258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3876 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_3876  Threonine aldolase  100 
 
 		 350 aa  702    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.533395 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4433  threonine aldolase  63.82 
 
 		 353 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3029  threonine aldolase  61.27 
 
 		 357 aa  390  1e-107  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1169  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  55.27 
 
 		 353 aa  363  3e-99  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1813  threonine aldolase  55.84 
 
 		 353 aa  347  1e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.183317 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1966  threonine aldolase  55.87 
 
 		 345 aa  343  4e-93  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3617  Threonine aldolase  47.25 
 
 		 350 aa  328  7e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05504  putative low specificity L-threonine aldolase protein  51.74 
 
 		 365 aa  327  2.0000000000000001e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.264443 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1646  L-threonine aldolase  47.09 
 
 		 349 aa  322  6e-87  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3318  Threonine aldolase  47.83 
 
 		 350 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.410103  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2014  Threonine aldolase  51.16 
 
 		 351 aa  319  3.9999999999999996e-86  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.316829  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1475  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  47.13 
 
 		 356 aa  319  3.9999999999999996e-86  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2249  L-threonine aldolase  47.74 
 
 		 349 aa  315  7e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1844  threonine aldolase  47.49 
 
 		 355 aa  312  5.999999999999999e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.95316  normal  0.0155245 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4278  threonine aldolase  47.99 
 
 		 349 aa  305  6e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.431757  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2745  L-threonine aldolase  47.84 
 
 		 352 aa  304  1.0000000000000001e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0052  threonine aldolase, low-specificity, putative  48.12 
 
 		 349 aa  300  2e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.753871  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0977  threonine aldolase  48.99 
 
 		 341 aa  296  3e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.722961  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3736  threonine aldolase  44.38 
 
 		 348 aa  293  3e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3664  threonine aldolase  48.09 
 
 		 347 aa  292  5e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2712  threonine aldolase  47.11 
 
 		 348 aa  291  8e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2198  threonine aldolase  52.31 
 
 		 341 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2302  L-threonine aldolase  48.99 
 
 		 341 aa  275  9e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4021  threonine aldolase  44.32 
 
 		 350 aa  269  5e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0531782  normal  0.267182 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2153  L-threonine aldolase  43.52 
 
 		 338 aa  265  7e-70  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.708772  normal  0.227327 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4955  L-threonine aldolase  40.87 
 
 		 346 aa  262  6e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3442  Threonine aldolase  45.28 
 
 		 346 aa  257  2e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3121  threonine aldolase  45.28 
 
 		 346 aa  257  2e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.021379  normal  0.710874 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0824  Threonine aldolase  41.95 
 
 		 348 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.285953 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0754  Threonine aldolase  42.36 
 
 		 348 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0601486 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0809  L-threonine aldolase  42 
 
 		 350 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.107149 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2821  Threonine aldolase  40.57 
 
 		 343 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.177516  normal  0.0977479 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3267  L-threonine aldolase  44.02 
 
 		 338 aa  252  6e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0859  L-threonine aldolase  44.16 
 
 		 346 aa  252  9.000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.837968  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3408  L-threonine aldolase, low-specificity  44.3 
 
 		 351 aa  251  1e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5210  L-threonine aldolase  44.63 
 
 		 346 aa  251  1e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00923139 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0343  threonine aldolase  43.32 
 
 		 346 aa  251  2e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1314  L-threonine aldolase  41.14 
 
 		 343 aa  251  2e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.341483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3318  Threonine aldolase  44.95 
 
 		 346 aa  250  2e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.564887 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0321  threonine aldolase  43.32 
 
 		 346 aa  250  3e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000281363 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1610  threonine aldolase  38.86 
 
 		 343 aa  250  3e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.692532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4886  threonine aldolase  43.32 
 
 		 346 aa  249  7e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.694097 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0410  threonine aldolase, low-specificity  44.3 
 
 		 346 aa  248  1e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3503  L-threonine aldolase  42.18 
 
 		 353 aa  248  1e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1870  threonine aldolase  39.77 
 
 		 355 aa  248  1e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.163709  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0344  threonine aldolase  43 
 
 		 346 aa  248  1e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2289  Threonine aldolase  41.11 
 
 		 353 aa  247  2e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000548444 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4766  threonine aldolase  44.3 
 
 		 346 aa  246  3e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.168867 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0808  low specificity L-threonine aldolase protein  44.05 
 
 		 345 aa  245  9e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.672671 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1928  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  40.52 
 
 		 352 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0114767  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0880  L-threonine aldolase  44.26 
 
