91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3391 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_3391  Naringenin-chalcone synthase  100 
 
 
360 aa  726    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4712  naringenin-chalcone synthase  56.62 
 
 
357 aa  427  1e-118  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1186  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  47.99 
 
 
376 aa  283  4.0000000000000003e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.857577  normal  0.766945 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2532  chalcone and stilbene synthase domain protein  37.7 
 
 
404 aa  240  4e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.197428 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2037  Naringenin-chalcone synthase  38.52 
 
 
656 aa  218  2e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.629301  normal  0.879643 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04550  predicted naringenin-chalcone synthase  36.53 
 
 
382 aa  210  3e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3794  naringenin-chalcone synthase  36.16 
 
 
362 aa  208  9e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.21941 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2809  Naringenin-chalcone synthase  41.16 
 
 
413 aa  207  2e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.402092 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0256  naringenin-chalcone synthase  37.85 
 
 
362 aa  207  2e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.524336  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1339  naringenin-chalcone synthase  40.49 
 
 
363 aa  207  2e-52  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.538359  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0421  chalcone synthase  36.61 
 
 
362 aa  204  2e-51  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.299605 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18741  chalcone synthase (CHS)  38.78 
 
 
364 aa  203  5e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.406295 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1939  Naringenin-chalcone synthase  37.63 
 
 
399 aa  191  2e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000153142 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2198  naringenin-chalcone synthase  42.27 
 
 
404 aa  191  2e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.109224  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0466  chalcone and stilbene synthase domain protein  33.7 
 
 
373 aa  186  7e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18900  predicted naringenin-chalcone synthase  41.22 
 
 
396 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0312297  normal  0.351534 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11401  hypothetical protein  34.25 
 
 
393 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4396  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  33.71 
 
 
368 aa  162  7e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0145  chalcone and stilbene synthase domain-containing protein  37.32 
 
 
343 aa  156  4e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.842427 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4821  chalcone and stilbene synthase domain protein  37.55 
 
 
344 aa  152  7e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20410  predicted naringenin-chalcone synthase  36.17 
 
 
351 aa  145  7.0000000000000006e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.194613  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0398  3-Oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III domain protein  36.16 
 
 
350 aa  143  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.18522 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0430  chalcone and stilbene synthase domain protein  36.4 
 
 
350 aa  142  8e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.361368 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2326  chalcone and stilbene synthase domain protein  34.49 
 
 
393 aa  139  6e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.190568  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0021  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  34.14 
 
 
354 aa  132  1.0000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10908  naringenin-chalcone synthase  26.65 
 
 
359 aa  129  1.0000000000000001e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.559133  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0202  putative Type III polyketide synthase  29.2 
 
 
350 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1642  chalcone and stilbene synthase domain protein  26.72 
 
 
350 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00774069 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4264  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  34.67 
 
 
368 aa  127  4.0000000000000003e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.188151 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1028  3-Oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III domain protein  29.56 
 
 
349 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4185  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  34.75 
 
 
355 aa  127  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0192422  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3187  chalcone and stilbene synthase domain protein  26.67 
 
 
350 aa  126  6e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.397507  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4105  chalcone and stilbene synthases-like  30.11 
 
 
394 aa  125  1e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.137291  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3808  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  26.05 
 
 
350 aa  124  2e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0415  3-Oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III domain protein  35.58 
 
 
378 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.944882  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4694  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  36.13 
 
 
349 aa  125  2e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.831372  normal  0.253615 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2112  3-Oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III domain protein  35.96 
 
 
361 aa  123  6e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.454766  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5033  chalcone and stilbene synthase domain protein  25.96 
 
 
350 aa  122  7e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.952361  normal  0.260327 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0416  chalcone and stilbene synthase domain protein  35.29 
 
 
378 aa  122  8e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3232  chalcone and stilbene synthase domain protein  29.09 
 
 
363 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0387  chalcone/stilbene synthase-like  34.65 
 
 
369 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.363189  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3105  chalcone and stilbene synthases-like  32.23 
 
 
349 aa  114  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1903  chalcone and stilbene synthase domain-containing protein  28.88 
 
 
350 aa  114  3e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000467282 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1086  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  30.86 
 
 
350 aa  113  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0962351  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1075  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  31.25 
 
