242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3796 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_3796  LrgB family protein  100 
 
 		 240 aa  462  1e-129  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0422  LrgB family protein  65.68 
 
 		 231 aa  298  5e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.408547  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0342  hypothetical protein  67.25 
 
 		 235 aa  296  2e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.814056  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0326  hypothetical protein  66.81 
 
 		 235 aa  293  2e-78  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.568511  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4337  LrgB family protein  65.18 
 
 		 231 aa  279  2e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.4746  normal  0.466601 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7210  putative murein hydrolase export regulator, LrgB family protein  62.28 
 
 		 236 aa  272  4.0000000000000004e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.879392  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0272  hypothetical protein  60.47 
 
 		 235 aa  265  5.999999999999999e-70  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0267  hypothetical protein  60 
 
 		 235 aa  263  2e-69  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19690  hypothetical protein  54.66 
 
 		 228 aa  246  3e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1695  hypothetical protein  53.39 
 
 		 228 aa  237  2e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0900  LrgB-like protein  57.34 
 
 		 228 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4609  LrgB family protein  54.59 
 
 		 228 aa  212  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.242093  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4625  LrgB family protein  53.11 
 
 		 228 aa  187  1e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0669725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4485  LrgB family protein  53.11 
 
 		 223 aa  187  1e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1607  LrgB-like protein  45.29 
 
 		 241 aa  182  5.0000000000000004e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.884781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4427  LrgB family protein  44.39 
 
 		 229 aa  180  2e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.113499  normal  0.606188 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0027  LrgB-like family protein  47.19 
 
 		 240 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2767  hypothetical protein  48.83 
 
 		 240 aa  179  4e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0025  hypothetical protein  48.83 
 
 		 240 aa  179  4e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.216066  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3499  hypothetical protein  48.83 
 
 		 240 aa  179  4e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1870  hypothetical protein  48.83 
 
 		 240 aa  179  4e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0026  LrgB-like family protein  48.83 
 
 		 240 aa  179  4e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.23092  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2682  hypothetical protein  48.83 
 
 		 240 aa  179  4e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0034  LrgB family protein  49.06 
 
 		 240 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.306981  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0043  LrgB family protein  49.06 
 
 		 240 aa  178  4.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.690541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0238  hypothetical protein  48.83 
 
 		 253 aa  178  7e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0082  LrgB-like protein  48.53 
 
 		 224 aa  177  2e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.18459  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0045  LrgB family protein  48.11 
 
 		 240 aa  176  2e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0061  LrgB family protein  49.29 
 
 		 240 aa  176  3e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.775871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0028  LrgB-like protein  48.82 
 
 		 240 aa  175  6e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0042  LrgB family protein  48.82 
 
 		 240 aa  175  6e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0089  LrgB family protein  48.04 
 
 		 224 aa  174  8e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3226  LrgB-like protein  48.34 
 
 		 240 aa  174  9e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.144978 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0099  LrgB family protein  48.04 
 
 		 224 aa  174  9e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2920  LrgB family protein  48.11 
 
 		 240 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0830  LrgB family protein  44.98 
 
 		 229 aa  170  2e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4618  LrgB family protein  41.98 
 
 		 229 aa  168  8e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4525  LrgB family protein  41.98 
 
 		 229 aa  168  8e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4616  LrgB family protein  41.98 
 
 		 229 aa  168  8e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.221956 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4532  lrgB-like family protein  41.98 
 
 		 229 aa  168  8e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.889737  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0273  LrgB family protein  40.65 
 
 		 229 aa  164  9e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0268732  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4667  LrgB family protein  41.51 
 
 		 229 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.598523  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0245  LrgB family protein  45.5 
 
 		 230 aa  162  5.0000000000000005e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1686  hypothetical protein  49.11 
 
 		 229 aa  156  3e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000795605  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1322  LrgB family protein  37.95 
 
 		 232 aa  154  8e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3024  LrgB family protein  42.29 
 
 		 239 aa  149  5e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1048  hypothetical protein  43.75 
 
 		 244 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6539  LrgB family protein  39.45 
 
 		 226 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.198287 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2322  LrgB family protein  37.91 
 
