More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3206 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_3206  UspA domain protein  100 
 
 		 151 aa  304  4.0000000000000004e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.158502 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2524  UspA domain-containing protein  46.5 
 
 		 149 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4660  putative universal stress protein (Usp)  46.21 
 
 		 144 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.969367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2230  UspA domain-containing protein  49.66 
 
 		 171 aa  129  2.0000000000000002e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0395018 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2637  hypothetical protein  48.97 
 
 		 144 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.163827  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1587  universal stress protein  44.14 
 
 		 144 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.240234  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2089  universal stress protein  44.14 
 
 		 144 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000150804  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2614  universal stress protein family protein  44.14 
 
 		 144 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.586253  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5358  universal stress protein  44.83 
 
 		 144 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.974267  normal  0.233102 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3223  universal stress protein  44.14 
 
 		 144 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1362  universal stress family protein  44.14 
 
 		 144 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2471  universal stress family protein  44.14 
 
 		 144 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2525  universal stress family protein  44.14 
 
 		 144 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245766  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2081  UspA domain-containing protein  44.83 
 
 		 144 aa  124  5e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1951  UspA domain-containing protein  44.83 
 
 		 144 aa  124  5e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.348575 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1997  universal stress protein  43.45 
 
 		 144 aa  122  1e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0827286  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1228  UspA domain-containing protein  44.14 
 
 		 144 aa  121  3e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.156365 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1284  UspA domain protein  43.54 
 
 		 147 aa  119  9.999999999999999e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3338  UspA domain-containing protein  44.14 
 
 		 144 aa  116  9.999999999999999e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1369  UspA domain-containing protein  40 
 
 		 144 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.981582 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2068  UspA domain-containing protein  46.21 
 
 		 144 aa  113  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.960208  normal  0.914393 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6028  hypothetical protein  46.21 
 
 		 144 aa  113  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.999121  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2049  UspA domain-containing protein  46.21 
 
 		 144 aa  113  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.765605  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1016  UspA domain-containing protein  46.26 
 
 		 149 aa  113  8.999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.597353  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1954  hypothetical protein  42.86 
 
 		 144 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0267  universal stress protein  40 
 
 		 145 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.793437  normal  0.0161119 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0991  hypothetical protein  40.14 
 
 		 147 aa  111  3e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4983  hypothetical protein  39.86 
 
 		 145 aa  110  5e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2059  UspA domain protein  44.83 
 
 		 156 aa  110  9e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.3944  hitchhiker  0.00218931 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1359  hypothetical protein  41.22 
 
 		 168 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4074  hypothetical protein  43.06 
 
 		 145 aa  109  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1650  universal stress protein  39.31 
 
 		 144 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.629264  normal  0.0236614 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1821  UspA domain-containing protein  41.1 
 
 		 147 aa  107  5e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1387  hypothetical protein  41.5 
 
 		 144 aa  107  7.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00373989  normal  0.527764 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2487  UspA domain protein  38.62 
 
 		 144 aa  106  9.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0465125  hitchhiker  0.000264577 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1299  UspA domain protein  40.14 
 
 		 144 aa  104  3e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0196706  normal  0.273134 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1233  UspA domain protein  40.14 
 
 		 144 aa  104  3e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.997743  normal  0.558302 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1519  UspA domain-containing protein  44.44 
 
 		 148 aa  104  5e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0716802  normal  0.348047 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3943  UspA domain protein  40.94 
 
 		 148 aa  103  9e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1173  UspA domain-containing protein  43.79 
 
 		 147 aa  100  7e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.761945  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2815  UspA domain protein  42.18 
 
 		 147 aa  100  7e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0183337  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1892  universal stress protein  44.9 
 
 		 149 aa  99.8  1e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0327911  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1966  universal stress protein  44.9 
 
 		 149 aa  99.8  1e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3875  hypothetical protein  44.52 
 
 		 146 aa  98.6  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3980  universal stress protein  44.97 
 
 		 149 aa  98.6  3e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0788  UspA domain-containing protein  39.86 
 
 		 147 aa  96.7  1e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.523142 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2772  UspA domain-containing protein  43.71 
 
 		 147 aa  95.5  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4260  UspA domain protein  37.16 
 
 		 148 aa  94.7  4e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.290835  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0997  UspA domain protein  43.51 
 