 
350 aa  112  9e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.127153 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1059  chalcone and stilbene synthases-like protein  31.25 
 
 
350 aa  112  9e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1684  chalcone and stilbene synthases-like protein  34.92 
 
 
378 aa  107  2e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.436758  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2390  chalcone and stilbene synthase domain protein  29.57 
 
 
355 aa  107  3e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2367  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  28.91 
 
 
366 aa  107  4e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.980596  normal  0.560252 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2375  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  28.91 
 
 
306 aa  106  7e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2328  chalcone and stilbene synthases-like protein  28.91 
 
 
306 aa  106  7e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.579896  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2676  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  31.23 
 
 
354 aa  106  8e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2602  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  26.92 
 
 
354 aa  104  2e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2104  chalcone and stilbene synthase domain protein  25.27 
 
 
361 aa  102  9e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.935518  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1888  chalcone and stilbene synthase domain protein  28.78 
 
 
370 aa  100  4e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.361608  normal  0.338174 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1160  chalcone and stilbene synthase domain protein  34.38 
 
 
359 aa  100  4e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.640364  hitchhiker  0.0041842 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1868  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  29.67 
 
 
349 aa  100  5e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11683  chalcone synthase pks11  29.53 
 
 
353 aa  100  6e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.133328  normal  0.163848 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5115  chalcone and stilbene synthase domain protein  30.21 
 
 
364 aa  99.8  6e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5652  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  29.21 
 
 
352 aa  99.8  7e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3991  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  25.14 
 
 
357 aa  99  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.222559  normal  0.414224 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0226  naringenin-chalcone synthase  29.4 
 
 
349 aa  97.8  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.239873  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3635  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  30.51 
 
 
344 aa  98.2  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.525409  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1740  chalcone and stilbene synthase domain protein  29.73 
 
 
377 aa  98.2  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.828638 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5140  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  29.6 
 
 
360 aa  97.4  3e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.734202  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1084  chalcone and stilbene synthases-like protein  29.75 
 
 
347 aa  94.7  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11678  chalcone synthase pks10  31.13 
 
 
353 aa  94  3e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000441245  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5949  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  27.95 
 
 
352 aa  92.4  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.207884  normal  0.0327105 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3899  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  30.37 
 
 
406 aa  92  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.824254  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29530  Type III polyketide synthase  33.98 
 
 
409 aa  91.7  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29550  Type III polyketide synthase  31.68 
 
 
406 aa  90.5  4e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.96869  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2733  3-Oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III domain protein  27.86 
 
 
373 aa  88.6  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3897  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  29.26 
 
 
406 aa  84.7  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00500  predicted naringenin-chalcone synthase  26.72 
 
 
373 aa  84.7  0.000000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.281948  normal  0.904387 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1196  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  29.48 
 
 
357 aa  84  0.000000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1949  chalcone and stilbene synthase domain-containing protein  28.29 
 
 
350 aa  81.6  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.164394 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2458  chalcone and stilbene synthases-like  28.02 
 
 
366 aa  76.6  0.0000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00155051  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4977  chalcone and stilbene synthase domain protein  27.34 
 
 
365 aa  71.6  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.110388  normal  0.0854213 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1099  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  22.06 
 
 
417 aa  61.2  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1470  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  26.58 
 
 
380 aa  49.3  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0237  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  28.42 
 
 
328 aa  47.8  0.0003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.524505  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1974  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  28.46 
 
 
317 aa  47.4  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.568575  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1699  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  28.17 
 
 
334 aa  46.6  0.0008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.969415  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2987  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  26.14 
 
 
342 aa  45.8  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00208212  normal  0.0221839 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2370  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  27.55 
 
 
318 aa  45.8  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.196696  normal  0.0307335 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3101  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  32.43 
 
 
330 aa  45.4  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0148941 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1630  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  24.18 
 
 
321 aa  45.4  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.380869  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0344  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  24.44 
 
 
323 aa  44.7  0.003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0355945  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2950  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  27.2 
 
 
318 aa  43.1  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.142707  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1192  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  22.26 
 
 
324 aa  42.7  0.009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1613  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  25.44 
 
 
328 aa  42.7  0.01  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00239827  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>