More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3855 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_3855  ammonium transporter  100 
 
 		 466 aa  927    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0800844 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2526  ammonium transporter  61.63 
 
 		 438 aa  500  1e-140  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2911  ammonium transporter  61.63 
 
 		 438 aa  500  1e-140  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0257  ammonium transporter  61.63 
 
 		 501 aa  478  1e-134  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0408  ammonium transporter  62.35 
 
 		 469 aa  476  1e-133  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.737141  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3217  ammonium transporter  61.87 
 
 		 444 aa  474  1e-132  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1401  ammonium transporter  61.87 
 
 		 466 aa  474  1e-132  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0653  ammonium transporter  61.87 
 
 		 478 aa  474  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0488  ammonium transporter  61.87 
 
 		 500 aa  474  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.256418  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0469  ammonium transporter  61.87 
 
 		 500 aa  474  1e-132  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.929058  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0192  ammonium transporter  61.87 
 
 		 466 aa  474  1e-132  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2828  ammonium transporter  61.87 
 
 		 466 aa  474  1e-132  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0438  ammonium transporter  60.67 
 
 		 500 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.481032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6194  ammonium transporter  60.43 
 
 		 504 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2876  ammonium transporter  60.43 
 
 		 500 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0601179  normal  0.287688 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2251  ammonium transporter  60.43 
 
 		 500 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.112232  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2865  ammonium transporter  60.43 
 
 		 500 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00160968  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1129  ammonium transporter  59.29 
 
 		 431 aa  464  1e-129  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0526  ammonium transporter  60.91 
 
 		 502 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4189  ammonium transporter  60.91 
 
 		 499 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.793194 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0084  ammonium transporter  64.03 
 
 		 449 aa  453  1.0000000000000001e-126  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2782  ammonium transporter  60.67 
 
 		 503 aa  448  1e-125  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0900246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2920  ammonium transporter  60.67 
 
 		 497 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0617737  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1305  ammonium transporter  57.08 
 
 		 444 aa  441  9.999999999999999e-123  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179882 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0598  ammonium transporter  55.76 
 
 		 463 aa  437  1e-121  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00419594 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1490  ammonium transporter  53.38 
 
 		 472 aa  432  1e-120  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1303  ammonium transporter  58.02 
 
 		 459 aa  429  1e-119  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0377  ammonium transporter  55.07 
 
 		 433 aa  425  1e-118  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.182782  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2356  ammonium transporter  51.18 
 
 		 435 aa  419  1e-116  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0959  ammonium transporter  54.37 
 
 		 433 aa  420  1e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4373  ammonium transporter  53.38 
 
 		 439 aa  395  1e-109  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.679539 
 
 
-
 
NC_004310  BR1896  ammonium transporter  53.73 
 
 		 433 aa  398  1e-109  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.786334  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1101  ammonium transporter  50.48 
 
 		 432 aa  387  1e-106  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.991152  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3626  ammonium transporter  45.74 
 
 		 499 aa  386  1e-106  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.115388 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5505  ammonium transporter  54.57 
 
 		 445 aa  384  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.698175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0994  ammonium transporter  52.38 
 
 		 436 aa  385  1e-105  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.540241  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2375  ammonium transporter  46.93 
 
 		 498 aa  381  1e-104  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.442944 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0727  ammonium transporter  52.66 
 
 		 449 aa  380  1e-104  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.379173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0549  ammonium transporter  50.85 
 
 		 427 aa  381  1e-104  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0239  ammonium transporter  56.19 
 
 		 444 aa  378  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.050651  normal  0.714996 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0434  ammonium transporter  49.88 
 
 		 434 aa  377  1e-103  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0771346  normal  0.5124 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69795  ammonium transporter AmtB  55.24 
 
 		 442 aa  376  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.155925  normal  0.25807 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1817  ammonium transporter  46.77 
 
 		 500 aa  375  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.664398  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0294  ammonium transporter  50.36 
 
 		 436 aa  378  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.509038 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5498  ammonium transporter  46.34 
 
 		 500 aa  372  1e-102  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.705033  normal  0.0460746 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5233  ammonium transporter  56.19 
 
 		 443 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.265886  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0343  ammonium transporter  49.33 
 
 		 436 aa  373  1e-102  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0218  ammonium transporter  49.1 
 
 		 524 aa  372  1e-102  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000738069 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0276  ammonium transporter  47.72 
 
 		 443 aa  374  1e-102  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5142  ammonium transporter  56.19 
 
 		 443 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6029  ammonium transporter  55 
 
 		 442 aa  374  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2331  ammonium transporter  51.47 
 
 		 446 aa  373  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.708148 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1860  ammonium transporter  46.58 
 
