More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3780 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_3780  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  100 
 
 
311 aa  607  1e-173  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1751  electron transfer flavoprotein alpha subunit  75.08 
 
 
311 aa  460  9.999999999999999e-129  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0899131 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3078  electron transfer flavoprotein  68.28 
 
 
311 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00997  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  64.4 
 
 
308 aa  392  1e-108  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.325031  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2186  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  66.56 
 
 
309 aa  386  1e-106  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4201  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  63.93 
 
 
309 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3773  electron transfer flavoprotein alpha subunit  63.61 
 
 
309 aa  378  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3688  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  63.43 
 
 
308 aa  378  1e-104  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1577  electron transfer flavoprotein alpha subunit  60.84 
 
 
309 aa  377  1e-104  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00519055 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1652  electron transfer flavoprotein, alpha subunit-like protein  63.93 
 
 
309 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1996  electron transfer flavoprotein subunit alpha  66.23 
 
 
309 aa  380  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.569896  normal  0.163293 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2145  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  62.78 
 
 
308 aa  378  1e-104  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.104749  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5231  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  62.9 
 
 
314 aa  376  1e-103  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0165926  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15190  Electron transfer flavoprotein, alpha subunit  66.34 
 
 
309 aa  375  1e-103  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0655  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  60.98 
 
 
309 aa  376  1e-103  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.304729  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3525  electron transfer flavoprotein alpha subunit  63.61 
 
 
309 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2210  electron transfer flavoprotein alpha-subunit  65.81 
 
 
309 aa  375  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2173  electron transfer flavoprotein subunit alpha  66.01 
 
 
309 aa  373  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.734786  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4116  electron transfer flavoprotein alpha and beta-subunits  66.23 
 
 
309 aa  372  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.146576 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1607  electron transfer flavoprotein alpha subunit  63.43 
 
 
313 aa  374  1e-102  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14290  Electron transfer flavoprotein, alpha subunit  66.56 
 
 
310 aa  371  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2364  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  65.7 
 
 
309 aa  372  1e-102  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6871  electron transfer flavoprotein alpha subunit  64.08 
 
 
310 aa  368  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.496098  normal  0.308845 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16420  Electron transfer flavoprotein, alpha subunit  63.43 
 
 
309 aa  369  1e-101  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0845524  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2538  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  63.61 
 
 
307 aa  368  1e-101  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000412152  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25880  electron transfer flavoprotein alpha-subunit  66.45 
 
 
309 aa  367  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.272339  normal  0.0503737 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3159  electron transfer flavoprotein alpha subunit  62.46 
 
 
309 aa  365  1e-100  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0763  electron transfer flavoprotein alpha subunit  61.61 
 
 
311 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0754  electron transfer flavoprotein alpha and beta-subunits  61.61 
 
 
314 aa  361  9e-99  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1997  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  61.41 
 
 
312 aa  361  9e-99  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.11647  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1022  electron transfer flavoprotein alpha subunit  61.61 
 
 
311 aa  358  6e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2865  electron transfer flavoprotein alpha subunit  61.81 
 
 
308 aa  358  6e-98  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000168731  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4189  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  60.65 
 
 
310 aa  358  6e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000806502 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0584  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  61.61 
 
 
311 aa  358  6e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.292903  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1063  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  61.61 
 
 
311 aa  358  6e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.760076  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2994  electron transfer flavoprotein alpha subunit  61.49 
 
 
308 aa  358  7e-98  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0210477  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4176  electron transfer flavoprotein alpha and beta-subunits  61.61 
 
 
311 aa  358  8e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0387842  normal  0.412867 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3195  electron transfer flavoprotein, alpha subunit-like protein  61.29 
 
 
309 aa  357  9.999999999999999e-98  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.234178  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2927  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  61.61 
 
 
311 aa  356  1.9999999999999998e-97  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0410  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  61.61 
 
 
311 aa  356  1.9999999999999998e-97  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2976  electron transfer flavoprotein alpha-subunit  61.61 
 
 
311 aa  356  1.9999999999999998e-97  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0930  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  61.61 
 
 
311 aa  356  1.9999999999999998e-97  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2554  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  61.61 
 
 
311 aa  356  1.9999999999999998e-97  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0219  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  61.61 
 
 
311 aa  356  1.9999999999999998e-97  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2984  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  60.65 
 
 
311 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0824213  decreased coverage  0.00070323 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4879  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  62.82 
 
 
317 aa  356  1.9999999999999998e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1512  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  61.81 
 
 
308 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000305192  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2866  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  61.61 
 
 
311 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.786227  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2241  electron transfer flavoprotein alpha subunit  61.29 
 
 
311 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3569  putative electron transfer flavoprotein, alpha subunit  61.29 
 
 
311 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2846  electron transfer flavoprotein alpha subunit  61.49 
 
 
308 aa  356  2.9999999999999997e-97  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000985781  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1470  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  60.65 
 
