More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3834 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_3834  phosphatidate cytidylyltransferase  100 
 
 
300 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00786591 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0298  phosphatidate cytidylyltransferase  47.95 
 
 
296 aa  231  2e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0486907 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2852  phosphatidate cytidylyltransferase  39.1 
 
 
282 aa  158  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.14681  normal  0.466722 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2519  phosphatidate cytidylyltransferase  40.71 
 
 
280 aa  156  3e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2823  phosphatidate cytidylyltransferase  39.85 
 
 
282 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.509616 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1699  phosphatidate cytidylyltransferase  39.85 
 
 
280 aa  150  2e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0556824  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4434  phosphatidate cytidylyltransferase  42.8 
 
 
270 aa  150  3e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000775882 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2441  phosphatidate cytidylyltransferase  38.75 
 
 
282 aa  150  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.240167  normal  0.118746 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1854  phosphatidate cytidylyltransferase  39.63 
 
 
280 aa  149  4e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0937  normal  0.0629717 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1136  phosphatidate cytidylyltransferase  43.7 
 
 
277 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2044  phosphatidate cytidylyltransferase  42.75 
 
 
286 aa  145  8.000000000000001e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.127944 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1781  phosphatidate cytidylyltransferase  38.18 
 
 
276 aa  143  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.743634 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2084  phosphatidate cytidylyltransferase  41.86 
 
 
286 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.652517  normal  0.236711 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2358  phosphatidate cytidylyltransferase  41.86 
 
 
286 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.213318 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1588  phosphatidate cytidylyltransferase  39.84 
 
 
276 aa  139  7e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.540803  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0587  phosphatidate cytidylyltransferase  36.53 
 
 
272 aa  138  8.999999999999999e-32  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.254571  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3445  phosphatidate cytidylyltransferase  42.55 
 
 
285 aa  137  2e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.182672  normal  0.481873 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3263  phosphatidate cytidylyltransferase  37.91 
 
 
282 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2150  phosphatidate cytidylyltransferase  36.4 
 
 
273 aa  136  4e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1591  phosphatidate cytidylyltransferase  40.6 
 
 
268 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4512  phosphatidate cytidylyltransferase  37.04 
 
 
289 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.353478  normal  0.71378 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1535  phosphatidate cytidylyltransferase  38.49 
 
 
294 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2800  phosphatidate cytidylyltransferase  36.33 
 
 
288 aa  130  3e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00280396  normal  0.703642 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1114  phosphatidate cytidylyltransferase  37.1 
 
 
278 aa  130  3e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1157  phosphatidate cytidylyltransferase  37.41 
 
 
270 aa  128  1.0000000000000001e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.558759  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0634  phosphatidate cytidylyltransferase  41.2 
 
 
281 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.119323  normal  0.0134346 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1365  phosphatidate cytidylyltransferase  36.4 
 
 
273 aa  126  5e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.858414  normal  0.0127657 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2708  phosphatidate cytidylyltransferase  36.4 
 
 
273 aa  125  8.000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.594992  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2034  phosphatidate cytidylyltransferase  38.55 
 
 
270 aa  122  6e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0814  phosphatidate cytidylyltransferase  31.44 
 
 
259 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000421661  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0465  phosphatidate cytidylyltransferase  37.7 
 
 
268 aa  116  5e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0269  putative phosphatidate cytidylyltransferase  36.13 
 
 
211 aa  115  8.999999999999998e-25  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0871132  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1496  phosphatidate cytidylyltransferase  36.36 
 
 
263 aa  113  4.0000000000000004e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.28827  normal  0.939207 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0757  phosphatidate cytidylyl transferase  42.55 
 
 
216 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2456  phosphatidate cytidylyltransferase  34.94 
 
 
283 aa  112  5e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000404138 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1386  phosphatidate cytidylyltransferase  46.33 
 
 
285 aa  112  6e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.596435  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0526  phosphatidate cytidylyltransferase  38.27 
 
 
208 aa  112  8.000000000000001e-24  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0368  phosphatidate cytidylyltransferase  35.61 
 
 
294 aa  110  4.0000000000000004e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.085033  normal  0.21043 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2556  phosphatidate cytidylyltransferase  38.55 
 
 
229 aa  106  4e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0395  phosphatidate cytidylyltransferase  32.17 
 
 
277 aa  103  4e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0393623  normal  0.704946 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3996  phosphatidate cytidylyltransferase  45.24 
 
 
284 aa  102  5e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.428683  normal  0.224886 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3934  phosphatidate cytidylyltransferase  33.58 
 
 
280 aa  102  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1411  phosphatidate cytidylyltransferase  35.09 
 
 
265 aa  101  1e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.212063 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1955  phosphatidate cytidylyltransferase  33.2 
 
 
221 aa  101  2e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.388381  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0828  phosphatidate cytidylyltransferase  40.91 
 
 
260 aa  99.4  7e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00232392  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01126  phosphatidate cytidylyltransferase  46.62 
 
 
270 aa  99.4  7e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188617  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0358  phosphatidate cytidylyltransferase (CDP-diglyceride synthetase)  29.14 
 
 
282 aa  99  8e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0360  phosphatidate cytidylyltransferase  32.41 
 
 
281 aa  99  9e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.73669  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0942  putative phosphatidate cytidylyltransferase  43.41 
 
 
205 aa  99  1e-19  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0168079  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1277  phosphatidate cytidylyltransferase  32.96 
 
 
267 aa  97.4  3e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.159257  normal  0.533898 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1536  phosphatidate cytidylyltransferase  44.09 
 
