76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3384 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_3384  hypothetical protein  100 
 
 		 266 aa  520  1e-147  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.739679 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0159  hypothetical protein  44.87 
 
 		 255 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.673519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3846  hypothetical protein  47.26 
 
 		 253 aa  158  9e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2311  hypothetical protein  45.73 
 
 		 254 aa  143  3e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.148749  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5833  hypothetical protein  45.29 
 
 		 235 aa  142  7e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4137  hypothetical protein  36.15 
 
 		 315 aa  125  8.000000000000001e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0485856  normal  0.510961 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3889  hypothetical protein  38.1 
 
 		 239 aa  124  1e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.31119  normal  0.156158 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6358  hypothetical protein  37.45 
 
 		 328 aa  122  9e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0093  hypothetical protein  36.7 
 
 		 316 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.152001  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5241  membrane protein-like protein  32.43 
 
 		 300 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0567111  normal  0.512081 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2987  hypothetical protein  34.77 
 
 		 298 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.101551  normal  0.0487928 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2351  hypothetical protein  36.74 
 
 		 317 aa  112  9e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.50053  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0701  hypothetical protein  36.36 
 
 		 318 aa  105  7e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0170  hypothetical protein  35.45 
 
 		 332 aa  97.8  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4795  hypothetical protein  33.86 
 
 		 322 aa  95.9  7e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.36342 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1445  hypothetical protein  34.07 
 
 		 300 aa  94.7  1e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0680793  normal  0.372569 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3554  membrane protein-like protein  30.64 
 
 		 264 aa  83.2  0.000000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.149309 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0108  membrane protein-like protein  30.73 
 
 		 270 aa  82.4  0.000000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4602  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  28.7 
 
 		 309 aa  80.5  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2267  membrane protein-like protein  29.91 
 
 		 265 aa  75.9  0.0000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0855  hypothetical protein  34.64 
 
 		 214 aa  65.1  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2514  hypothetical protein  35.03 
 
 		 214 aa  64.7  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3120  hypothetical protein  33.33 
 
 		 209 aa  63.2  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136448 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0583  membrane protein  29.76 
 
 		 275 aa  61.6  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.7411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2269  membrane protein-like protein  31.22 
 
 		 271 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.761855  hitchhiker  0.00192882 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4758  hypothetical protein  31.65 
 
 		 196 aa  59.7  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.343516  normal  0.0425976 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01478  membrane protein-like protein  26.69 
 
 		 267 aa  56.2  0.0000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2794  hypothetical protein  33.59 
 
 		 195 aa  52.8  0.000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.132736  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2068  membrane protein-like protein  28.11 
 
 		 273 aa  52  0.000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.334225 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5775  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  29.3 
 
 		 283 aa  51.6  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.722612  normal  0.272447 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11200  membrane-like protein  33.83 
 
 		 273 aa  51.6  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00435487  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19110  predicted membrane protein  27.8 
 
 		 752 aa  51.6  0.00001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00604286  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0855  putative inner membrane protein  26.39 
 
 		 296 aa  50.8  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3278  membrane protein  22.94 
 
 		 280 aa  51.2  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6178  copper resistance D domain-containing protein  25.94 
 
 		 691 aa  49.3  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1675  hypothetical protein  26.83 
 
 		 310 aa  49.3  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.247062 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1238  putative inner membrane protein  26.49 
 
 		 294 aa  49.3  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1898  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  28.23 
 
 		 290 aa  48.9  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.903451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0172  copper resistance D domain-containing protein  28.26 
 
 		 651 aa  48.5  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1122  copper resistance D domain protein  27.11 
 
 		 687 aa  48.1  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1749  hypothetical protein  26.39 
 
 		 290 aa  48.5  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.185499  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2884  putative inner membrane protein  26.49 
 
 		 289 aa  48.9  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.712749  normal  0.419558 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2875  hypothetical protein  26.39 
 
 		 290 aa  47.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.922757  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2447  hypothetical protein  26.39 
 
 		 290 aa  47.8  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2834  hypothetical protein  26.39 
 
 		 290 aa  47.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.395343  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2760  hypothetical protein  26.39 
 
 		 290 aa  47.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2819  hypothetical protein  26.39 
 
 		 290 aa  47.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.286067  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2151  membrane protein  28.32 
 
 		 289 aa  47.4  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.240263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1770  hypothetical protein  26.39 
 
 		 290 aa  47.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.440063  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0562  hypothetical protein  26.39 
 
 		 266 aa  47.8  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.522678  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0988  cytochrome c oxidase assembly factor CtaG  25.91 
 
 		 300 aa  47.4  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4266  membrane protein  28.32 
 
 		 289 aa  47  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.991106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5346  hypothetical protein  27.35 
 
 		 331 aa  47  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1154  membrane protein  28.32 
 
 		 289 aa  47  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0675  membrane protein  28.32 
 
 		 289 aa  47  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1032  membrane protein  28.32 
 
 		 290 aa  46.6  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1130  membrane protein  28.32 
 
 		 289 aa  46.6  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.581641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5665  hypothetical protein  27.35 
 
 		 331 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1036  membrane protein  28.32 
 
 		 290 aa  46.6  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.675997  normal  0.424179 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3709  hypothetical protein  27.35 
 
 		 326 aa  45.8  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1473  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain- containing protein  25.55 
 
 		 327 aa  45.1  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2813  hypothetical protein  26.91 
 
 		 331 aa  45.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5381  hypothetical protein  26.91 
 
 		 308 aa  44.3  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0963  hypothetical protein  36.73 
 
 		 692 aa  44.3  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0463859  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3955  copper resistance D domain protein  26.74 
 
 		 722 aa  44.3  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.58708  normal  0.101965 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3220  copper resistance D domain protein  29.83 
 
 		 711 aa  44.3  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4275  copper resistance D domain protein  28.14 
 
 		 671 aa  43.9  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.978208  normal  0.70457 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2642  cytochrome c oxidase caa3 type assembly factor CtaG  25.1 
 
 		 301 aa  43.5  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3622  copper resistance D domain-containing protein  28.08 
 
 		 665 aa  43.9  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3690  copper resistance D domain-containing protein  28.08 
 
 		 665 aa  43.9  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3617  copper resistance D  28.08 
 
 		 665 aa  43.9  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1859  cytochrome c oxidase assembly factor CtaG  24.88 
 
 		 300 aa  43.1  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2572  membrane protein-like protein  27.63 
 
 		 678 aa  43.5  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1809  copper resistance D domain protein  37.74 
 
 		 686 aa  42.7  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00146135  normal  0.0268044 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0625  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  37.66 
 
 		 731 aa  42.7  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0427977  normal  0.664507 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2471  copper resistance D domain-containing protein  26.88 
 
 		 719 aa  42.4  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.812246  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>