105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3795 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_3795  LrgA family protein  100 
 
 
135 aa  262  1e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0325  hypothetical protein  64.06 
 
 
139 aa  169  1e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.227394  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0341  hypothetical protein  64.06 
 
 
139 aa  169  1e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0421  LrgA family protein  62.96 
 
 
135 aa  160  4.0000000000000004e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.712638  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4336  LrgA family protein  57.03 
 
 
162 aa  137  7e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.616789  normal  0.455064 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7209  hypothetical protein  54.48 
 
 
139 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.621509  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4610  LrgA family protein  45.13 
 
 
128 aa  89  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0874041  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0268  hypothetical protein  58.82 
 
 
129 aa  88.6  3e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0273  hypothetical protein  57.35 
 
 
129 aa  86.3  1e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4486  LrgA family protein  44.74 
 
 
128 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4626  LrgA family protein  43.75 
 
 
128 aa  83.6  9e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.400287  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19680  hypothetical protein  47.83 
 
 
129 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.54207  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0244  LrgA family protein  36.57 
 
 
157 aa  75.9  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1694  hypothetical protein  46.96 
 
 
129 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0899  LrgA  42.99 
 
 
128 aa  73.6  0.0000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2921  LrgA family protein  39.42 
 
 
163 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1323  LrgA family protein  33.63 
 
 
163 aa  67  0.00000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0046  LrgA family protein  41 
 
 
148 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0035  LrgA family protein  40.86 
 
 
158 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.204482  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0044  LrgA family protein  40.86 
 
 
158 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.8296  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0820  LrgA family protein  35.38 
 
 
148 aa  62.8  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0743787  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1687  hypothetical protein  39.83 
 
 
146 aa  62.8  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000172146  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0027  LrgA  39.8 
 
 
157 aa  62  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0043  LrgA family protein  39.8 
 
 
157 aa  62  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0062  LrgA family protein  38.78 
 
 
157 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3703  holin-like protein  30.84 
 
 
121 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3424  holin-like protein  30.84 
 
 
121 aa  59.7  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0738558  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3375  holin-like protein  30.84 
 
 
121 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.272811  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3227  LrgA  39.76 
 
 
158 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.152047 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2321  holin-like protein  28.97 
 
 
121 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000645302  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3355  holin-like protein  30.91 
 
 
121 aa  60.1  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.455604  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3710  holin-like protein  30.84 
 
 
121 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.343441  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3458  holin-like protein  29.91 
 
 
121 aa  59.3  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.771163  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3730  holin-like protein  29.91 
 
 
121 aa  59.3  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.753868  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3686  holin-like protein  32.35 
 
 
121 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.709581 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0024  LrgA family protein  43.93 
 
 
149 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.131447  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3777  holin-like protein  30.84 
 
 
121 aa  58.9  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1537  holin-like protein  30.84 
 
 
121 aa  58.9  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0242133 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1871  LrgA family protein  42.99 
 
 
132 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0026  LrgA family protein  42.99 
 
 
156 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2681  LrgA family protein  42.99 
 
 
132 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0237  LrgA family protein  42.06 
 
 
156 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0025  LrgA family protein  42.06 
 
 
156 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0090  LrgA family protein  43.37 
 
 
138 aa  56.2  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2768  LrgA family protein  42.06 
 
 
132 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3500  LrgA family protein  42.06 
 
 
156 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1576  LrgA family protein  34.82 
 
 
124 aa  55.8  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000178738  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0100  LrgA family protein  43.37 
 
 
138 aa  55.5  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3200  hypothetical protein  31.82 
 
 
153 aa  53.9  0.0000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.370954  normal  0.0153861 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0272  LrgA family protein  37.96 
 
 
136 aa  53.1  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0320417  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4617  LrgA family protein  37.07 
 
 
136 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4615  LrgA family protein  37.07 
 
 
136 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.299586 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4524  LrgA family protein  37.07 
 
