34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3623 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_3623  NifQ family protein  100 
 
 
231 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.279264 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3988  NifQ family protein  48.37 
 
 
257 aa  169  5e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.152989  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3543  NifQ family protein  51.56 
 
 
217 aa  157  9e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.910171  normal  0.0106924 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5878  putative nitrogen fixation protein nifQ  47.03 
 
 
245 aa  157  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.103781  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4454  NifQ  41.88 
 
 
235 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5092  NifQ family protein  42.11 
 
 
236 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0978  NifQ  39.83 
 
 
236 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.789318  normal  0.328088 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1082  NifQ  40.17 
 
 
235 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1561  NifQ family protein  43.32 
 
 
205 aa  144  1e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2281  NifQ  37.5 
 
 
222 aa  132  5e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0482  NifQ family protein  48.7 
 
 
215 aa  130  2.0000000000000002e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0097  NifQ family protein  43.16 
 
 
222 aa  130  2.0000000000000002e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.428951  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0239  nitrogen fixation protein nifQ, putative  36.07 
 
 
197 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.305155  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2185  NifQ family protein  39.87 
 
 
179 aa  112  6e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.149657 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7734  NifQ family protein  36.36 
 
 
192 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0280  NifQ family protein  39.43 
 
 
197 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.239171  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1511  nitrogen fixation protein NifQ  32.06 
 
 
217 aa  108  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.203705  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1229  NifQ family protein  32.06 
 
 
217 aa  108  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.411993  hitchhiker  0.000327606 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0533  putative nitrogen fixation protein nifQ  39.87 
 
 
179 aa  107  1e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.057616  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2319  NifQ family protein  39.75 
 
 
200 aa  107  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00231718  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51040  Nitrogen fixation cofactor assembly protein  38.99 
 
 
195 aa  105  5e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0404512  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1476  putative nitrogen fixation-related protein(NifQ)  37.97 
 
 
192 aa  105  6e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000951053 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1209  NifQ family protein  38.51 
 
 
204 aa  104  1e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0325483 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1355  NifQ family protein  36.73 
 
 
224 aa  104  1e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1448  NifQ  45.28 
 
 
190 aa  101  8e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1254  NifQ family protein  44.34 
 
 
179 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.594431  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0514  NifQ family protein  39.63 
 
 
170 aa  96.3  4e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0315  NifU-like protein  28.18 
 
 
335 aa  94.4  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000902631  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4126  putative nitrogen fixation protein NifQ  29.55 
 
 
210 aa  70.1  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.850177  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7727  hypothetical protein  30.41 
 
 
199 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6662  NifQ family protein  32.65 
 
 
195 aa  57  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0612725  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6182  NifQ family protein  30.61 
 
 
195 aa  52.8  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.29812  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5817  hypothetical protein  30.61 
 
 
195 aa  52.8  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0755025  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6153  NifQ family protein  36.25 
 
 
202 aa  52  0.000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.439751  normal  0.16118 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>