 		 506 aa  372  1e-102  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.889912 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5294  ammonium transporter  55.48 
 
 		 443 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2051  ammonium transporter  47.76 
 
 		 498 aa  372  1e-102  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.608567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2099  ammonium transporter  48.16 
 
 		 498 aa  370  1e-101  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.315626  normal  0.0101926 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2878  ammonium transporter  51.08 
 
 		 439 aa  370  1e-101  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0199  ammonium transporter  48.99 
 
 		 515 aa  371  1e-101  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.356507 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47780  Ammonium transporter  53.79 
 
 		 438 aa  366  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.261032  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2514  ammonium transporter  46.67 
 
 		 461 aa  365  1e-100  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0323636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0448  ammonium transporter  47.02 
 
 		 480 aa  368  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.595017  normal  0.335861 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2272  ammonium transporter  45.25 
 
 		 467 aa  366  1e-100  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.220314  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1889  ammonium transporter  51.92 
 
 		 434 aa  363  4e-99  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.39856  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1956  ammonium transporter  48.52 
 
 		 494 aa  363  5.0000000000000005e-99  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2065  ammonium transporter  49.29 
 
 		 431 aa  363  5.0000000000000005e-99  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000790161  normal  0.636143 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0292  ammonium transporter  48.19 
 
 		 513 aa  362  8e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0218  ammonium transporter  57.14 
 
 		 445 aa  362  1e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0189  ammonium transporter  57.14 
 
 		 445 aa  362  1e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0192  ammonium transporter  51.57 
 
 		 467 aa  361  1e-98  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2277  ammonium transporter  48.43 
 
 		 441 aa  360  4e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.459413  normal  0.0110546 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2862  ammonium transporter  47.96 
 
 		 457 aa  359  6e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.33659  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0292  ammonium transporter  45.34 
 
 		 500 aa  358  9.999999999999999e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1019  ammonium transporter  49.66 
 
 		 451 aa  358  9.999999999999999e-98  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.197623  normal  0.642415 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0178  ammonium transporter  48.31 
 
 		 482 aa  358  9.999999999999999e-98  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0272  ammonium transporter  47.14 
 
 		 480 aa  357  2.9999999999999997e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.352116 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0241  ammonium transporter  48.07 
 
 		 510 aa  357  2.9999999999999997e-97  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.60924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0706  ammonium transporter  47.48 
 
 		 437 aa  356  3.9999999999999996e-97  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3605  ammonium transporter  47.24 
 
 		 437 aa  356  5e-97  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0054  ammonium transporter  47.95 
 
 		 499 aa  356  5.999999999999999e-97  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0265828  normal  0.286755 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1182  ammonium transporter  47.96 
 
 		 432 aa  355  7.999999999999999e-97  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000100846 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0490  ammonium transporter  47.61 
 
 		 431 aa  355  8.999999999999999e-97  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.641765  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2468  ammonium transporter  51.38 
 
 		 470 aa  355  1e-96  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.47689  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3537  ammonium transporter  47.48 
 
 		 437 aa  355  1e-96  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.945825  decreased coverage  0.00000925998 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3728  ammonium transporter  47.58 
 
 		 437 aa  354  2e-96  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2586  ammonium transporter  48.93 
 
 		 441 aa  353  5e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0516487  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0278  ammonium transporter  46.26 
 
 		 480 aa  352  8e-96  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.379824  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2136  ammonium transporter  48.7 
 
 		 480 aa  352  8e-96  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3941  ammonium transporter  47.27 
 
 		 504 aa  350  4e-95  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0940  ammonium transporter  49.3 
 
 		 489 aa  349  6e-95  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2589  ammonium transporter  49 
 
 		 423 aa  349  6e-95  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000206103  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1061  ammonium transporter  50 
 
 		 461 aa  349  6e-95  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.379928  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0270  ammonium transporter  51.21 
 
 		 433 aa  347  3e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.3359 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2708  ammonium transporter  48.94 
 
 		 515 aa  346  4e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000035421 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1508  ammonium transporter  48.94 
 
 		 515 aa  347  4e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0695  ammonium transporter  48.36 
 
 		 488 aa  346  5e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.7335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0778  ammonium transporter  47.34 
 
 		 466 aa  346  6e-94  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3769  ammonium transporter  46.81 
 
 		 477 aa  345  1e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.63779 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0487  ammonium transporter  47.8 
 
 		 507 aa  345  1e-93  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3995  ammonium transporter  47.13 
 
 		 445 aa  344  2e-93  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.121366  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0241  ammonium transporter  50.48 
 
 		 468 aa  344  2e-93  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.943388 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>