32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3664 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_3664  FixH family protein  100 
 
 		 169 aa  340  4e-93  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.604726 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0735  FixH  40.49 
 
 		 166 aa  121  4e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.530597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0464  FixH family protein  39.77 
 
 		 172 aa  115  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0404711  normal  0.285951 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0012  FixH  40 
 
 		 166 aa  114  6e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.747297  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0015  FixH family protein  38.96 
 
 		 166 aa  114  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7462  FixH family protein  39.61 
 
 		 166 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6712  FixH family protein  41.56 
 
 		 166 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0010  FixH  40.26 
 
 		 166 aa  110  8.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2796  nitrogen fixation protein fixH  40 
 
 		 148 aa  107  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0427033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1527  FixH family protein  35 
 
 		 171 aa  90.1  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3325  integral membrane protein linked to a cation pump-like  35.9 
 
 		 169 aa  79.7  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2573  integral membrane protein linked to a cation pump-like  36.81 
 
 		 156 aa  69.7  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.45803  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2442  FixH family protein  32.89 
 
 		 160 aa  69.3  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.212021  normal  0.504477 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1154  FixH family protein  35.51 
 
 		 156 aa  68.2  0.00000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0322721 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0539  FixH family protein  33.76 
 
 		 152 aa  67.8  0.00000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1671  integral membrane protein linked to a cation pump-like protein  32.91 
 
 		 156 aa  62.8  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.899771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2539  FixH  30.94 
 
 		 158 aa  60.8  0.000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0464  FixH family protein  27.39 
 
 		 165 aa  59.7  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.702406  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0358  FixH protein, putative  25.62 
 
 		 165 aa  59.7  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.255375  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2346  FixH family protein  34.29 
 
 		 152 aa  58.9  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.563717  normal  0.356506 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0374  putative FixH protein  25.62 
 
 		 165 aa  59.3  0.00000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.217912  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3852  FixH  33.57 
 
 		 157 aa  59.3  0.00000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1843  FixH family protein  34 
 
 		 154 aa  58.2  0.00000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.315454  normal  0.750998 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2351  hypothetical protein  26.14 
 
 		 168 aa  57.8  0.00000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000235101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0691  RdxH  33.57 
 
 		 152 aa  57.8  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.428147  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2391  nitrogen fixation protein FixH  27.27 
 
 		 164 aa  54.7  0.0000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0333218  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2995  hypothetical protein  27.61 
 
 		 273 aa  48.9  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1961  hypothetical protein  26.47 
 
 		 186 aa  48.1  0.00006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0666  nitrogen fixation protein fixH  29.63 
 
 		 155 aa  47.8  0.00007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0343  hypothetical protein  24.22 
 
 		 260 aa  43.5  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.011657 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5930  FixH family protein  27.07 
 
 		 167 aa  42  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.926776 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4957  FixH family protein  30.07 
 
 		 161 aa  42  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.144281  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>