 
136 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4530  LrgA family protein  37.07 
 
 
171 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.896487  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4665  LrgA family protein  37.07 
 
 
171 aa  53.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.338361  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1606  LrgA  37.19 
 
 
186 aa  52  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0885  LrgA family protein  33.04 
 
 
144 aa  51.2  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000433815  normal  0.136129 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0083  LrgA  46.53 
 
 
136 aa  50.8  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.177337  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1793  LrgA  32.17 
 
 
127 aa  50.8  0.000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0922  LrgA family protein  33.04 
 
 
144 aa  50.4  0.000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.310437  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3050  LrgA family protein  34.94 
 
 
144 aa  50.1  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00119689  normal  0.0263199 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1009  LrgA family protein  31.82 
 
 
118 aa  50.1  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0829  LrgA family protein  36.56 
 
 
139 aa  49.3  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4428  LrgA family protein  34.75 
 
 
140 aa  49.3  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.29138  normal  0.409385 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1047  hypothetical protein  34.15 
 
 
128 aa  48.5  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1950  LrgA family protein  22.52 
 
 
119 aa  48.5  0.00003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000107186  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0902  LrgA family protein  29.66 
 
 
144 aa  48.1  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000398223 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0893  LrgA family protein  34.07 
 
 
161 aa  48.1  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0425  LrgA family protein  33.33 
 
 
116 aa  47.8  0.00005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0197927 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3389  LrgA family protein  31.09 
 
 
144 aa  47.8  0.00005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0954  LrgA family protein  31.09 
 
 
144 aa  47.8  0.00005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0989  LrgA family protein  31.09 
 
 
144 aa  47.8  0.00005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0975  LrgA family protein  31.09 
 
 
144 aa  47.8  0.00005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3750  LrgA family protein  35.71 
 
 
113 aa  47.4  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3025  LrgA family protein  33.73 
 
 
144 aa  47  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00870  putative effector of murein hydrolase LrgA  31.07 
 
 
248 aa  46.6  0.0001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5236  holin-like protein  28.07 
 
 
122 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.28078  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4925  holin-like protein  29.9 
 
 
122 aa  45.8  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.365696  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4960  holin-like protein  27.19 
 
 
122 aa  45.1  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.478145  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4812  holin-like protein  27.19 
 
 
122 aa  45.1  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4822  holin-like protein  27.19 
 
 
122 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2557  LrgA family protein  33.66 
 
 
117 aa  45.1  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0686612  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2235  lrgA family protein  31.78 
 
 
125 aa  45.1  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.601171  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5282  holin-like protein  27.19 
 
 
124 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000144803  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5247  holin-like protein  27.19 
 
 
122 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.697113  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5705  holin-like protein  27.19 
 
 
124 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0190593  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5218  holin-like protein  27.19 
 
 
122 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1414  LrgA family protein  30.1 
 
 
116 aa  45.4  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.375061  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5741  LrgA family protein  27.19 
 
 
125 aa  45.1  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.178867  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0432  LrgA  35.11 
 
 
123 aa  44.7  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0332666  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1147  hypothetical protein  28.7 
 
 
130 aa  44.7  0.0005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000363842  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2930  LrgA  30.61 
 
 
128 aa  43.9  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1947  lrgA family protein  30.84 
 
 
125 aa  43.5  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0812  putative effector of murein hydrolase LrgA  36.23 
 
 
134 aa  43.1  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000547644  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1443  holin-like protein  29.63 
 
 
118 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.58028  hitchhiker  0.00000036945 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3599  holin-like protein  38.46 
 
 
118 aa  42.7  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.348579  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3105  LrgA  34.65 
 
 
119 aa  42.7  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3885  holin-like protein  38.46 
 
 
118 aa  42.7  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3766  holin-like protein  38.46 
 
 
118 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000368627 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2564  LrgA family protein  28.74 
 
 
131 aa  41.6  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>