 
242 aa  96.7  5e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2474  phosphatidate cytidylyltransferase  39.69 
 
 
263 aa  96.3  6e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000621151  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0691  phosphatidate cytidylyltransferase  31.68 
 
 
271 aa  95.9  7e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000011055  unclonable  2.72637e-19 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03232  phosphatidate cytidylyltransferase  35.37 
 
 
280 aa  95.5  9e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3191  phosphatidate cytidylyltransferase  44.3 
 
 
287 aa  94.7  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1385  phosphatidate cytidylyltransferase  33.74 
 
 
267 aa  94  3e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.652196  normal  0.0315124 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1558  phosphatidate cytidylyltransferase  42.31 
 
 
287 aa  93.2  4e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17407  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0485  phosphatidate cytidylyltransferase  35.09 
 
 
296 aa  93.2  4e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.468496  normal  0.270434 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1788  phosphatidate cytidylyltransferase  38.89 
 
 
271 aa  93.6  4e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00193933 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1374  phosphatidate cytidylyltransferase  32.35 
 
 
248 aa  93.6  4e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.19741  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0982  phosphatidate cytidylyltransferase  40.77 
 
 
287 aa  93.6  4e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.375192  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3645  phosphatidate cytidylyltransferase  38.93 
 
 
263 aa  93.2  5e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.177516  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1846  phosphatidate cytidylyltransferase  29.43 
 
 
280 aa  92.8  6e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000959931  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0391  phosphatidate cytidylyltransferase  40.15 
 
 
273 aa  92.8  7e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0806  CDP-diglyceride synthetase  41.73 
 
 
263 aa  92.4  8e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000346941  hitchhiker  0.0000000545456 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1198  phosphatidate cytidylyltransferase  37.66 
 
 
260 aa  92.4  9e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.126624  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1146  Phosphatidate cytidylyltransferase  44.86 
 
 
264 aa  92  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00301357  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3159  Phosphatidate cytidylyltransferase  30.55 
 
 
285 aa  91.7  1e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0555993  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1019  CDP-diglyceride synthase  28.94 
 
 
282 aa  91.3  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000480748  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1559  phosphatidate cytidylyltransferase  41.27 
 
 
285 aa  91.3  2e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000232769  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3429  CDP-diglyceride synthase  28.94 
 
 
282 aa  91.3  2e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00445067  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1072  CDP-diglyceride synthase  28.94 
 
 
282 aa  91.3  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00432402  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3276  phosphatidate cytidylyltransferase  39.68 
 
 
285 aa  90.5  3e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000594072  hitchhiker  0.000341805 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0293  phosphatidate cytidylyltransferase  43.44 
 
 
273 aa  90.5  3e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.111927  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2014  phosphatidate cytidylyltransferase  41.6 
 
 
280 aa  90.5  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.132755  hitchhiker  0.00415273 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2703  phosphatidate cytidylyltransferase  39.37 
 
 
285 aa  90.5  3e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0203173  hitchhiker  0.00298681 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0245  phosphatidate cytidylyltransferase (CDP-diglyceride synthase)  37.59 
 
 
264 aa  90.5  3e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1783  phosphatidate cytidylyltransferase  32.88 
 
 
274 aa  90.5  3e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3354  CDP-diglyceride synthase  41.09 
 
 
285 aa  90.1  4e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0141568  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2971  phosphatidate cytidylyltransferase  42.28 
 
 
283 aa  90.1  4e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.309867  normal  0.92756 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1039  phosphatidate cytidylyltransferase  37.33 
 
 
262 aa  89.7  5e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00281126  unclonable  0.0000000116593 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3156  phosphatidate cytidylyltransferase  38.89 
 
 
285 aa  89.7  5e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0354955  normal  0.0297791 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3584  phosphatidate cytidylyltransferase  37.42 
 
 
281 aa  89.7  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1667  phosphatidate cytidylyltransferase  27.82 
 
 
264 aa  89.7  5e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.114415  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0980  CDP-diglyceride synthetase  42.4 
 
 
265 aa  89.7  5e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0459166  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1275  phosphatidate cytidylyltransferase  39.2 
 
 
285 aa  89.7  6e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.118666  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0479  phosphatidate cytidylyltransferase  35.87 
 
 
279 aa  89.4  7e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1634  phosphatidate cytidylyltransferase  38.58 
 
 
254 aa  89.4  7e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002751  phosphatidate cytidylyltransferase  28.57 
 
 
256 aa  89.4  7e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.157639  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3650  phosphatidate cytidylyltransferase  37.42 
 
 
281 aa  89.4  7e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1949  phosphatidate cytidylyltransferase  27.82 
 
 
267 aa  89  8e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2381  phosphatidate cytidylyltransferase  44.14 
 
 
264 aa  89.4  8e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0262  CDP-diglyceride synthase  41.6 
 
 
285 aa  89  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0277384  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0260  CDP-diglyceride synthase  41.6 
 
 
285 aa  89  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.451367 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1488  phosphatidate cytidylyltransferase  42.15 
 
 
271 aa  89  9e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.250322  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0247  CDP-diglyceride synthase  41.6 
 
 
285 aa  89  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.748652 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0244  CDP-diglyceride synthase  41.6 
 
 
285 aa  89  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.306198 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0244  CDP-diglyceride synthase  41.6 
 
 
285 aa  89  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.384885  normal  0.739542 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1348  phosphatidate cytidylyltransferase  40.65 
 
 
271 aa  89  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0661268  normal  0.336549 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1440  phosphatidate cytidylyltransferase  41.67 
 
 
273 aa  88.6  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000100946 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>