 		 147 aa  94  6e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1081  UspA domain-containing protein  43.51 
 
 		 147 aa  94  6e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0952859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1112  hypothetical protein  38.78 
 
 		 144 aa  94  7e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.619921  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4356  UspA domain-containing protein  39.31 
 
 		 145 aa  92.4  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.244024  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1055  universal stress protein  37.84 
 
 		 148 aa  91.3  4e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0994  universal stress protein  37.84 
 
 		 148 aa  91.3  4e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2683  universal stress protein UspA  42.47 
 
 		 148 aa  90.5  7e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.420949 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0118  UspA domain-containing protein  38.96 
 
 		 144 aa  90.1  9e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.385941 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1926  hypothetical protein  38.1 
 
 		 147 aa  89  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1272  UspA domain-containing protein  37.24 
 
 		 145 aa  88.6  3e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3459  hypothetical protein  35.86 
 
 		 145 aa  86.3  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.450632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  37.16 
 
 		 155 aa  83.2  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4213  UspA domain protein  32.88 
 
 		 146 aa  82.8  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.501381  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4323  UspA domain protein  32.88 
 
 		 146 aa  82.8  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.729204  normal  0.0224521 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4308  hypothetical protein  36.05 
 
 		 147 aa  82.4  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00896563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0624  UspA domain-containing protein  37.93 
 
 		 139 aa  82.8  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2198  hypothetical protein  36.55 
 
 		 145 aa  82  0.000000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.76051  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2306  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 155 aa  80.9  0.000000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05426  hypothetical protein  31.51 
 
 		 146 aa  80.5  0.000000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0228  UspA domain protein  41.18 
 
 		 144 aa  80.5  0.000000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.115538 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0804  UspA domain protein  39.16 
 
 		 138 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.380791 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1929  UspA domain-containing protein  41.78 
 
 		 146 aa  80.1  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1732  UspA domain protein  41.78 
 
 		 146 aa  80.1  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1309  UspA domain protein  34.01 
 
 		 153 aa  79.7  0.00000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.678787 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1676  hypothetical protein  37.67 
 
 		 143 aa  79.7  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.631803 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  37.93 
 
 		 143 aa  78.6  0.00000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4298  hypothetical protein  30.72 
 
 		 155 aa  77  0.00000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  35.71 
 
 		 164 aa  77  0.00000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  34.69 
 
 		 156 aa  76.6  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2088  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 153 aa  75.5  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0358891 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1311  UspA domain protein  34 
 
 		 187 aa  75.9  0.0000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.519886  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1352  UspA domain protein  34.48 
 
 		 146 aa  75.1  0.0000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.012903 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  33.79 
 
 		 128 aa  74.7  0.0000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1541  hypothetical protein  34.27 
 
 		 181 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3154  UspA domain-containing protein  37.12 
 
 		 145 aa  73.9  0.0000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.759591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1627  UspA domain-containing protein  34.29 
 
 		 274 aa  73.9  0.0000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1334  hypothetical protein  32.67 
 
 		 154 aa  73.9  0.0000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0586772  normal  0.952223 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0463  UspA domain-containing protein  32.41 
 
 		 146 aa  73.9  0.0000000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3096  UspA domain protein  30.61 
 
 		 207 aa  73.6  0.0000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0644  UspA domain-containing protein  34.48 
 
 		 145 aa  72.4  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.577691 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3176  UspA domain protein  34.93 
 
 		 291 aa  71.6  0.000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  33.78 
 
 		 152 aa  72  0.000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2886  UspA domain-containing protein  36.73 
 
 		 148 aa  71.6  0.000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0844522  normal  0.787665 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  35.14 
 
 		 150 aa  71.2  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01350  universal stress protein  34.46 
 
 		 276 aa  71.2  0.000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0914  UspA domain protein  32.19 
 
 		 154 aa  71.2  0.000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.446701 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  36.11 
 
 		 150 aa  71.2  0.000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0570  UspA domain protein  35.66 
 
 		 141 aa  70.9  0.000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.932953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6968  UspA domain protein  36.11 
 
 		 147 aa  71.2  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483791  normal  0.0402006 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  37.41 
 
 		 305 aa  70.5  0.000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  34.93 
 
 		 307 aa  70.5  0.000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0704  hypothetical protein  34.67 
 
 		 148 aa  70.5  0.000000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>