286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3777 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_3777  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 371 aa  746    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.986155 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6841  NAD binding site FAD dependent oxidoreductase  59.73 
 
 		 367 aa  434  1e-121  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1005  FAD dependent oxidoreductase  60 
 
 		 368 aa  434  1e-120  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.179288 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1081  FAD dependent oxidoreductase  59.12 
 
 		 367 aa  426  1e-118  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0868948  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4647  FAD dependent oxidoreductase  62.47 
 
 		 366 aa  423  1e-117  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1240  FAD dependent oxidoreductase  61.37 
 
 		 367 aa  412  1e-114  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.241084  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1428  FAD dependent oxidoreductase  61.1 
 
 		 368 aa  411  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.085376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1140  FAD dependent oxidoreductase  56.64 
 
 		 368 aa  410  1e-113  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0603157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0217  oxidoreductase, FAD-binding family protein  59.4 
 
 		 373 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.655071  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1259  FAD dependent oxidoreductase  57.14 
 
 		 368 aa  404  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1640  FAD dependent oxidoreductase  57.22 
 
 		 366 aa  404  1e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1916  FAD dependent oxidoreductase  56.13 
 
 		 371 aa  403  1e-111  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0872909 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1090  FAD dependent oxidoreductase  53.91 
 
 		 378 aa  401  1e-111  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.151516  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3382  oxidoreductase, FAD-binding family protein  58.58 
 
 		 373 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3297  oxidoreductase, FAD-binding family protein  58.58 
 
 		 373 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3956  FAD dependent oxidoreductase  59.12 
 
 		 372 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.792256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2706  FAD dependent oxidoreductase  55.86 
 
 		 364 aa  400  9.999999999999999e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0337061  normal  0.0586265 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2434  FAD dependent oxidoreductase  58.87 
 
 		 369 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3067  FAD dependent oxidoreductase  58.87 
 
 		 369 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.41507 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0239  FAD-dependent oxidoreductase  58.58 
 
 		 373 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.202342  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3048  FAD dependent oxidoreductase  58.87 
 
 		 369 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2964  oxidoreductase, FAD-binding family protein  58.58 
 
 		 373 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2124  oxidoreductase, FAD-binding family protein  58.58 
 
 		 373 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.646813  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1451  FAD dependent oxidoreductase  60.65 
 
 		 380 aa  396  1e-109  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0434  oxidoreductase, FAD-binding family protein  58.04 
 
 		 373 aa  393  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0953783  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0251  FAD-dependent oxidoreductase  58.04 
 
 		 373 aa  393  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.627616  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3093  FAD dependent oxidoreductase  58.13 
 
 		 369 aa  394  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2451  FAD dependent oxidoreductase  57.3 
 
 		 367 aa  393  1e-108  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.130562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2959  FAD dependent oxidoreductase  57.85 
 
 		 369 aa  393  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.4255 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3043  FAD dependent oxidoreductase  58.4 
 
 		 369 aa  392  1e-108  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6395  FAD dependent oxidoreductase  58.61 
 
 		 366 aa  390  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.704477 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4334  putative FAD dependent oxidoreductase  58.08 
 
 		 368 aa  389  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2518  FAD dependent oxidoreductase  55.04 
 
 		 374 aa  389  1e-107  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.355851  normal  0.0110864 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2136  FAD dependent oxidoreductase  57.88 
 
 		 371 aa  389  1e-107  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.471962  normal  0.0129365 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5430  FAD dependent oxidoreductase  58.54 
 
 		 364 aa  387  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1646  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  57.61 
 
 		 371 aa  386  1e-106  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.515375  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0387  FAD dependent oxidoreductase  57.26 
 
 		 368 aa  384  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2152  FAD dependent oxidoreductase  55.59 
 
 		 367 aa  379  1e-104  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.841388  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2799  FAD dependent oxidoreductase  56.32 
 
 		 380 aa  380  1e-104  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.444037  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0430  FAD dependent oxidoreductase  56.28 
 
 		 370 aa  381  1e-104  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0106  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  56.44 
 
 		 368 aa  375  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3992  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  56.83 
 
 		 366 aa  376  1e-103  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.475329  normal  0.0131881 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0222  FAD dependent oxidoreductase  57.14 
 
 		 364 aa  376  1e-103  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.199506 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2640  FAD dependent oxidoreductase  57.22 
 
 		 366 aa  373  1e-102  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2833  FAD dependent oxidoreductase  58.5 
 
 		 364 aa  371  1e-101  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.774679  normal  0.0535368 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2758  FAD dependent oxidoreductase  56.51 
 
 		 370 aa  370  1e-101  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2610  FAD dependent oxidoreductase  58.22 
 
 		 364 aa  367  1e-100  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.270535  normal  0.198369 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1030  hypothetical protein  57.82 
 
 		 373 aa  367  1e-100  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.950675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2648  FAD dependent oxidoreductase  55.16 
 
 		 376 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.142643  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3387  FAD dependent oxidoreductase  54.73 
 
 		 365 aa  356  3.9999999999999996e-97  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0416146 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4934  FAD dependent oxidoreductase  55.37 
 
