More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3721 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



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PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_3721  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 
196 aa  401  1e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0437946 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2558  TetR family transcriptional regulator  64.55 
 
 
190 aa  258  4e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5089  transcriptional regulator, TetR family  33.68 
 
 
198 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3038  transcriptional regulator, TetR family  39.66 
 
 
209 aa  129  3e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.051717 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0480  transcriptional regulator, TetR family  34.22 
 
 
205 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.318214 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1025  transcriptional regulator, TetR family  36.17 
 
 
192 aa  126  2.0000000000000002e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5102  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
203 aa  125  3e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0803  TetR family transcriptional regulator  35.42 
 
 
196 aa  124  1e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0127  transcriptional regulator, TetR family  32.81 
 
 
193 aa  123  2e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2215  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
215 aa  121  6e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1980  transcriptional regulator, TetR family  32.82 
 
 
206 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0770  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 
196 aa  116  3e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0187  TetR family transcriptional regulator  37.44 
 
 
202 aa  114  1.0000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.458714  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1967  TetR family transcriptional regulator  30.27 
 
 
202 aa  111  5e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25370  Transcriptional regulatory protein, TetR  35.63 
 
 
209 aa  105  5e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2754  regulatory protein, TetR  35.39 
 
 
219 aa  105  6e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.396057  normal  0.0231562 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0316  TetR family transcriptional regulator  35.19 
 
 
176 aa  103  1e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3409  TetR family transcriptional regulator  31.64 
 
 
212 aa  103  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4097  transcriptional regulator, TetR family  35.38 
 
 
194 aa  103  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3088  transcriptional regulator of TetR family protein  27.69 
 
 
198 aa  99.4  3e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.119848 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0208  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
191 aa  98.6  5e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0765  transcriptional regulator, TetR family protein  29.94 
 
 
222 aa  98.6  5e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0436  TetR/AcrR family transcriptional regulator  29.17 
 
 
193 aa  97.8  9e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00014648  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0809  transcriptional regulator, TetR family  32.42 
 
 
214 aa  97.4  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0251  TetR family transcriptional regulator  32.79 
 
 
212 aa  97.4  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.714148  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4743  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
212 aa  96.7  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1435  TetR family regulatory protein  33.15 
 
 
219 aa  95.9  3e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4102  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 
211 aa  95.5  4e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.680562  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5462  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 
212 aa  95.5  4e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5400  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 
212 aa  95.5  4e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00236367 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5288  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
186 aa  95.5  5e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3438  transcriptional regulator, TetR family  27.81 
 
 
190 aa  95.1  6e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.547681  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4870  TetR family transcriptional regulator  32.24 
 
 
186 aa  94  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.318456  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0083  TetR family transcriptional regulator  32.6 
 
 
219 aa  94.4  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.201393  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1527  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
212 aa  92.8  3e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0730  TetR family transcriptional regulator  30.22 
 
 
214 aa  91.7  6e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3357  TetR family transcriptional regulator  31.41 
 
 
211 aa  91.7  7e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0594456 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0064  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 
210 aa  90.9  1e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18450  transcriptional regulator, TetR family  31.98 
 
 
179 aa  89.4  3e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1603  transcriptional regulator, TetR family  30.22 
 
 
213 aa  89.4  3e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4476  TetR family transcriptional regulator  29.79 
 
 
220 aa  88.6  6e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000182515 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2645  TetR family transcriptional regulator  31.07 
 
 
194 aa  88.2  7e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.154552  normal  0.491764 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4778  transcriptional regulator, TetR family  32.49 
 
 
227 aa  88.2  7e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0545614  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2638  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 
210 aa  87  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2518  TetR family transcriptional regulator  31.69 
 
 
221 aa  85.9  4e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.382378  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3353  TetR family transcriptional regulator  31.64 
 
 
195 aa  85.5  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0335  transcriptional regulator, TetR family  35.88 
 
 
197 aa  85.5  4e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0635756  normal  0.0355079 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4681  transcriptional regulator  33.16 
 
 
196 aa  84.7  7e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1674  transcriptional regulator, TetR family  31.38 
 
 
204 aa  84.7  8e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4262  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 
226 aa  84.3  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0971  TetR family transcriptional regulator  31.93 
 
 
200 aa  84  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.325702 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53410  transcriptional regulator  32.62 
 
 
196 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.733487  normal  0.037637 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1689  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 
199 aa  83.2  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.403978 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1699  transcriptional regulator, TetR family  29.38 
 
 
205 aa  82.4  0.000000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.502572  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3643  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 
193 aa  82.4  0.000000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0256948 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4749  TetR family transcriptional regulator  25.93 
 