 		 349 aa  242  9e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0983  threonine aldolase  45.31 
 
 		 348 aa  241  1e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00961292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4134  L-threonine aldolase  43 
 
 		 346 aa  241  1e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00000248279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5537  threonine aldolase  46.15 
 
 		 348 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.145661  normal  0.0220713 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1657  L-threonine aldolase  43.59 
 
 		 339 aa  238  1e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.789065  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0496  threonine aldolase  45.66 
 
 		 336 aa  238  2e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.96601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1555  threonine aldolase  42.86 
 
 		 364 aa  236  3e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.746494 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3333  Threonine aldolase  38.48 
 
 		 347 aa  233  4.0000000000000004e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0686  L-threonine aldolase  40.82 
 
 		 352 aa  231  1e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.55205  normal  0.813644 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71440  low specificity l-threonine aldolase  44.3 
 
 		 346 aa  230  2e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000654342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6201  low specificity l-threonine aldolase  44.3 
 
 		 346 aa  230  2e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0230725  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1651  Threonine aldolase  41.33 
 
 		 365 aa  229  5e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000248071 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1000  Threonine aldolase  40.69 
 
 		 371 aa  228  8e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.744976  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1003  Threonine aldolase  40.69 
 
 		 361 aa  229  8e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1658  L-threonine aldolase  41.4 
 
 		 362 aa  228  9e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.771324  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0942  L-threonine aldolase  40.41 
 
 		 361 aa  228  2e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01000  L-threonine aldolase  40.34 
 
 		 357 aa  221  9.999999999999999e-57  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1982  Threonine aldolase  41.98 
 
 		 351 aa  219  5e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000148999  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1286  threonine aldolase  39.18 
 
 		 340 aa  219  5e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.78945  normal  0.413936 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0572  Threonine aldolase  41.35 
 
 		 341 aa  218  1e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0393816 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2606  threonine aldolase  39 
 
 		 346 aa  218  2e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000143153  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9381  Threonine aldolase  39.94 
 
 		 352 aa  216  4e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1236  threonine aldolase  42.48 
 
 		 368 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0865335 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0678  Threonine aldolase  43.04 
 
 		 362 aa  215  9.999999999999999e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000267715 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4532  Threonine aldolase  41.69 
 
 		 369 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.334548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5568  Threonine aldolase  42.74 
 
 		 353 aa  213  3.9999999999999995e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0329  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  39.32 
 
 		 375 aa  211  1e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1898  Threonine aldolase  40.06 
 
 		 375 aa  211  2e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5175  Threonine aldolase  38.42 
 
 		 359 aa  210  3e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5263  L-threonine aldolase  40.34 
 
 		 358 aa  206  7e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5352  L-threonine aldolase  40.34 
 
 		 358 aa  206  7e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5642  L-threonine aldolase  40.06 
 
 		 358 aa  204  2e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2555  Threonine aldolase  39.64 
 
 		 352 aa  203  3e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.913127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1179  threonine aldolase  39.19 
 
 		 343 aa  203  4e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.191301  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30040  L-threonine aldolase  37.46 
 
 		 353 aa  200  3e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1430  L-threonine aldolase  42.98 
 
 		 350 aa  196  6e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5153  threonine aldolase  41.18 
 
 		 374 aa  186  6e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.7123  normal  0.210542 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1176  L-threonine aldolase  41.03 
 
 		 340 aa  185  9e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0112  Threonine aldolase  38.52 
 
 		 387 aa  183  4.0000000000000006e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0921  Threonine aldolase  38.79 
 
 		 350 aa  179  4.999999999999999e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0102  Threonine aldolase  33.05 
 
 		 342 aa  169  5e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1277  Threonine aldolase  35.76 
 
 		 357 aa  154  2e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.520088  normal  0.294941 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7125  Threonine aldolase  30.57 
 
 		 339 aa  146  6e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0474  low-specificity L-threonine aldolase  32.47 
 
 		 345 aa  145  1e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0742  threonine aldolase  38.63 
 
 		 339 aa  143  5e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.622811 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1081  Threonine aldolase  29.66 
 
 		 344 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00175946  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0904  threonine aldolase  29.33 
 
 		 350 aa  136  6.0000000000000005e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000336158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2181  threonine aldolase  29.63 
 
 		 346 aa  135  9.999999999999999e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0421215  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04194  threonine aldolase  35.69 
 
 		 282 aa  131  2.0000000000000002e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0635  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  27.01 
 
 		 344 aa  130  3e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.538663  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>