 		 372 aa  345  6e-94  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.2077  normal  0.974431 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4544  FAD dependent oxidoreductase  51.11 
 
 		 372 aa  335  7.999999999999999e-91  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.302597  normal  0.362258 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_41947  predicted protein  45.69 
 
 		 383 aa  331  1e-89  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.856013  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2496  FAD dependent oxidoreductase  47.98 
 
 		 369 aa  327  3e-88  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1595  FAD dependent oxidoreductase  49.72 
 
 		 369 aa  320  1.9999999999999998e-86  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0479283  normal  0.966875 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0628  putative FAD dependent oxidoreductase  47.51 
 
 		 374 aa  314  9.999999999999999e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.323528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0530  FAD dependent oxidoreductase  46.28 
 
 		 375 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5882  hypothetical protein  48.25 
 
 		 368 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0823  FAD dependent oxidoreductase  47.12 
 
 		 371 aa  305  1.0000000000000001e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0633  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  43.16 
 
 		 378 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.399065 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67970  hypothetical protein  47.59 
 
 		 368 aa  287  2e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.224569  normal  0.014096 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_4703  predicted protein  42.52 
 
 		 373 aa  286  2.9999999999999996e-76  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.629805  normal  0.0151489 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4257  FAD dependent oxidoreductase  46.78 
 
 		 363 aa  272  6e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000201073 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0708  FAD dependent oxidoreductase  36.51 
 
 		 362 aa  232  8.000000000000001e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.440314  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41267  glycerol-3-phospate dehydrogenase  39.1 
 
 		 406 aa  225  8e-58  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.847058  normal  0.0947149 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06700  conserved hypothetical protein  30.7 
 
 		 447 aa  183  4.0000000000000006e-45  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.474421  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2121  hydroxyglutarate oxidase  34.41 
 
 		 396 aa  171  1e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.110879  normal  0.696604 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2390  hydroxyglutarate oxidase  34.65 
 
 		 396 aa  172  1e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0316475  normal  0.147851 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1005  hydroxyglutarate oxidase  36.74 
 
 		 410 aa  171  2e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.127914  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0947  hydroxyglutarate oxidase  36.74 
 
 		 410 aa  171  2e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0469  hydroxyglutarate oxidase  34.16 
 
 		 406 aa  170  4e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1595  hydroxyglutarate oxidase  32.43 
 
 		 397 aa  167  4e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000325765 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1295  hydroxyglutarate oxidase  36.33 
 
 		 409 aa  164  3e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4590  FAD dependent oxidoreductase  33.25 
 
 		 394 aa  162  1e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0119  FAD dependent oxidoreductase  33.67 
 
 		 395 aa  158  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1995  hydroxyglutarate oxidase  30.34 
 
 		 425 aa  156  5.0000000000000005e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2220  hydroxyglutarate oxidase  33.1 
 
 		 427 aa  152  1e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.531505  normal  0.0413594 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1888  hydroxyglutarate oxidase  33.1 
 
 		 427 aa  150  4e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.452346 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4036  hydroxyglutarate oxidase  31.02 
 
 		 403 aa  150  4e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.534482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2365  FAD dependent oxidoreductase  32.66 
 
 		 409 aa  149  5e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000683607  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1187  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  33.85 
 
 		 390 aa  149  8e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.837023  normal  0.120282 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2614  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  33.25 
 
 		 396 aa  147  3e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1941  FAD dependent oxidoreductase  32.02 
 
 		 412 aa  147  3e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21030  hydroxyglutarate oxidase  32.31 
 
 		 398 aa  145  8.000000000000001e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00231927  normal  0.19129 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000810  hypothetical protein YgaF  26.96 
 
 		 408 aa  143  5e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1660  dehydrogenase  29.7 
 
 		 625 aa  143  5e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3780  FAD dependent oxidoreductase  32.75 
 
 		 403 aa  143  6e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3902  hydroxyglutarate oxidase  29.41 
 
 		 422 aa  142  6e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2987  hydroxyglutarate oxidase  29.66 
 
 		 422 aa  143  6e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0612118  normal  0.154389 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3091  hydroxyglutarate oxidase  29.16 
 
 		 422 aa  142  7e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.854212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2970  hydroxyglutarate oxidase  29.16 
 
 		 422 aa  142  7e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0184807 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06715  hydroxyglutarate oxidase  26.77 
 
 		 410 aa  142  8e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2903  hydroxyglutarate oxidase  29.16 
 
 		 422 aa  142  9e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8880  hypothetical protein  34.24 
 
 		 396 aa  142  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0769827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2934  hydroxyglutarate oxidase  29.67 
 
 		 422 aa  142  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.23592  normal  0.213528 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3277  FAD dependent oxidoreductase  33 
 
 		 396 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.289099  normal  0.220627 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2795  hydroxyglutarate oxidase  29.33 
 
 		 422 aa  141  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1046  hydroxyglutarate oxidase  29.33 
 
 		 422 aa  141  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2910  hydroxyglutarate oxidase  29.63 
 
 		 416 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.5601 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2873  hydroxyglutarate oxidase  29.37 
 
 		 416 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>