.9 
 
 		 318 aa  162  3e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1438  RNA binding protein  41.4 
 
 		 237 aa  160  7e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0521  RNA-binding S1 domain-containing protein  32.04 
 
 		 188 aa  95.1  5e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1863  exosome complex RNA-binding protein Csl4  32.97 
 
 		 191 aa  91.7  6e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.824984 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1269  RNA binding S1 domain protein  29.12 
 
 		 189 aa  82.8  0.000000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0509  RNA-binding S1 domain-containing protein  25.14 
 
 		 186 aa  65.5  0.0000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.275397  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1566  RNA-binding protein  23.16 
 
 		 183 aa  65.1  0.0000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37291  predicted protein  26.94 
 
 		 248 aa  60.5  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2051  hypothetical protein  27.42 
 
 		 178 aa  56.6  0.0000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.55265 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1587  hypothetical protein  27.78 
 
 		 177 aa  55.5  0.0000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1800  hypothetical protein  25.13 
 
 		 178 aa  53.1  0.000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.304148  normal  0.352885 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0366  exosome complex RNA-binding protein Rrp4  37.12 
 
 		 240 aa  50.8  0.00001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_8172  predicted protein  29.92 
 
 		 127 aa  47.8  0.00009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0000199423  normal  0.0516105 
 
 
-
 
NC_006686  CND01650  conserved hypothetical protein  29.17 
 
 		 191 aa  47.8  0.00009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.432469  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA00790  exosome complex exonuclease rrp4, putative  39.44 
 
 		 331 aa  45.4  0.0004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.937014  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0582  exosome complex RNA-binding protein Rrp4  40.28 
 
 		 237 aa  44.7  0.0008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>