39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3754 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_3754  NHL repeat containing protein  100 
 
 		 398 aa  793    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0470  hypothetical protein  68.02 
 
 		 371 aa  519  1e-146  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.043698 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1812  NHL repeat containing protein  52.14 
 
 		 397 aa  395  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0790  NHL repeat-containing protein  51.88 
 
 		 395 aa  389  1e-107  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.395295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0113  NHL repeat containing protein  50.8 
 
 		 397 aa  387  1e-106  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0109  NHL repeat containing protein  50.53 
 
 		 397 aa  383  1e-105  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.894409 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3206  NHL repeat-containing protein  51.76 
 
 		 419 aa  375  1e-103  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4601  NHL repeat-containing protein  49.73 
 
 		 390 aa  374  1e-102  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3874  NHL repeat containing protein  48.53 
 
 		 388 aa  368  1e-101  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0711  NHL repeat protein  51.6 
 
 		 398 aa  358  9e-98  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0859  NHL repeat containing protein  51.6 
 
 		 398 aa  358  9e-98  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3798  NHL repeat-containing protein  41.14 
 
 		 367 aa  270  2e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.88272 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1073  NHL repeat-containing protein  45.14 
 
 		 362 aa  264  2e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0871328  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3229  NHL repeat containing protein  43.3 
 
 		 380 aa  264  2e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.657691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0477  NHL repeat containing protein  41.64 
 
 		 368 aa  261  2e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.517472  normal  0.232991 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2370  NHL repeat-containing protein  40.46 
 
 		 397 aa  252  1e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0112642 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3876  NHL repeat containing protein  37.21 
 
 		 379 aa  223  4.9999999999999996e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00583  hypothetical protein  27.53 
 
 		 472 aa  61.2  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.718247  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2272  glycoside hydrolase family 26  27.4 
 
 		 711 aa  54.7  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.738347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1402  NHL repeat containing protein  25.52 
 
 		 470 aa  54.3  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.649211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2063  NHL repeat containing protein  25.5 
 
 		 652 aa  53.9  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0567  Redoxin domain protein  25.37 
 
 		 498 aa  52.4  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0242  NHL repeat-containing protein  22.8 
 
 		 1146 aa  51.6  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00900908 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2074  NHL repeat containing protein  24.3 
 
 		 522 aa  50.8  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.614793 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4099  NHL repeat containing protein  22.92 
 
 		 581 aa  50.8  0.00005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.649178  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4723  NHL repeat containing protein  25.08 
 
 		 1079 aa  50.4  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.645184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0355  NHL repeat-containing protein  23.85 
 
 		 1030 aa  49.3  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64892  normal  0.0641589 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0027  Fibronectin type III domain protein  26.87 
 
 		 460 aa  47.8  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0293  NHL repeat-containing protein  25.73 
 
 		 1163 aa  48.1  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.368653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1047  fibronectin type III domain-containing protein  22.22 
 
 		 903 aa  47.4  0.0004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  22.94 
 
 		 930 aa  47  0.0005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7086  serine/threonine protein kinase  27.24 
 
 		 732 aa  46.6  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1280  NHL repeat-containing protein  22.7 
 
 		 504 aa  47  0.0007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.164299  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2917  NHL repeat containing protein  28.67 
 
 		 623 aa  46.2  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.304592  normal  0.453442 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  25.36 
 
 		 1750 aa  46.2  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4004  ABC transporter related protein  25.45 
 
 		 639 aa  45.4  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.774502  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3865  NHL repeat-containing protein  26.97 
 
 		 1177 aa  44.3  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1718  NHL repeat-containing protein  25.78 
 
 		 487 aa  43.9  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0890  hypothetical protein  24.45 
 
 		 310 aa  43.5  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>