21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3536 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_3536  hypothetical protein  100 
 
 
350 aa  694    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0317173 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3559  hypothetical protein  36.18 
 
 
343 aa  206  4e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1649  conserved hypothetical proteinn  32.79 
 
 
368 aa  149  7e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.179828  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3249  hypothetical protein  33.14 
 
 
365 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.106475 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4444  hypothetical protein  33.43 
 
 
374 aa  143  5e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1590  hypothetical protein  31.59 
 
 
366 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.625227  normal  0.0229246 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1869  hypothetical protein  31.42 
 
 
367 aa  139  6e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.274473  normal  0.277649 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2441  hypothetical protein  31.14 
 
 
368 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0948  hypothetical protein  28.83 
 
 
397 aa  86.3  7e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.754604  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1181  hypothetical protein  25.54 
 
 
394 aa  82.4  0.000000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0839  hypothetical protein  25.48 
 
 
397 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.268531 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4862  hypothetical protein  26.83 
 
 
395 aa  79.7  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0687822  normal  0.242066 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0672  hypothetical protein  24.73 
 
 
396 aa  79.3  0.00000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.745104  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0016  hypothetical protein  30.39 
 
 
354 aa  77.4  0.0000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.142957 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0581  hypothetical protein  25.98 
 
 
414 aa  74.3  0.000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5213  hypothetical protein  26.69 
 
 
397 aa  72.8  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3870  hypothetical protein  24.11 
 
 
338 aa  56.6  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.13922 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3577  hypothetical protein  26.06 
 
 
338 aa  55.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0395057 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2378  hypothetical protein  24.62 
 
 
336 aa  53.5  0.000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.268153 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2548  hypothetical protein  29.25 
 
 
337 aa  52.8  0.000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4032  hypothetical protein  28.57 
 
 
335 aa  44.7  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>