 		 225 aa  146  3e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000117788  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3049  LrgB family protein  43.27 
 
 		 244 aa  145  6e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00126242  normal  0.0295055 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0923  LrgB family protein  43.27 
 
 		 244 aa  145  6e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.47828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0955  LrgB family protein  42.73 
 
 		 239 aa  145  7.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0976  LrgB family protein  42.73 
 
 		 239 aa  145  7.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0886  LrgB family protein  43.27 
 
 		 244 aa  145  7.0000000000000006e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00106123  normal  0.143935 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0990  LrgB family protein  42.73 
 
 		 239 aa  145  8.000000000000001e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3388  LrgB family protein  42.73 
 
 		 239 aa  145  8.000000000000001e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1415  LrgB family protein  37.81 
 
 		 231 aa  144  9e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.429931  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0819  LrgB family protein  37.44 
 
 		 224 aa  142  4e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.061161  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3274  hypothetical protein  36.49 
 
 		 231 aa  142  5e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.640575 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2931  LrgB-like protein  41.12 
 
 		 241 aa  141  9e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02071  predicted inner membrane protein  36.02 
 
 		 231 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1516  LrgB family protein  36.02 
 
 		 231 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2437  hypothetical protein  36.02 
 
 		 231 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2289  hypothetical protein  36.02 
 
 		 231 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00561985 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0829  hypothetical protein  36.02 
 
 		 231 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1506  hypothetical protein  36.02 
 
 		 231 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02030  hypothetical protein  36.02 
 
 		 231 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5235  hypothetical protein  36.44 
 
 		 230 aa  139  3e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.160737  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6059  LrgB family protein  41.83 
 
 		 244 aa  139  3e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.742566  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5217  hypothetical protein  36.44 
 
 		 230 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4959  murein hydrolase export regulator  36.44 
 
 		 230 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0594327  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4811  murein hydrolase export regulator  36.44 
 
 		 230 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.977744  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4821  murein hydrolase export regulator  36.44 
 
 		 230 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0719494  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5281  hypothetical protein  36.44 
 
 		 230 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000270926  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7636  LrgB-like protein  41.83 
 
 		 244 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.393691 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5337  hypothetical protein  36.44 
 
 		 230 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.247434  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5706  hypothetical protein  36.44 
 
 		 230 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0302035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4924  LrgB family protein  35.56 
 
 		 230 aa  137  1e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.609983  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5839  LrgB family protein  41.35 
 
 		 244 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.845294 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3356  LrgB family protein  37.2 
 
 		 225 aa  137  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.591604  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6075  LrgB family protein  41.35 
 
 		 244 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2745  hypothetical protein  35.55 
 
 		 231 aa  137  2e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3711  hypothetical protein  38.16 
 
 		 225 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.34067  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6615  LrgB family protein  41.83 
 
 		 244 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.918495  normal  0.128036 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1536  hypothetical protein  38.16 
 
 		 225 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.020516 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3778  hypothetical protein  38.16 
 
 		 225 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6133  LrgB family protein  41.83 
 
 		 244 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.7753  normal  0.649123 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2795  LrgB-like protein  41.12 
 
 		 241 aa  135  5e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3676  LrgB family protein  35.11 
 
 		 230 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000265737  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1204  LrgB-like protein  40.61 
 
 		 239 aa  135  8e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0574065  normal  0.106071 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0892  LrgB family protein  40.27 
 
 		 229 aa  135  8e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2372  hypothetical protein  33.65 
 
 		 231 aa  134  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3376  murein hydrolase export regulator  37.68 
 
 		 225 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.508194  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2421  hypothetical protein  33.65 
 
 		 231 aa  134  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.890606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2417  hypothetical protein  33.65 
 
 		 231 aa  134  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2328  hypothetical protein  33.65 
 
 		 231 aa  134  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3704  hypothetical protein  37.68 
 
 		 225 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3425  murein hydrolase export regulator  37.68 
 
 		 225 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0481029  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3687  hypothetical protein  37.68 
 
 		 225 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.353433 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3731  hypothetical protein  37.68 
 
 		 225 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>