 
207 aa  79.7  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.590058  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02185  transcriptional regulator  27.53 
 
 
196 aa  80.1  0.00000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.69519  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6619  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
188 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.634361  normal  0.119433 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5772  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
188 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6137  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
188 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.8739 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2488  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 
201 aa  77.8  0.00000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0524247 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4360  regulatory protein TetR  30.11 
 
 
200 aa  77.4  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4501  putative transcriptional regulator, TetR family  28.34 
 
 
198 aa  77  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.749355 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3888  TetR family transcriptional regulator  28.81 
 
 
193 aa  77.4  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0944552  normal  0.0941974 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1209  TetR family transcriptional regulator  33.15 
 
 
193 aa  77.8  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0397499 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2304  transcriptional regulator, TetR family  32.11 
 
 
201 aa  75.9  0.0000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1940  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 
198 aa  75.9  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.688335  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7671  TetR family transcriptional regulator  29.61 
 
 
188 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.403599  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1763  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 
199 aa  75.1  0.0000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000139552  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1872  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 
199 aa  75.1  0.0000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0047199  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4056  TetR family transcriptional regulator  28.4 
 
 
193 aa  75.1  0.0000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2564  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 
199 aa  75.1  0.0000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000186036  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6901  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 
229 aa  74.7  0.0000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.165859 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5956  TetR family transcriptional regulator  29.78 
 
 
188 aa  74.7  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.341434  normal  0.49488 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4057  TetR family transcriptional regulator  29.78 
 
 
191 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2203  TetR family transcriptional regulator  30.68 
 
 
206 aa  73.9  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0627793  hitchhiker  0.000036044 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2332  transcriptional regulator, TetR family  24.12 
 
 
193 aa  73.9  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.950158  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5714  TetR family transcriptional regulator  29.78 
 
 
188 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.297365 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1088  transcriptional regulator, TetR family protein  25.79 
 
 
198 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5597  TetR family transcriptional regulator  27.85 
 
 
198 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.143469  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9334  putative transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 
193 aa  72  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.913929  normal  0.775461 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5016  transcriptional regulator, TetR family  29.21 
 
 
191 aa  72  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000793722  normal  0.491919 
 
 
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NC_008784  BMASAVP1_0527  TetR family transcriptional regulator  28.25 
 
 
200 aa  72  0.000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.474473  n/a   
 
 
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NC_008835  BMA10229_0121  TetR family transcriptional regulator  28.25 
 
 
200 aa  72  0.000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_004578  PSPTO_2969  hypothetical protein  31.25 
 
 
162 aa  71.6  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0448916  n/a   
 
 
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NC_006349  BMAA1408  TetR family transcriptional regulator  28.25 
 
 
200 aa  72  0.000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009078  BURPS1106A_A0974  TetR family transcriptional regulator  28.25 
 
 
200 aa  72  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.543907  n/a   
 
 
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NC_009075  BURPS668_A1058  TetR family transcriptional regulator  28.25 
 
 
200 aa  72  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009079  BMA10247_A1493  TetR family transcriptional regulator  28.25 
 
 
200 aa  72  0.000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_007435  BURPS1710b_A2293  TetR family transcriptional regulator  28.25 
 
 
247 aa  71.6  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.887651  n/a   
 
 
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NC_013132  Cpin_4897  transcriptional regulator, TetR family  24.06 
 
 
193 aa  71.2  0.000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.684326  normal  0.293164 
 
 
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NC_010087  Bmul_6065  TetR family transcriptional regulator  31.11 
 
 
188 aa  71.2  0.000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.340517  normal 
 
 
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NC_009921  Franean1_0479  TetR family transcriptional regulator  30.27 
 
 
207 aa  71.2  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_007511  Bcep18194_B0583  TetR family transcriptional regulator  27.87 
 
 
205 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_010184  BcerKBAB4_2392  TetR family transcriptional regulator  25.43 
 
 
198 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0101662  n/a   
 
 
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NC_009953  Sare_4813  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 
223 aa  70.9  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_013595  Sros_4260  putative transcriptional regulator, TetR family  31.01 
 
 
192 aa  70.5  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.370014  normal  0.537998 
 
 
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NC_011658  BCAH187_A3238  transcriptional regulator, TetR family  27.95 
 
 
198 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.210945  n/a   
 
 
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NC_007650  BTH_II1702  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 
311 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_007947  Mfla_2580  TetR family transcriptional regulator  29.52 
 
 
211 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.257801 
 
 
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