 
313 aa  356  2.9999999999999997e-97  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0862538  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1654  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  61.61 
 
 
311 aa  355  3.9999999999999996e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1614  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  64.1 
 
 
308 aa  355  3.9999999999999996e-97  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.455824  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0939  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  61.29 
 
 
311 aa  355  3.9999999999999996e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0943  electron transfer flavoprotein alpha subunit  60.97 
 
 
311 aa  355  3.9999999999999996e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.94647  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3144  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  61.81 
 
 
308 aa  354  8.999999999999999e-97  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0954  electron transfer flavoprotein subunit alpha  55.95 
 
 
312 aa  353  2e-96  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0985  electron transfer flavoprotein subunit alpha  55.63 
 
 
312 aa  352  5.9999999999999994e-96  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2747  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  60 
 
 
307 aa  351  1e-95  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000476091  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0615  electron transfer flavoprotein, alpha subunit-like protein  59.68 
 
 
310 aa  350  2e-95  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0862731  normal  0.336717 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7299  electron transfer flavoprotein subunit alpha/beta  60.83 
 
 
314 aa  350  3e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0555297  normal  0.847795 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2510  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  60.19 
 
 
308 aa  348  6e-95  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000427922  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0999  electron transfer flavoprotein subunit alpha  59.24 
 
 
315 aa  348  9e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2391  electron transfer flavoprotein alpha subunit  60.97 
 
 
310 aa  347  1e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.41107  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2533  electron transfer flavoprotein alpha subunit  61.61 
 
 
309 aa  347  2e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2583  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  59.02 
 
 
307 aa  346  2e-94  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000711397  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1353  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  62.46 
 
 
308 aa  345  6e-94  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000384606  hitchhiker  0.00895875 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1418  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  62.46 
 
 
308 aa  345  6e-94  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0628091  normal  0.474151 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1406  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  62.14 
 
 
308 aa  345  6e-94  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000428424  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2854  electron transfer flavoprotein alpha subunit  57.88 
 
 
307 aa  345  7e-94  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1212  electron transfer flavoprotein beta-subunit:electron transfer flavoprotein, alpha subunit  63.55 
 
 
310 aa  345  8e-94  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0179  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  60 
 
 
309 aa  345  8e-94  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1170  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  62.3 
 
 
307 aa  344  1e-93  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000857296  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0533  electron transportr flavoprotein, alpha subunit  60.39 
 
 
310 aa  343  2e-93  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0147  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  65.47 
 
 
311 aa  343  2e-93  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.100621  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2961  electron transfer flavoprotein alpha subunit  58.52 
 
 
317 aa  343  2e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1990  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  60.58 
 
 
311 aa  342  2.9999999999999997e-93  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1297  electron transfer flavoprotein alpha-subunit  60 
 
 
309 aa  342  4e-93  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0755964 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7803  electron transfer flavoprotein alpha subunit  60.19 
 
 
309 aa  342  4e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1446  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  57.05 
 
 
307 aa  342  5e-93  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0198023  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1141  electron transfer flavoprotein subunit alpha  63.87 
 
 
314 aa  342  5e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658876  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0251  electron transfer flavoprotein, alpha subunit, EtfA  58.51 
 
 
327 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1958  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  60.97 
 
 
310 aa  338  5.9999999999999996e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.76693  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4165  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  60.97 
 
 
310 aa  338  5.9999999999999996e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3599  electron transfer flavoprotein alpha subunit  60.97 
 
 
308 aa  338  8e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.460785 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0528  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  58.71 
 
 
310 aa  338  9e-92  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.000381048  hitchhiker  0.00976807 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3142  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  57.74 
 
 
313 aa  337  9.999999999999999e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.372397  normal  0.0252106 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0931  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  62.5 
 
 
316 aa  337  9.999999999999999e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3235  electron transfer flavoprotein alpha subunit  58.36 
 
 
307 aa  337  9.999999999999999e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.320471 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3562  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  60 
 
 
309 aa  337  9.999999999999999e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.17521  normal  0.383199 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1466  electron transfer flavoprotein subunit alpha/beta  60.83 
 
 
314 aa  336  1.9999999999999998e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.180547  normal  0.50057 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0738  electron transfer flavoprotein, subunit alpha  62.58 
 
 
311 aa  337  1.9999999999999998e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0170682  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5518  electron transfer flavoprotein subunit alpha  62.58 
 
 
310 aa  337  1.9999999999999998e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2706  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  65.36 
 
 
309 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.796213  normal  0.172174 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4692  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  58.82 
 
 
310 aa  335  5e-91  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.412407  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4916  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  59.35 
 
 
309 aa  335  7e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0513  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  61.61 
 
 
311 aa  334  1e-90  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1700  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  59.81 
 
 
317 aa  334  1e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.994832  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2539  electron transfer flavoprotein alpha subunit  60 
 
 
308 aa  334  1e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000608168 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>